MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	CAATG	2	10	90	99	40 %	20 %	20 %	20 %	529229872
2	NC_021987	ATTTC	2	10	460	469	20 %	60 %	0 %	20 %	529229872
3	NC_021987	AAATT	2	10	1817	1826	60 %	40 %	0 %	0 %	529229874
4	NC_021987	CCTAT	2	10	4501	4510	20 %	40 %	0 %	40 %	529229877
5	NC_021987	TTTCA	2	10	4688	4697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021987	ATAAA	2	10	4959	4968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021987	ATCAA	2	10	5768	5777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021987	TTTCC	2	10	5867	5876	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_021987	TATAT	2	10	7218	7227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021987	ACCCC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	0 %	80 %	529229879
11	NC_021987	GAAAA	2	10	8689	8698	80 %	0 %	20 %	0 %	529229880
12	NC_021987	AAGTC	2	10	14790	14799	40 %	20 %	20 %	20 %	529229885
13	NC_021987	TTATA	2	10	15532	15541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021987	CTACA	2	10	15886	15895	40 %	20 %	0 %	40 %	529229887
15	NC_021987	TAAAT	2	10	16952	16961	60 %	40 %	0 %	0 %	529229889
16	NC_021987	GTTCA	2	10	17065	17074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021987	CCTTC	2	10	18391	18400	0 %	40 %	0 %	60 %	529229890
18	NC_021987	TTTCT	2	10	18714	18723	0 %	80 %	0 %	20 %	529229890
19	NC_021987	TAATA	2	10	19064	19073	60 %	40 %	0 %	0 %	529229891
20	NC_021987	CAAAA	2	10	19373	19382	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021987	TCGGG	2	10	21078	21087	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021987	AACCA	2	10	21259	21268	60 %	0 %	0 %	40 %	529229894
23	NC_021987	TGGTT	2	10	21285	21294	0 %	60 %	40 %	0 %	529229894
24	NC_021987	GTCTA	2	10	22139	22148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021987	CATAG	2	10	24577	24586	40 %	20 %	20 %	20 %	529229900
26	NC_021987	TATTT	2	10	25381	25390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021987	CATTT	2	10	25574	25583	20 %	60 %	0 %	20 %	529229901
28	NC_021987	ATAGA	2	10	29382	29391	60 %	20 %	20 %	0 %	529229904
29	NC_021987	GATAA	2	10	29590	29599	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021987	TTTTA	2	10	30470	30479	20 %	80 %	0 %	0 %	529247610
31	NC_021987	AAAAT	2	10	31315	31324	80 %	20 %	0 %	0 %	529247610
32	NC_021987	TCTTT	2	10	31643	31652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021987	CTATG	2	10	32963	32972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021987	AGTAA	2	10	36693	36702	60 %	20 %	20 %	0 %	529229912
35	NC_021987	TAAGG	2	10	39971	39980	40 %	20 %	40 %	0 %	529229916
36	NC_021987	GCCTC	2	10	42946	42955	0 %	20 %	20 %	60 %	529229920
37	NC_021987	TCTTT	2	10	43794	43803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021987	ATCCA	2	10	44875	44884	40 %	20 %	0 %	40 %	529229921
39	NC_021987	AAAAG	2	10	45067	45076	80 %	0 %	20 %	0 %	529229921
40	NC_021987	TTTAC	2	10	45369	45378	20 %	60 %	0 %	20 %	529229921
41	NC_021987	TTTCT	2	10	45603	45612	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021987	ATTTT	2	10	46576	46585	20 %	80 %	0 %	0 %	529229922
43	NC_021987	TATCT	2	10	46586	46595	20 %	60 %	0 %	20 %	529229922
44	NC_021987	ATTTT	2	10	46641	46650	20 %	80 %	0 %	0 %	529229922
45	NC_021987	CTAAT	2	10	47475	47484	40 %	40 %	0 %	20 %	529229923
46	NC_021987	TTGTT	2	10	48585	48594	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021987	AAATA	2	10	48680	48689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021987	ACTAG	2	10	49259	49268	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021987	AACCA	2	10	50172	50181	60 %	0 %	0 %	40 %	529229928
50	NC_021987	GCGAA	2	10	50427	50436	40 %	0 %	40 %	20 %	529229928
51	NC_021987	TCATT	2	10	50746	50755	20 %	60 %	0 %	20 %	529229929
52	NC_021987	TTATT	2	10	51504	51513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021987	ACTAG	2	10	51869	51878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021987	AACCA	2	10	52782	52791	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_021987	GCGAA	2	10	53037	53046	40 %	0 %	40 %	20 %	529229933
56	NC_021987	TCTCT	2	10	56157	56166	0 %	60 %	0 %	40 %	529229938
57	NC_021987	GTTTA	2	10	56509	56518	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021987	AATTA	2	10	56664	56673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021987	TAAAT	2	10	57046	57055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021987	TCTTT	2	10	58450	58459	0 %	80 %	0 %	20 %	529229941
61	NC_021987	TTTCT	2	10	58719	58728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021987	AACGA	2	10	59809	59818	60 %	0 %	20 %	20 %	529229942
63	NC_021987	AACAG	2	10	59939	59948	60 %	0 %	20 %	20 %	529229942
64	NC_021987	GACTT	2	10	60735	60744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021987	AGCAC	2	10	61473	61482	40 %	0 %	20 %	40 %	529229943
66	NC_021987	ACTAC	2	10	62681	62690	40 %	20 %	0 %	40 %	529229945
67	NC_021987	GAAAA	2	10	64106	64115	80 %	0 %	20 %	0 %	529229948
68	NC_021987	CTTTT	2	10	72495	72504	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021987	ATTTA	2	10	72665	72674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021987	TAAAT	2	10	72963	72972	60 %	40 %	0 %	0 %	529229958
71	NC_021987	TTGTT	2	10	74051	74060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021987	TCAGC	2	10	75646	75655	20 %	20 %	20 %	40 %	529229965
73	NC_021987	GACTT	2	10	75815	75824	20 %	40 %	20 %	20 %	529229965
74	NC_021987	ATTAA	2	10	76548	76557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021987	AAGTG	2	10	76888	76897	40 %	20 %	40 %	0 %	529229966
76	NC_021987	AATAG	2	10	77546	77555	60 %	20 %	20 %	0 %	529229966
77	NC_021987	AAAAT	2	10	79382	79391	80 %	20 %	0 %	0 %	529229968
78	NC_021987	GAAAT	2	10	79473	79482	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021987	TCTCT	2	10	81563	81572	0 %	60 %	0 %	40 %	529229970
80	NC_021987	TCTGT	2	10	82569	82578	0 %	60 %	20 %	20 %	529229972
81	NC_021987	TTTTG	2	10	89848	89857	0 %	80 %	20 %	0 %	529229983
82	NC_021987	CTTGC	2	10	91835	91844	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021987	ACTTT	2	10	91927	91936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021987	TAAAC	2	10	93604	93613	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021987	GAATA	2	10	93896	93905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021987	ATCAA	2	10	94270	94279	60 %	20 %	0 %	20 %	529229987
87	NC_021987	TCATC	2	10	96922	96931	20 %	40 %	0 %	40 %	529229990
88	NC_021987	TCATC	2	10	98168	98177	20 %	40 %	0 %	40 %	529229992
89	NC_021987	TAGAT	2	10	99611	99620	40 %	40 %	20 %	0 %	529229994
90	NC_021987	CAAAA	2	10	99890	99899	80 %	0 %	0 %	20 %	529229994
91	NC_021987	TCCAT	2	10	102117	102126	20 %	40 %	0 %	40 %	529229997
92	NC_021987	AGTGG	2	10	103076	103085	20 %	20 %	60 %	0 %	529229999
93	NC_021987	TACAA	2	10	104270	104279	60 %	20 %	0 %	20 %	529230000
94	NC_021987	ATTTC	2	10	105031	105040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021987	GTTAT	2	10	105173	105182	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021987	CAAAA	2	10	105808	105817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021987	AGATA	2	10	111300	111309	60 %	20 %	20 %	0 %	529230004
98	NC_021987	GAAAA	2	10	112240	112249	80 %	0 %	20 %	0 %	529230005
99	NC_021987	ACAAA	2	10	112821	112830	80 %	0 %	0 %	20 %	529230005
100	NC_021987	AATGG	2	10	114297	114306	40 %	20 %	40 %	0 %	529230006
101	NC_021987	AAAAG	2	10	116470	116479	80 %	0 %	20 %	0 %	529230008
102	NC_021987	AGAAA	2	10	117055	117064	80 %	0 %	20 %	0 %	529247616
103	NC_021987	GAAAA	2	10	117850	117859	80 %	0 %	20 %	0 %	529247616
104	NC_021987	AAGAA	2	10	117871	117880	80 %	0 %	20 %	0 %	529247616
105	NC_021987	ATTTC	2	10	118470	118479	20 %	60 %	0 %	20 %	529230011
106	NC_021987	ATGAA	2	10	118604	118613	60 %	20 %	20 %	0 %	529230011
107	NC_021987	GAAAT	2	10	118702	118711	60 %	20 %	20 %	0 %	529230011
108	NC_021987	AAATT	2	10	119099	119108	60 %	40 %	0 %	0 %	529230012
109	NC_021987	CATTT	2	10	119520	119529	20 %	60 %	0 %	20 %	529230012
110	NC_021987	CTTTA	2	10	120617	120626	20 %	60 %	0 %	20 %	529230014
111	NC_021987	ACACA	2	10	121461	121470	60 %	0 %	0 %	40 %	529230016
112	NC_021987	GGAGC	2	10	122393	122402	20 %	0 %	60 %	20 %	529230018
113	NC_021987	TTATT	2	10	124114	124123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021987	GAATA	2	10	124350	124359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021987	CTTTT	2	10	126371	126380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021987	TTTAT	2	10	126553	126562	20 %	80 %	0 %	0 %	529230027
117	NC_021987	TTCAT	2	10	127289	127298	20 %	60 %	0 %	20 %	529230028
118	NC_021987	GATTT	2	10	127599	127608	20 %	60 %	20 %	0 %	529230029
119	NC_021987	GGTAT	2	10	128525	128534	20 %	40 %	40 %	0 %	529230030
120	NC_021987	AAGCA	2	10	128873	128882	60 %	0 %	20 %	20 %	529230030
121	NC_021987	TCAAT	2	10	130442	130451	40 %	40 %	0 %	20 %	529230033

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.