MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	CAATG	2	10	90	99	40 %	20 %	20 %	20 %	529229872
2	NC_021987	ATTTC	2	10	460	469	20 %	60 %	0 %	20 %	529229872
3	NC_021987	AAATT	2	10	1817	1826	60 %	40 %	0 %	0 %	529229874
4	NC_021987	CCTAT	2	10	4501	4510	20 %	40 %	0 %	40 %	529229877
5	NC_021987	ACCCC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	0 %	80 %	529229879
6	NC_021987	GAAAA	2	10	8689	8698	80 %	0 %	20 %	0 %	529229880
7	NC_021987	AAGTC	2	10	14790	14799	40 %	20 %	20 %	20 %	529229885
8	NC_021987	CTACA	2	10	15886	15895	40 %	20 %	0 %	40 %	529229887
9	NC_021987	TAAAT	2	10	16952	16961	60 %	40 %	0 %	0 %	529229889
10	NC_021987	CCTTC	2	10	18391	18400	0 %	40 %	0 %	60 %	529229890
11	NC_021987	TTTCT	2	10	18714	18723	0 %	80 %	0 %	20 %	529229890
12	NC_021987	TAATA	2	10	19064	19073	60 %	40 %	0 %	0 %	529229891
13	NC_021987	AACCA	2	10	21259	21268	60 %	0 %	0 %	40 %	529229894
14	NC_021987	TGGTT	2	10	21285	21294	0 %	60 %	40 %	0 %	529229894
15	NC_021987	CATAG	2	10	24577	24586	40 %	20 %	20 %	20 %	529229900
16	NC_021987	CATTT	2	10	25574	25583	20 %	60 %	0 %	20 %	529229901
17	NC_021987	ATAGA	2	10	29382	29391	60 %	20 %	20 %	0 %	529229904
18	NC_021987	TTTTA	2	10	30470	30479	20 %	80 %	0 %	0 %	529247610
19	NC_021987	AAAAT	2	10	31315	31324	80 %	20 %	0 %	0 %	529247610
20	NC_021987	AGTAA	2	10	36693	36702	60 %	20 %	20 %	0 %	529229912
21	NC_021987	TAAGG	2	10	39971	39980	40 %	20 %	40 %	0 %	529229916
22	NC_021987	GCCTC	2	10	42946	42955	0 %	20 %	20 %	60 %	529229920
23	NC_021987	ATCCA	2	10	44875	44884	40 %	20 %	0 %	40 %	529229921
24	NC_021987	AAAAG	2	10	45067	45076	80 %	0 %	20 %	0 %	529229921
25	NC_021987	TTTAC	2	10	45369	45378	20 %	60 %	0 %	20 %	529229921
26	NC_021987	ATTTT	2	10	46576	46585	20 %	80 %	0 %	0 %	529229922
27	NC_021987	TATCT	2	10	46586	46595	20 %	60 %	0 %	20 %	529229922
28	NC_021987	ATTTT	2	10	46641	46650	20 %	80 %	0 %	0 %	529229922
29	NC_021987	CTAAT	2	10	47475	47484	40 %	40 %	0 %	20 %	529229923
30	NC_021987	AACCA	2	10	50172	50181	60 %	0 %	0 %	40 %	529229928
31	NC_021987	GCGAA	2	10	50427	50436	40 %	0 %	40 %	20 %	529229928
32	NC_021987	TCATT	2	10	50746	50755	20 %	60 %	0 %	20 %	529229929
33	NC_021987	GCGAA	2	10	53037	53046	40 %	0 %	40 %	20 %	529229933
34	NC_021987	TCTCT	2	10	56157	56166	0 %	60 %	0 %	40 %	529229938
35	NC_021987	TCTTT	2	10	58450	58459	0 %	80 %	0 %	20 %	529229941
36	NC_021987	AACGA	2	10	59809	59818	60 %	0 %	20 %	20 %	529229942
37	NC_021987	AACAG	2	10	59939	59948	60 %	0 %	20 %	20 %	529229942
38	NC_021987	AGCAC	2	10	61473	61482	40 %	0 %	20 %	40 %	529229943
39	NC_021987	ACTAC	2	10	62681	62690	40 %	20 %	0 %	40 %	529229945
40	NC_021987	GAAAA	2	10	64106	64115	80 %	0 %	20 %	0 %	529229948
41	NC_021987	TAAAT	2	10	72963	72972	60 %	40 %	0 %	0 %	529229958
42	NC_021987	TCAGC	2	10	75646	75655	20 %	20 %	20 %	40 %	529229965
43	NC_021987	GACTT	2	10	75815	75824	20 %	40 %	20 %	20 %	529229965
44	NC_021987	AAGTG	2	10	76888	76897	40 %	20 %	40 %	0 %	529229966
45	NC_021987	AATAG	2	10	77546	77555	60 %	20 %	20 %	0 %	529229966
46	NC_021987	AAAAT	2	10	79382	79391	80 %	20 %	0 %	0 %	529229968
47	NC_021987	TCTCT	2	10	81563	81572	0 %	60 %	0 %	40 %	529229970
48	NC_021987	TCTGT	2	10	82569	82578	0 %	60 %	20 %	20 %	529229972
49	NC_021987	TTTTG	2	10	89848	89857	0 %	80 %	20 %	0 %	529229983
50	NC_021987	ATCAA	2	10	94270	94279	60 %	20 %	0 %	20 %	529229987
51	NC_021987	TCATC	2	10	96922	96931	20 %	40 %	0 %	40 %	529229990
52	NC_021987	TCATC	2	10	98168	98177	20 %	40 %	0 %	40 %	529229992
53	NC_021987	TAGAT	2	10	99611	99620	40 %	40 %	20 %	0 %	529229994
54	NC_021987	CAAAA	2	10	99890	99899	80 %	0 %	0 %	20 %	529229994
55	NC_021987	TCCAT	2	10	102117	102126	20 %	40 %	0 %	40 %	529229997
56	NC_021987	AGTGG	2	10	103076	103085	20 %	20 %	60 %	0 %	529229999
57	NC_021987	TACAA	2	10	104270	104279	60 %	20 %	0 %	20 %	529230000
58	NC_021987	AGATA	2	10	111300	111309	60 %	20 %	20 %	0 %	529230004
59	NC_021987	GAAAA	2	10	112240	112249	80 %	0 %	20 %	0 %	529230005
60	NC_021987	ACAAA	2	10	112821	112830	80 %	0 %	0 %	20 %	529230005
61	NC_021987	AATGG	2	10	114297	114306	40 %	20 %	40 %	0 %	529230006
62	NC_021987	AAAAG	2	10	116470	116479	80 %	0 %	20 %	0 %	529230008
63	NC_021987	AGAAA	2	10	117055	117064	80 %	0 %	20 %	0 %	529247616
64	NC_021987	GAAAA	2	10	117850	117859	80 %	0 %	20 %	0 %	529247616
65	NC_021987	AAGAA	2	10	117871	117880	80 %	0 %	20 %	0 %	529247616
66	NC_021987	ATTTC	2	10	118470	118479	20 %	60 %	0 %	20 %	529230011
67	NC_021987	ATGAA	2	10	118604	118613	60 %	20 %	20 %	0 %	529230011
68	NC_021987	GAAAT	2	10	118702	118711	60 %	20 %	20 %	0 %	529230011
69	NC_021987	AAATT	2	10	119099	119108	60 %	40 %	0 %	0 %	529230012
70	NC_021987	CATTT	2	10	119520	119529	20 %	60 %	0 %	20 %	529230012
71	NC_021987	CTTTA	2	10	120617	120626	20 %	60 %	0 %	20 %	529230014
72	NC_021987	ACACA	2	10	121461	121470	60 %	0 %	0 %	40 %	529230016
73	NC_021987	GGAGC	2	10	122393	122402	20 %	0 %	60 %	20 %	529230018
74	NC_021987	TTTAT	2	10	126553	126562	20 %	80 %	0 %	0 %	529230027
75	NC_021987	TTCAT	2	10	127289	127298	20 %	60 %	0 %	20 %	529230028
76	NC_021987	GATTT	2	10	127599	127608	20 %	60 %	20 %	0 %	529230029
77	NC_021987	GGTAT	2	10	128525	128534	20 %	40 %	40 %	0 %	529230030
78	NC_021987	AAGCA	2	10	128873	128882	60 %	0 %	20 %	20 %	529230030
79	NC_021987	TCAAT	2	10	130442	130451	40 %	40 %	0 %	20 %	529230033

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.