MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p3

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021988	AGCA	2	8	58	65	50 %	0 %	25 %	25 %	529230035
2	NC_021988	AATG	2	8	69	76	50 %	25 %	25 %	0 %	529230035
3	NC_021988	CTTT	2	8	757	764	0 %	75 %	0 %	25 %	529230035
4	NC_021988	AACG	2	8	823	830	50 %	0 %	25 %	25 %	529230035
5	NC_021988	TTCA	2	8	973	980	25 %	50 %	0 %	25 %	529230035
6	NC_021988	TTGT	2	8	1775	1782	0 %	75 %	25 %	0 %	529230036
7	NC_021988	TTTA	2	8	1862	1869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021988	AAAT	2	8	2109	2116	75 %	25 %	0 %	0 %	529230037
9	NC_021988	TCTT	2	8	2432	2439	0 %	75 %	0 %	25 %	529230037
10	NC_021988	CTTT	2	8	2591	2598	0 %	75 %	0 %	25 %	529230037
11	NC_021988	CTTG	2	8	2698	2705	0 %	50 %	25 %	25 %	529230037
12	NC_021988	GATT	2	8	2772	2779	25 %	50 %	25 %	0 %	529230037
13	NC_021988	ACTC	2	8	2844	2851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021988	GAAA	2	8	3080	3087	75 %	0 %	25 %	0 %	529230038
15	NC_021988	TTTG	2	8	3474	3481	0 %	75 %	25 %	0 %	529230038
16	NC_021988	GTAT	2	8	3510	3517	25 %	50 %	25 %	0 %	529230038
17	NC_021988	AAGC	2	8	3755	3762	50 %	0 %	25 %	25 %	529230038
18	NC_021988	AAAC	2	8	3813	3820	75 %	0 %	0 %	25 %	529230038
19	NC_021988	ATAA	2	8	3866	3873	75 %	25 %	0 %	0 %	529230038
20	NC_021988	ATTG	2	8	4123	4130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021988	AAAT	2	8	4266	4273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021988	TTGA	2	8	5031	5038	25 %	50 %	25 %	0 %	529230041
23	NC_021988	TTTA	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021988	AGTA	2	8	5287	5294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021988	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021988	GTGA	2	8	5504	5511	25 %	25 %	50 %	0 %	529230042
27	NC_021988	TAAA	2	8	5840	5847	75 %	25 %	0 %	0 %	529230043
28	NC_021988	ACAA	2	8	6039	6046	75 %	0 %	0 %	25 %	529230044
29	NC_021988	ATGT	2	8	6434	6441	25 %	50 %	25 %	0 %	529230044
30	NC_021988	GAAA	2	8	6721	6728	75 %	0 %	25 %	0 %	529230044
31	NC_021988	TAAA	2	8	6768	6775	75 %	25 %	0 %	0 %	529230044
32	NC_021988	AATT	2	8	7039	7046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021988	AGAT	2	8	7507	7514	50 %	25 %	25 %	0 %	529230046
34	NC_021988	TGTT	2	8	7600	7607	0 %	75 %	25 %	0 %	529230046
35	NC_021988	TTTG	2	8	7930	7937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021988	TATT	2	8	7999	8006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021988	ACTT	2	8	8810	8817	25 %	50 %	0 %	25 %	529230047
38	NC_021988	AGTA	2	8	8982	8989	50 %	25 %	25 %	0 %	529230047
39	NC_021988	CTCA	2	8	9146	9153	25 %	25 %	0 %	50 %	529230047
40	NC_021988	TTCC	2	8	9214	9221	0 %	50 %	0 %	50 %	529230047
41	NC_021988	TTCC	2	8	9346	9353	0 %	50 %	0 %	50 %	529230047
42	NC_021988	TTCC	2	8	9429	9436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021988	TAAT	2	8	10062	10069	50 %	50 %	0 %	0 %	529230048
44	NC_021988	TTAC	2	8	10398	10405	25 %	50 %	0 %	25 %	529230048
45	NC_021988	ATCC	2	8	11253	11260	25 %	25 %	0 %	50 %	529230050
46	NC_021988	AAAG	2	8	11908	11915	75 %	0 %	25 %	0 %	529230050
47	NC_021988	CCAT	2	8	12551	12558	25 %	25 %	0 %	50 %	529230051
48	NC_021988	CCAG	2	8	12636	12643	25 %	0 %	25 %	50 %	529230051
49	NC_021988	GCGA	2	8	12652	12659	25 %	0 %	50 %	25 %	529230051
50	NC_021988	TTTC	2	8	12706	12713	0 %	75 %	0 %	25 %	529230051
51	NC_021988	TTAT	2	8	12739	12746	25 %	75 %	0 %	0 %	529230052
52	NC_021988	CTTT	2	8	12896	12903	0 %	75 %	0 %	25 %	529230052
53	NC_021988	CTGC	2	8	13094	13101	0 %	25 %	25 %	50 %	529230052
54	NC_021988	TAAC	2	8	13301	13308	50 %	25 %	0 %	25 %	529230052
55	NC_021988	TACC	2	8	13556	13563	25 %	25 %	0 %	50 %	529230052
56	NC_021988	AAAT	2	8	13618	13625	75 %	25 %	0 %	0 %	529230053
57	NC_021988	TCAA	2	8	14080	14087	50 %	25 %	0 %	25 %	529230054
58	NC_021988	GAGG	2	8	14115	14122	25 %	0 %	75 %	0 %	529230054
59	NC_021988	ATTG	2	8	14781	14788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021988	GAAT	2	8	15296	15303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021988	ATAA	2	8	15870	15877	75 %	25 %	0 %	0 %	529230056
62	NC_021988	AATT	2	8	16234	16241	50 %	50 %	0 %	0 %	529230056
63	NC_021988	CTTT	2	8	16505	16512	0 %	75 %	0 %	25 %	529230057
64	NC_021988	AGAT	2	8	16629	16636	50 %	25 %	25 %	0 %	529230057
65	NC_021988	GATA	2	8	17238	17245	50 %	25 %	25 %	0 %	529230057
66	NC_021988	TATC	2	8	17708	17715	25 %	50 %	0 %	25 %	529230057
67	NC_021988	CTTC	2	8	17749	17756	0 %	50 %	0 %	50 %	529230057
68	NC_021988	ATTA	2	8	17851	17858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021988	ATGA	2	8	17895	17902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021988	CTTT	2	8	17934	17941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021988	TAAA	2	8	18676	18683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021988	TCAA	2	8	18893	18900	50 %	25 %	0 %	25 %	529230059
73	NC_021988	AGAA	2	8	20246	20253	75 %	0 %	25 %	0 %	529230060
74	NC_021988	ATCA	2	8	20459	20466	50 %	25 %	0 %	25 %	529230060
75	NC_021988	TTTC	2	8	20620	20627	0 %	75 %	0 %	25 %	529230060
76	NC_021988	TTCT	2	8	20639	20646	0 %	75 %	0 %	25 %	529230060
77	NC_021988	TTTC	2	8	20948	20955	0 %	75 %	0 %	25 %	529230061
78	NC_021988	TTTA	2	8	21744	21751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021988	TAAA	2	8	21841	21848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021988	AAAT	2	8	22089	22096	75 %	25 %	0 %	0 %	529230063
81	NC_021988	ATTT	2	8	22412	22419	25 %	75 %	0 %	0 %	529230064
82	NC_021988	AAAG	2	8	22552	22559	75 %	0 %	25 %	0 %	529230064
83	NC_021988	ATCT	2	8	22695	22702	25 %	50 %	0 %	25 %	529230064
84	NC_021988	GTCA	2	8	23247	23254	25 %	25 %	25 %	25 %	529230065
85	NC_021988	TTTC	2	8	23345	23352	0 %	75 %	0 %	25 %	529230065
86	NC_021988	ACTT	2	8	23423	23430	25 %	50 %	0 %	25 %	529230065
87	NC_021988	AGAA	2	8	23809	23816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021988	TTGA	2	8	24384	24391	25 %	50 %	25 %	0 %	529230066
89	NC_021988	TTTA	2	8	24601	24608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021988	AAAT	2	8	24873	24880	75 %	25 %	0 %	0 %	529230067
91	NC_021988	CTGA	2	8	25277	25284	25 %	25 %	25 %	25 %	529230067
92	NC_021988	AAGA	2	8	25789	25796	75 %	0 %	25 %	0 %	529230068
93	NC_021988	ATAA	2	8	26247	26254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021988	ACCA	2	8	26876	26883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021988	AACC	2	8	27183	27190	50 %	0 %	0 %	50 %	529230071
96	NC_021988	TCTT	2	8	27884	27891	0 %	75 %	0 %	25 %	529230071
97	NC_021988	TGAT	2	8	27898	27905	25 %	50 %	25 %	0 %	529230071
98	NC_021988	TGAA	2	8	28109	28116	50 %	25 %	25 %	0 %	529230072
99	NC_021988	CAGT	2	8	28775	28782	25 %	25 %	25 %	25 %	529230074
100	NC_021988	AGTA	2	8	29076	29083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021988	TACT	2	8	29111	29118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021988	CATA	2	8	29210	29217	50 %	25 %	0 %	25 %	529230075
103	NC_021988	TCTT	2	8	29286	29293	0 %	75 %	0 %	25 %	529230075
104	NC_021988	TTCT	2	8	29508	29515	0 %	75 %	0 %	25 %	529230076
105	NC_021988	TTCC	2	8	29799	29806	0 %	50 %	0 %	50 %	529230076
106	NC_021988	AGCC	2	8	30021	30028	25 %	0 %	25 %	50 %	529230076
107	NC_021988	ACTT	2	8	30046	30053	25 %	50 %	0 %	25 %	529230076
108	NC_021988	GATC	2	8	30101	30108	25 %	25 %	25 %	25 %	529230076
109	NC_021988	TTTA	2	8	30820	30827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021988	TTTG	2	8	30909	30916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021988	TACA	2	8	30980	30987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.