MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p3

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021988	GGT	2	6	1507	1512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021988	GCT	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021988	GAA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021988	AGG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021988	GTA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021988	GGA	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021988	TAA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021988	ATT	2	6	5387	5392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021988	TTG	2	6	5464	5469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021988	AAG	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021988	AGT	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021988	ACT	2	6	6917	6922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021988	CTT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021988	TAT	2	6	8142	8147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021988	CAC	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021988	TAA	2	6	8390	8395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021988	TAT	2	6	9423	9428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021988	AAG	2	6	9465	9470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021988	GTT	2	6	9550	9555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021988	TCT	2	6	9755	9760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021988	GTG	2	6	9777	9782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021988	CAA	2	6	9830	9835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021988	TAG	2	6	9847	9852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021988	CTC	2	6	11956	11961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021988	TCC	2	6	13573	13578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021988	ATT	2	6	13875	13880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021988	AAT	2	6	14631	14636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021988	ATA	2	6	14658	14663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021988	CAA	2	6	14763	14768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021988	AAC	2	6	14812	14817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021988	CTA	2	6	14905	14910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021988	GAA	2	6	14995	15000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021988	CAC	2	6	15136	15141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021988	ATG	2	6	15198	15203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021988	AAC	2	6	15222	15227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021988	AAT	2	6	15242	15247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021988	TTC	2	6	16258	16263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021988	TTC	2	6	17800	17805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021988	TAT	2	6	17996	18001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021988	TAT	2	6	18039	18044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021988	TTA	2	6	18120	18125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021988	CAT	2	6	18128	18133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021988	TTC	2	6	18158	18163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021988	TAT	2	6	18180	18185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021988	TTC	2	6	18215	18220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021988	AGT	2	6	19219	19224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021988	TCG	2	6	19253	19258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021988	TAG	2	6	19330	19335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021988	AAT	2	6	19347	19352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021988	CTG	2	6	19359	19364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021988	TCC	2	6	19398	19403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021988	TAT	2	6	19417	19422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021988	TAG	2	6	19437	19442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021988	AAT	2	6	19511	19516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021988	ACT	2	6	19529	19534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021988	CAC	2	6	19535	19540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021988	CTT	2	6	19580	19585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021988	TGA	2	6	19673	19678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021988	TCA	2	6	21372	21377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021988	GGA	2	6	21853	21858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021988	AGG	2	6	22975	22980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021988	TGT	2	6	23031	23036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021988	ATG	2	6	23163	23168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021988	CTA	2	6	23841	23846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021988	AAT	2	6	23860	23865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021988	AGG	2	6	23879	23884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021988	TGT	2	6	26029	26034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021988	ATA	2	6	26040	26045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021988	TTA	2	6	26238	26243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021988	CTG	2	6	26352	26357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021988	TAG	2	6	26424	26429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021988	TAA	2	6	26831	26836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021988	TAG	2	6	26891	26896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021988	ATG	2	6	26977	26982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021988	CTT	2	6	27025	27030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021988	CCT	2	6	27065	27070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021988	ATA	2	6	28585	28590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021988	TAA	2	6	28609	28614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021988	ACA	2	6	28620	28625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021988	TGT	2	6	29013	29018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021988	AAT	2	6	30644	30649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021988	ATT	2	6	30667	30672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021988	ACT	2	6	30735	30740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021988	AGA	2	6	30811	30816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.