MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p3

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021988	AGCA	2	8	58	65	50 %	0 %	25 %	25 %	529230035
2	NC_021988	AATG	2	8	69	76	50 %	25 %	25 %	0 %	529230035
3	NC_021988	CTTT	2	8	757	764	0 %	75 %	0 %	25 %	529230035
4	NC_021988	AACG	2	8	823	830	50 %	0 %	25 %	25 %	529230035
5	NC_021988	TTCA	2	8	973	980	25 %	50 %	0 %	25 %	529230035
6	NC_021988	TTGT	2	8	1775	1782	0 %	75 %	25 %	0 %	529230036
7	NC_021988	AAAT	2	8	2109	2116	75 %	25 %	0 %	0 %	529230037
8	NC_021988	TCTT	2	8	2432	2439	0 %	75 %	0 %	25 %	529230037
9	NC_021988	CTTT	2	8	2591	2598	0 %	75 %	0 %	25 %	529230037
10	NC_021988	CTTG	2	8	2698	2705	0 %	50 %	25 %	25 %	529230037
11	NC_021988	GATT	2	8	2772	2779	25 %	50 %	25 %	0 %	529230037
12	NC_021988	GAAA	2	8	3080	3087	75 %	0 %	25 %	0 %	529230038
13	NC_021988	TTTG	2	8	3474	3481	0 %	75 %	25 %	0 %	529230038
14	NC_021988	GTAT	2	8	3510	3517	25 %	50 %	25 %	0 %	529230038
15	NC_021988	AAGC	2	8	3755	3762	50 %	0 %	25 %	25 %	529230038
16	NC_021988	AAAC	2	8	3813	3820	75 %	0 %	0 %	25 %	529230038
17	NC_021988	ATAA	2	8	3866	3873	75 %	25 %	0 %	0 %	529230038
18	NC_021988	TTGA	2	8	5031	5038	25 %	50 %	25 %	0 %	529230041
19	NC_021988	GTGA	2	8	5504	5511	25 %	25 %	50 %	0 %	529230042
20	NC_021988	TAAA	2	8	5840	5847	75 %	25 %	0 %	0 %	529230043
21	NC_021988	ACAA	2	8	6039	6046	75 %	0 %	0 %	25 %	529230044
22	NC_021988	ATGT	2	8	6434	6441	25 %	50 %	25 %	0 %	529230044
23	NC_021988	GAAA	2	8	6721	6728	75 %	0 %	25 %	0 %	529230044
24	NC_021988	TAAA	2	8	6768	6775	75 %	25 %	0 %	0 %	529230044
25	NC_021988	AGAT	2	8	7507	7514	50 %	25 %	25 %	0 %	529230046
26	NC_021988	TGTT	2	8	7600	7607	0 %	75 %	25 %	0 %	529230046
27	NC_021988	ACTT	2	8	8810	8817	25 %	50 %	0 %	25 %	529230047
28	NC_021988	AGTA	2	8	8982	8989	50 %	25 %	25 %	0 %	529230047
29	NC_021988	CTCA	2	8	9146	9153	25 %	25 %	0 %	50 %	529230047
30	NC_021988	TTCC	2	8	9214	9221	0 %	50 %	0 %	50 %	529230047
31	NC_021988	TTCC	2	8	9346	9353	0 %	50 %	0 %	50 %	529230047
32	NC_021988	TAAT	2	8	10062	10069	50 %	50 %	0 %	0 %	529230048
33	NC_021988	TTAC	2	8	10398	10405	25 %	50 %	0 %	25 %	529230048
34	NC_021988	ATCC	2	8	11253	11260	25 %	25 %	0 %	50 %	529230050
35	NC_021988	AAAG	2	8	11908	11915	75 %	0 %	25 %	0 %	529230050
36	NC_021988	CCAT	2	8	12551	12558	25 %	25 %	0 %	50 %	529230051
37	NC_021988	CCAG	2	8	12636	12643	25 %	0 %	25 %	50 %	529230051
38	NC_021988	GCGA	2	8	12652	12659	25 %	0 %	50 %	25 %	529230051
39	NC_021988	TTTC	2	8	12706	12713	0 %	75 %	0 %	25 %	529230051
40	NC_021988	TTAT	2	8	12739	12746	25 %	75 %	0 %	0 %	529230052
41	NC_021988	CTTT	2	8	12896	12903	0 %	75 %	0 %	25 %	529230052
42	NC_021988	CTGC	2	8	13094	13101	0 %	25 %	25 %	50 %	529230052
43	NC_021988	TAAC	2	8	13301	13308	50 %	25 %	0 %	25 %	529230052
44	NC_021988	TACC	2	8	13556	13563	25 %	25 %	0 %	50 %	529230052
45	NC_021988	AAAT	2	8	13618	13625	75 %	25 %	0 %	0 %	529230053
46	NC_021988	TCAA	2	8	14080	14087	50 %	25 %	0 %	25 %	529230054
47	NC_021988	GAGG	2	8	14115	14122	25 %	0 %	75 %	0 %	529230054
48	NC_021988	ATAA	2	8	15870	15877	75 %	25 %	0 %	0 %	529230056
49	NC_021988	AATT	2	8	16234	16241	50 %	50 %	0 %	0 %	529230056
50	NC_021988	CTTT	2	8	16505	16512	0 %	75 %	0 %	25 %	529230057
51	NC_021988	AGAT	2	8	16629	16636	50 %	25 %	25 %	0 %	529230057
52	NC_021988	GATA	2	8	17238	17245	50 %	25 %	25 %	0 %	529230057
53	NC_021988	TATC	2	8	17708	17715	25 %	50 %	0 %	25 %	529230057
54	NC_021988	CTTC	2	8	17749	17756	0 %	50 %	0 %	50 %	529230057
55	NC_021988	TCAA	2	8	18893	18900	50 %	25 %	0 %	25 %	529230059
56	NC_021988	AGAA	2	8	20246	20253	75 %	0 %	25 %	0 %	529230060
57	NC_021988	ATCA	2	8	20459	20466	50 %	25 %	0 %	25 %	529230060
58	NC_021988	TTTC	2	8	20620	20627	0 %	75 %	0 %	25 %	529230060
59	NC_021988	TTCT	2	8	20639	20646	0 %	75 %	0 %	25 %	529230060
60	NC_021988	TTTC	2	8	20948	20955	0 %	75 %	0 %	25 %	529230061
61	NC_021988	AAAT	2	8	22089	22096	75 %	25 %	0 %	0 %	529230063
62	NC_021988	ATTT	2	8	22412	22419	25 %	75 %	0 %	0 %	529230064
63	NC_021988	AAAG	2	8	22552	22559	75 %	0 %	25 %	0 %	529230064
64	NC_021988	ATCT	2	8	22695	22702	25 %	50 %	0 %	25 %	529230064
65	NC_021988	GTCA	2	8	23247	23254	25 %	25 %	25 %	25 %	529230065
66	NC_021988	TTTC	2	8	23345	23352	0 %	75 %	0 %	25 %	529230065
67	NC_021988	ACTT	2	8	23423	23430	25 %	50 %	0 %	25 %	529230065
68	NC_021988	TTGA	2	8	24384	24391	25 %	50 %	25 %	0 %	529230066
69	NC_021988	AAAT	2	8	24873	24880	75 %	25 %	0 %	0 %	529230067
70	NC_021988	CTGA	2	8	25277	25284	25 %	25 %	25 %	25 %	529230067
71	NC_021988	AAGA	2	8	25789	25796	75 %	0 %	25 %	0 %	529230068
72	NC_021988	AACC	2	8	27183	27190	50 %	0 %	0 %	50 %	529230071
73	NC_021988	TCTT	2	8	27884	27891	0 %	75 %	0 %	25 %	529230071
74	NC_021988	TGAT	2	8	27898	27905	25 %	50 %	25 %	0 %	529230071
75	NC_021988	TGAA	2	8	28109	28116	50 %	25 %	25 %	0 %	529230072
76	NC_021988	CAGT	2	8	28775	28782	25 %	25 %	25 %	25 %	529230074
77	NC_021988	CATA	2	8	29210	29217	50 %	25 %	0 %	25 %	529230075
78	NC_021988	TCTT	2	8	29286	29293	0 %	75 %	0 %	25 %	529230075
79	NC_021988	TTCT	2	8	29508	29515	0 %	75 %	0 %	25 %	529230076
80	NC_021988	TTCC	2	8	29799	29806	0 %	50 %	0 %	50 %	529230076
81	NC_021988	AGCC	2	8	30021	30028	25 %	0 %	25 %	50 %	529230076
82	NC_021988	ACTT	2	8	30046	30053	25 %	50 %	0 %	25 %	529230076
83	NC_021988	GATC	2	8	30101	30108	25 %	25 %	25 %	25 %	529230076

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.