MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TACTGA	2	12	4511	4522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	529229877
2	NC_021987	TTCCAA	2	12	27293	27304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529229902
3	NC_021987	GAACAA	2	12	27830	27841	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	529229902
4	NC_021987	ACTGAA	2	12	28817	28828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529229903
5	NC_021987	GAAAAA	2	12	29861	29872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	529229905
6	NC_021987	CATAAA	2	12	38195	38206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	529229914
7	NC_021987	GAACCA	2	12	38409	38420	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	529229914
8	NC_021987	TCTACT	2	12	46521	46532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	529229922
9	NC_021987	TTCCTG	2	12	47655	47666	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529229923
10	NC_021987	TATTGA	2	12	48901	48912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229926
11	NC_021987	AGCACC	2	12	64203	64214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529229948
12	NC_021987	TAAAAT	2	12	68069	68080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529229953
13	NC_021987	TGCTTC	2	12	71552	71563	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529229956
14	NC_021987	TTCATC	2	12	73501	73512	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	529229960
15	NC_021987	TTTATT	2	12	74106	74117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529229962
16	NC_021987	CTTTAT	2	12	78795	78806	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	529229968
17	NC_021987	ACCATA	2	12	85033	85044	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	529229976
18	NC_021987	TATGAA	2	12	86030	86041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	529229977
19	NC_021987	ATTGAT	2	12	86512	86523	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229978
20	NC_021987	GGACAT	2	12	89324	89335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529229983
21	NC_021987	CATAAA	2	12	90086	90097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	529229983
22	NC_021987	TGATAT	2	12	96795	96806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229990
23	NC_021987	TGATAT	2	12	98040	98051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529229992
24	NC_021987	CAAAAA	2	12	104068	104079	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529230000
25	NC_021987	CAAAAA	2	12	106980	106991	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529230001
26	NC_021987	AAACAA	2	12	108785	108796	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529230002
27	NC_021987	CCTTTT	2	12	110731	110742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230004
28	NC_021987	AGAGAA	2	12	113796	113807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230005
29	NC_021987	CATGAA	2	12	115554	115565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529230006
30	NC_021987	TCAGAA	2	12	122507	122518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529247617

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.