MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TGCT	2	8	77	84	0 %	50 %	25 %	25 %	529229872
2	NC_021987	GATA	2	8	532	539	50 %	25 %	25 %	0 %	529229872
3	NC_021987	TCAT	2	8	659	666	25 %	50 %	0 %	25 %	529229872
4	NC_021987	TTTC	2	8	1125	1132	0 %	75 %	0 %	25 %	529229873
5	NC_021987	TGTA	2	8	2483	2490	25 %	50 %	25 %	0 %	529229875
6	NC_021987	GTTG	2	8	3605	3612	0 %	50 %	50 %	0 %	529229876
7	NC_021987	ATCA	2	8	6140	6147	50 %	25 %	0 %	25 %	529229878
8	NC_021987	TGAG	2	8	6203	6210	25 %	25 %	50 %	0 %	529229878
9	NC_021987	TCTA	2	8	6360	6367	25 %	50 %	0 %	25 %	529229878
10	NC_021987	AGTC	2	8	6966	6973	25 %	25 %	25 %	25 %	529229878
11	NC_021987	CGAC	2	8	7357	7364	25 %	0 %	25 %	50 %	529229879
12	NC_021987	GTCC	2	8	7409	7416	0 %	25 %	25 %	50 %	529229879
13	NC_021987	AAAT	2	8	7461	7468	75 %	25 %	0 %	0 %	529229879
14	NC_021987	CATT	2	8	7569	7576	25 %	50 %	0 %	25 %	529229879
15	NC_021987	TACT	2	8	7873	7880	25 %	50 %	0 %	25 %	529229879
16	NC_021987	TAAT	2	8	8537	8544	50 %	50 %	0 %	0 %	529229880
17	NC_021987	GTAA	2	8	9250	9257	50 %	25 %	25 %	0 %	529229880
18	NC_021987	TTAA	2	8	9587	9594	50 %	50 %	0 %	0 %	529229881
19	NC_021987	ATTT	2	8	9824	9831	25 %	75 %	0 %	0 %	529229881
20	NC_021987	TAAT	2	8	10007	10014	50 %	50 %	0 %	0 %	529229881
21	NC_021987	ACTT	2	8	10611	10618	25 %	50 %	0 %	25 %	529229882
22	NC_021987	TTCA	2	8	10653	10660	25 %	50 %	0 %	25 %	529229882
23	NC_021987	TAAA	2	8	11106	11113	75 %	25 %	0 %	0 %	529229882
24	NC_021987	GATT	2	8	11174	11181	25 %	50 %	25 %	0 %	529229882
25	NC_021987	CGCT	2	8	11336	11343	0 %	25 %	25 %	50 %	529229882
26	NC_021987	GATC	2	8	11507	11514	25 %	25 %	25 %	25 %	529229882
27	NC_021987	TCTT	2	8	12165	12172	0 %	75 %	0 %	25 %	529229883
28	NC_021987	TTGC	2	8	12181	12188	0 %	50 %	25 %	25 %	529229883
29	NC_021987	TTTG	2	8	12264	12271	0 %	75 %	25 %	0 %	529229883
30	NC_021987	AAAC	2	8	12639	12646	75 %	0 %	0 %	25 %	529229883
31	NC_021987	TTGA	2	8	12999	13006	25 %	50 %	25 %	0 %	529229884
32	NC_021987	TTGA	2	8	13505	13512	25 %	50 %	25 %	0 %	529229884
33	NC_021987	AACC	2	8	14367	14374	50 %	0 %	0 %	50 %	529229885
34	NC_021987	TCTT	2	8	15068	15075	0 %	75 %	0 %	25 %	529229885
35	NC_021987	TGAT	2	8	15082	15089	25 %	50 %	25 %	0 %	529229885
36	NC_021987	TGAA	2	8	15293	15300	50 %	25 %	25 %	0 %	529229886
37	NC_021987	AAAT	2	8	15804	15811	75 %	25 %	0 %	0 %	529229887
38	NC_021987	TTGG	2	8	15866	15873	0 %	50 %	50 %	0 %	529229887
39	NC_021987	CAAT	2	8	16427	16434	50 %	25 %	0 %	25 %	529229888
40	NC_021987	ATCT	3	12	16624	16635	25 %	50 %	0 %	25 %	529229888
41	NC_021987	ATTT	2	8	16646	16653	25 %	75 %	0 %	0 %	529229888
42	NC_021987	TAAA	2	8	17615	17622	75 %	25 %	0 %	0 %	529229890
43	NC_021987	ACAT	2	8	18201	18208	50 %	25 %	0 %	25 %	529229890
44	NC_021987	GGGC	2	8	18246	18253	0 %	0 %	75 %	25 %	529229890
45	NC_021987	AGGA	2	8	18272	18279	50 %	0 %	50 %	0 %	529229890
46	NC_021987	ATTT	2	8	19000	19007	25 %	75 %	0 %	0 %	529229891
47	NC_021987	ATGA	2	8	19518	19525	50 %	25 %	25 %	0 %	529229892
48	NC_021987	CTGA	2	8	19936	19943	25 %	25 %	25 %	25 %	529229893
49	NC_021987	ACGG	2	8	20194	20201	25 %	0 %	50 %	25 %	529229893
50	NC_021987	ATAC	2	8	20609	20616	50 %	25 %	0 %	25 %	529229893
51	NC_021987	TCTT	2	8	21386	21393	0 %	75 %	0 %	25 %	529229894
52	NC_021987	TAAG	2	8	21479	21486	50 %	25 %	25 %	0 %	529229894
53	NC_021987	TAGA	2	8	21599	21606	50 %	25 %	25 %	0 %	529229894
54	NC_021987	GCTT	2	8	21830	21837	0 %	50 %	25 %	25 %	529229895
55	NC_021987	TCTT	2	8	21872	21879	0 %	75 %	0 %	25 %	529229895
56	NC_021987	TGCT	2	8	21945	21952	0 %	50 %	25 %	25 %	529229895
57	NC_021987	GAAA	2	8	22955	22962	75 %	0 %	25 %	0 %	529229896
58	NC_021987	GCCG	2	8	23731	23738	0 %	0 %	50 %	50 %	529229897
59	NC_021987	AAAG	2	8	23892	23899	75 %	0 %	25 %	0 %	529229897
60	NC_021987	TTGA	2	8	24353	24360	25 %	50 %	25 %	0 %	529229899
61	NC_021987	TATC	2	8	24493	24500	25 %	50 %	0 %	25 %	529229900
62	NC_021987	TTTC	2	8	24652	24659	0 %	75 %	0 %	25 %	529229900
63	NC_021987	TCTA	2	8	24913	24920	25 %	50 %	0 %	25 %	529229900
64	NC_021987	TAGA	2	8	24928	24935	50 %	25 %	25 %	0 %	529229900
65	NC_021987	TCGA	2	8	25067	25074	25 %	25 %	25 %	25 %	529229900
66	NC_021987	AAAT	2	8	25480	25487	75 %	25 %	0 %	0 %	529229901
67	NC_021987	TTCT	2	8	25523	25530	0 %	75 %	0 %	25 %	529229901
68	NC_021987	AACA	2	8	25748	25755	75 %	0 %	0 %	25 %	529229901
69	NC_021987	TTAA	2	8	25914	25921	50 %	50 %	0 %	0 %	529229902
70	NC_021987	AACC	2	8	26395	26402	50 %	0 %	0 %	50 %	529229902
71	NC_021987	ATTG	2	8	26424	26431	25 %	50 %	25 %	0 %	529229902
72	NC_021987	GATA	2	8	26683	26690	50 %	25 %	25 %	0 %	529229902
73	NC_021987	AACA	2	8	26969	26976	75 %	0 %	0 %	25 %	529229902
74	NC_021987	ATAA	2	8	27099	27106	75 %	25 %	0 %	0 %	529229902
75	NC_021987	GATA	2	8	27212	27219	50 %	25 %	25 %	0 %	529229902
76	NC_021987	CTGT	2	8	29213	29220	0 %	50 %	25 %	25 %	529229904
77	NC_021987	TAAC	2	8	29232	29239	50 %	25 %	0 %	25 %	529229904
78	NC_021987	TTGA	2	8	30168	30175	25 %	50 %	25 %	0 %	529229905
79	NC_021987	TTAA	2	8	30454	30461	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
80	NC_021987	TTAC	2	8	30540	30547	25 %	50 %	0 %	25 %	529247610
81	NC_021987	ATTA	2	8	30680	30687	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
82	NC_021987	TAGA	2	8	30730	30737	50 %	25 %	25 %	0 %	529247610
83	NC_021987	ATTT	2	8	30857	30864	25 %	75 %	0 %	0 %	529247610
84	NC_021987	CATT	2	8	30957	30964	25 %	50 %	0 %	25 %	529247610
85	NC_021987	TCTT	2	8	30977	30984	0 %	75 %	0 %	25 %	529247610
86	NC_021987	CATA	2	8	31897	31904	50 %	25 %	0 %	25 %	529229907
87	NC_021987	ATTT	2	8	32001	32008	25 %	75 %	0 %	0 %	529229907
88	NC_021987	TTAA	2	8	32080	32087	50 %	50 %	0 %	0 %	529229907
89	NC_021987	TTTC	2	8	32231	32238	0 %	75 %	0 %	25 %	529229907
90	NC_021987	GATG	2	8	33297	33304	25 %	25 %	50 %	0 %	529229908
91	NC_021987	TCAA	2	8	34471	34478	50 %	25 %	0 %	25 %	529229910
92	NC_021987	GAAA	2	8	34571	34578	75 %	0 %	25 %	0 %	529229910
93	NC_021987	TTGG	2	8	35301	35308	0 %	50 %	50 %	0 %	529229911
94	NC_021987	TTCC	2	8	35942	35949	0 %	50 %	0 %	50 %	529229912
95	NC_021987	GAGC	2	8	36357	36364	25 %	0 %	50 %	25 %	529229912
96	NC_021987	AGAA	2	8	36392	36399	75 %	0 %	25 %	0 %	529229912
97	NC_021987	CTGC	2	8	36415	36422	0 %	25 %	25 %	50 %	529229912
98	NC_021987	ATTA	2	8	37172	37179	50 %	50 %	0 %	0 %	529229913
99	NC_021987	CTTT	2	8	37647	37654	0 %	75 %	0 %	25 %	529229914
100	NC_021987	CTTC	2	8	37950	37957	0 %	50 %	0 %	50 %	529229914
101	NC_021987	GTTA	2	8	38326	38333	25 %	50 %	25 %	0 %	529229914
102	NC_021987	CATC	2	8	38627	38634	25 %	25 %	0 %	50 %	529229915
103	NC_021987	AAAT	2	8	38838	38845	75 %	25 %	0 %	0 %	529229915
104	NC_021987	GCTT	2	8	39150	39157	0 %	50 %	25 %	25 %	529229915
105	NC_021987	TTGG	2	8	39781	39788	0 %	50 %	50 %	0 %	529229916
106	NC_021987	TGCT	2	8	39853	39860	0 %	50 %	25 %	25 %	529229916
107	NC_021987	TACT	2	8	40290	40297	25 %	50 %	0 %	25 %	529229916
108	NC_021987	CATT	2	8	40341	40348	25 %	50 %	0 %	25 %	529229916
109	NC_021987	TTCA	2	8	40349	40356	25 %	50 %	0 %	25 %	529229916
110	NC_021987	GCTG	2	8	42363	42370	0 %	25 %	50 %	25 %	529229920
111	NC_021987	AGTG	2	8	42376	42383	25 %	25 %	50 %	0 %	529229920
112	NC_021987	AATA	3	12	42418	42429	75 %	25 %	0 %	0 %	529229920
113	NC_021987	TTGT	2	8	42771	42778	0 %	75 %	25 %	0 %	529229920
114	NC_021987	TGCT	2	8	43063	43070	0 %	50 %	25 %	25 %	529229920
115	NC_021987	TAAA	2	8	43119	43126	75 %	25 %	0 %	0 %	529229920
116	NC_021987	TTCC	2	8	43184	43191	0 %	50 %	0 %	50 %	529229920
117	NC_021987	ATTT	2	8	43957	43964	25 %	75 %	0 %	0 %	529229921
118	NC_021987	TATT	2	8	44048	44055	25 %	75 %	0 %	0 %	529229921
119	NC_021987	GAAA	2	8	44323	44330	75 %	0 %	25 %	0 %	529229921
120	NC_021987	GAAA	3	12	44446	44457	75 %	0 %	25 %	0 %	529229921
121	NC_021987	GATG	2	8	44974	44981	25 %	25 %	50 %	0 %	529229921
122	NC_021987	AAAC	2	8	45035	45042	75 %	0 %	0 %	25 %	529229921
123	NC_021987	TGAA	2	8	45799	45806	50 %	25 %	25 %	0 %	529229922
124	NC_021987	TTTC	3	12	46141	46152	0 %	75 %	0 %	25 %	529229922
125	NC_021987	ATTT	2	8	46222	46229	25 %	75 %	0 %	0 %	529229922
126	NC_021987	AAAT	2	8	46565	46572	75 %	25 %	0 %	0 %	529229922
127	NC_021987	TGAT	2	8	46778	46785	25 %	50 %	25 %	0 %	529229922
128	NC_021987	TAAT	2	8	47074	47081	50 %	50 %	0 %	0 %	529229922
129	NC_021987	ATTT	2	8	47241	47248	25 %	75 %	0 %	0 %	529229923
130	NC_021987	ATTT	2	8	47466	47473	25 %	75 %	0 %	0 %	529229923
131	NC_021987	ATAA	2	8	47499	47506	75 %	25 %	0 %	0 %	529229923
132	NC_021987	CACT	2	8	48229	48236	25 %	25 %	0 %	50 %	529247612
133	NC_021987	CAAG	2	8	48982	48989	50 %	0 %	25 %	25 %	529229926
134	NC_021987	TCTT	2	8	49035	49042	0 %	75 %	0 %	25 %	529229926
135	NC_021987	AAGC	2	8	49456	49463	50 %	0 %	25 %	25 %	529229927
136	NC_021987	AAAG	2	8	49483	49490	75 %	0 %	25 %	0 %	529229927
137	NC_021987	AAGA	2	8	49530	49537	75 %	0 %	25 %	0 %	529229927
138	NC_021987	CTTA	2	8	49980	49987	25 %	50 %	0 %	25 %	529229928
139	NC_021987	TTCT	2	8	51397	51404	0 %	75 %	0 %	25 %	529229930
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.