MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p3

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021988	GTG	2	6	35	40	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230035
2	NC_021988	GAA	2	6	103	108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230035
3	NC_021988	GAT	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230035
4	NC_021988	ATT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230035
5	NC_021988	ATA	2	6	521	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230035
6	NC_021988	AGA	2	6	612	617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230035
7	NC_021988	TCG	2	6	710	715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230035
8	NC_021988	AAT	2	6	739	744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230035
9	NC_021988	TTA	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230035
10	NC_021988	AGC	2	6	900	905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230035
11	NC_021988	ATT	2	6	919	924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230035
12	NC_021988	ACG	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230035
13	NC_021988	TGG	2	6	991	996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230035
14	NC_021988	AGA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230035
15	NC_021988	GAG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230035
16	NC_021988	TCT	2	6	1196	1201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230035
17	NC_021988	GAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230035
18	NC_021988	GTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529230035
19	NC_021988	ATT	2	6	1298	1303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230035
20	NC_021988	CAA	2	6	1304	1309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230035
21	NC_021988	TAG	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230035
22	NC_021988	AAG	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230035
23	NC_021988	GGA	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230036
24	NC_021988	TCT	2	6	1674	1679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230036
25	NC_021988	CTT	2	6	1705	1710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230036
26	NC_021988	TTC	2	6	1723	1728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230036
27	NC_021988	GAA	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230036
28	NC_021988	AGT	3	9	1852	1860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230036
29	NC_021988	ATC	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230037
30	NC_021988	ATT	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230037
31	NC_021988	TGA	2	6	2272	2277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230037
32	NC_021988	AAC	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230037
33	NC_021988	CAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230037
34	NC_021988	AAC	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230037
35	NC_021988	GAC	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230038
36	NC_021988	TTA	2	6	3189	3194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230038
37	NC_021988	GCA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230038
38	NC_021988	CAG	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230038
39	NC_021988	TTG	2	6	3356	3361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529230038
40	NC_021988	TAA	2	6	3383	3388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230038
41	NC_021988	GAA	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230038
42	NC_021988	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230038
43	NC_021988	TAT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230038
44	NC_021988	TTA	2	6	3527	3532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230038
45	NC_021988	CTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230038
46	NC_021988	GAA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230038
47	NC_021988	AGT	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230038
48	NC_021988	AAG	2	6	3948	3953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230039
49	NC_021988	GTA	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230039
50	NC_021988	CAA	2	6	4083	4088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230039
51	NC_021988	CTA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230040
52	NC_021988	AAT	2	6	4507	4512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230040
53	NC_021988	AGG	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230041
54	NC_021988	CAG	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230041
55	NC_021988	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230041
56	NC_021988	CTA	2	6	4595	4600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230041
57	NC_021988	ACG	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230041
58	NC_021988	ACT	2	6	4706	4711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230041
59	NC_021988	ATT	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230041
60	NC_021988	AGC	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230041
61	NC_021988	TGA	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230041
62	NC_021988	AAT	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230041
63	NC_021988	AAG	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230041
64	NC_021988	TAT	2	6	5197	5202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230041
65	NC_021988	AAG	2	6	5662	5667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230042
66	NC_021988	AGA	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230042
67	NC_021988	ATT	2	6	5859	5864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230043
68	NC_021988	TTA	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230043
69	NC_021988	ATT	2	6	5918	5923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230043
70	NC_021988	AGA	2	6	5928	5933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230043
71	NC_021988	AGA	2	6	6073	6078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230044
72	NC_021988	TGG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230044
73	NC_021988	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230044
74	NC_021988	ACA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230044
75	NC_021988	TGA	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230044
76	NC_021988	GTA	2	6	6272	6277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230044
77	NC_021988	AAC	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230044
78	NC_021988	CAA	2	6	6399	6404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230044
79	NC_021988	GAT	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230044
80	NC_021988	TTG	2	6	6552	6557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529230044
81	NC_021988	CAA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230044
82	NC_021988	ACC	2	6	6838	6843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529230044
83	NC_021988	TTA	2	6	7052	7057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247872
84	NC_021988	TAA	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529247872
85	NC_021988	ATT	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529247872
86	NC_021988	TCC	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529247872
87	NC_021988	ATA	2	6	7157	7162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529247872
88	NC_021988	TGA	2	6	7240	7245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230046
89	NC_021988	TTA	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230046
90	NC_021988	CTT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230046
91	NC_021988	CAA	2	6	7499	7504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230046
92	NC_021988	AAT	2	6	7548	7553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230046
93	NC_021988	CAA	2	6	7583	7588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230046
94	NC_021988	TCG	2	6	7742	7747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230046
95	NC_021988	TAT	2	6	7812	7817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230046
96	NC_021988	ATA	2	6	8651	8656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230047
97	NC_021988	TTC	2	6	8717	8722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230047
98	NC_021988	TCC	2	6	8730	8735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230047
99	NC_021988	TCT	2	6	8937	8942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230047
100	NC_021988	CAT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230047
101	NC_021988	CAT	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230047
102	NC_021988	CAT	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230047
103	NC_021988	GGT	2	6	9260	9265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230047
104	NC_021988	CCA	2	6	9316	9321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529230047
105	NC_021988	TCA	2	6	9890	9895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230048
106	NC_021988	GAA	2	6	9999	10004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230048
107	NC_021988	ATT	2	6	10037	10042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230048
108	NC_021988	TAG	2	6	10138	10143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230048
109	NC_021988	ATT	2	6	10190	10195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230048
110	NC_021988	TCA	2	6	10206	10211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230048
111	NC_021988	CAA	2	6	10332	10337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230048
112	NC_021988	GAA	2	6	10457	10462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230048
113	NC_021988	TCC	2	6	10552	10557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230048
114	NC_021988	ACG	2	6	10750	10755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230048
115	NC_021988	GGA	2	6	10760	10765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230048
116	NC_021988	CAC	2	6	10803	10808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529230049
117	NC_021988	CCT	2	6	10863	10868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230049
118	NC_021988	AAT	2	6	11224	11229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230050
119	NC_021988	CAG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230050
120	NC_021988	TAA	2	6	11453	11458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230050
121	NC_021988	GCA	2	6	11487	11492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529230050
122	NC_021988	ATC	2	6	11493	11498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230050
123	NC_021988	TTA	2	6	11591	11596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230050
124	NC_021988	ATC	2	6	11664	11669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230050
125	NC_021988	TTC	2	6	11697	11702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230050
126	NC_021988	AAT	2	6	11710	11715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230050
127	NC_021988	TCC	2	6	11722	11727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230050
128	NC_021988	CAT	2	6	11736	11741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230050
129	NC_021988	TAT	2	6	11742	11747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230050
130	NC_021988	TCA	2	6	11770	11775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230050
131	NC_021988	CAT	2	6	11925	11930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230050
132	NC_021988	TAT	2	6	11976	11981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230051
133	NC_021988	TCT	2	6	11986	11991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230051
134	NC_021988	CAT	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230051
135	NC_021988	CAT	2	6	12053	12058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230051
136	NC_021988	GGC	2	6	12066	12071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529230051
137	NC_021988	TAT	2	6	12092	12097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230051
138	NC_021988	TTC	2	6	12161	12166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230051
139	NC_021988	ATA	3	9	12194	12202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230051
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142	NC_021988	TCT	2	6	12420	12425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230051
143	NC_021988	CTA	2	6	12508	12513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230051
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145	NC_021988	CAT	2	6	12694	12699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230051
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147	NC_021988	CTT	2	6	12767	12772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230052
148	NC_021988	ATT	2	6	12921	12926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230052
149	NC_021988	ATA	2	6	12958	12963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230052
150	NC_021988	TCA	2	6	13058	13063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230052
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152	NC_021988	ACA	2	6	13351	13356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230052
153	NC_021988	GTT	2	6	13359	13364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529230052
154	NC_021988	TCA	2	6	13372	13377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230052
155	NC_021988	CTT	2	6	13474	13479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230052
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158	NC_021988	TCT	2	6	14125	14130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230054
159	NC_021988	TAG	2	6	14238	14243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230054
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164	NC_021988	TCT	2	6	14380	14385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230054
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252	NC_021988	TGA	2	6	22638	22643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230064
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.