MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	ACTTAT	2	12	1430	1441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021987	AATTTT	2	12	2651	2662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021987	TACTGA	2	12	4511	4522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	529229877
4	NC_021987	TTTTAT	2	12	5478	5489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021987	AGAAAA	2	12	18761	18772	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021987	AAGAAA	2	12	18978	18989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021987	TCATTT	2	12	22396	22407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021987	AAAAGG	2	12	25877	25888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021987	TTCCAA	2	12	27293	27304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529229902
10	NC_021987	GAACAA	2	12	27830	27841	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	529229902
11	NC_021987	ACTGAA	2	12	28817	28828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529229903
12	NC_021987	GAAAAA	2	12	29861	29872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	529229905
13	NC_021987	CTTTTT	2	12	32516	32527	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021987	ATCAAA	2	12	34129	34140	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021987	CATAAA	2	12	38195	38206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	529229914
16	NC_021987	GAACCA	2	12	38409	38420	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	529229914
17	NC_021987	TCTACT	2	12	46521	46532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	529229922
18	NC_021987	TTCCTG	2	12	47655	47666	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529229923
19	NC_021987	TATTGA	2	12	48901	48912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229926
20	NC_021987	CTTATC	2	12	49234	49245	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021987	TTTTAA	2	12	53746	53757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021987	AAATTT	2	12	56678	56689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021987	GTAAAA	2	12	59440	59451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021987	AGCACC	2	12	64203	64214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529229948
25	NC_021987	TAAAAT	2	12	68069	68080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529229953
26	NC_021987	TGCTTC	2	12	71552	71563	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529229956
27	NC_021987	TTCATC	2	12	73501	73512	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	529229960
28	NC_021987	TTTATT	2	12	74106	74117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529229962
29	NC_021987	CTTTAT	2	12	78795	78806	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	529229968
30	NC_021987	GTAGAA	2	12	84527	84538	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021987	TTTGTT	2	12	84867	84878	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021987	ACCATA	2	12	85033	85044	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	529229976
33	NC_021987	TATGAA	2	12	86030	86041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	529229977
34	NC_021987	ATTGAT	2	12	86512	86523	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229978
35	NC_021987	GGACAT	2	12	89324	89335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529229983
36	NC_021987	CATAAA	2	12	90086	90097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	529229983
37	NC_021987	AAAATA	2	12	95607	95618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021987	TGATAT	2	12	96795	96806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229990
39	NC_021987	TGATAT	2	12	98040	98051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229992
40	NC_021987	CAAAAA	2	12	104068	104079	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529230000
41	NC_021987	AATATA	2	12	106143	106154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021987	CAAAAA	2	12	106980	106991	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529230001
43	NC_021987	ATTAAA	2	12	107826	107837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021987	AAACAA	2	12	108785	108796	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529230002
45	NC_021987	ATCAAA	2	12	110081	110092	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021987	CCTTTT	2	12	110731	110742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230004
47	NC_021987	AGAGAA	2	12	113796	113807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230005
48	NC_021987	CATGAA	2	12	115554	115565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529230006
49	NC_021987	ACCGCC	2	12	120933	120944	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021987	GACAAG	2	12	121111	121122	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021987	CCTTGT	2	12	121144	121155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021987	TCAGAA	2	12	122507	122518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529247617

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.