MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TAA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021987	TAA	2	6	1340	1345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021987	ATT	3	9	1383	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021987	ATT	2	6	1409	1414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021987	TTG	2	6	1514	1519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021987	AAG	3	9	1546	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021987	GAT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021987	ATT	2	6	2111	2116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021987	TAA	2	6	2121	2126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021987	TTA	2	6	2687	2692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021987	TAA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021987	CTT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021987	TGC	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021987	GTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021987	TGA	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021987	TCG	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021987	AGA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021987	GAA	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021987	CCG	2	6	4262	4267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021987	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021987	TAG	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021987	CAA	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021987	TAA	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021987	TTA	2	6	4865	4870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021987	TAG	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021987	ATT	2	6	4910	4915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021987	TAA	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021987	TCA	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021987	TAT	2	6	5168	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021987	GAG	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021987	TAT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021987	ATT	2	6	5277	5282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021987	TGA	2	6	5450	5455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021987	TGA	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021987	CAG	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021987	TTG	2	6	5592	5597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021987	TAC	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021987	CCT	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021987	ATT	2	6	5902	5907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021987	TAA	2	6	5945	5950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021987	CTC	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021987	GTA	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021987	TAA	2	6	7150	7155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021987	TCC	2	6	9581	9586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021987	TCC	2	6	10526	10531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021987	AAT	2	6	10539	10544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021987	ACT	2	6	10575	10580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021987	TCC	2	6	12783	12788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021987	TAG	2	6	13566	13571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021987	AAT	2	6	13682	13687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021987	TCA	2	6	13768	13773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021987	CAA	2	6	13776	13781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021987	ACT	2	6	13803	13808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021987	GGA	2	6	13839	13844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021987	TGT	2	6	14005	14010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021987	CTT	2	6	14209	14214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021987	CCT	2	6	14249	14254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021987	TCC	2	6	15462	15467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021987	TCT	2	6	15478	15483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021987	TTA	2	6	17098	17103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021987	AAC	2	6	17246	17251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021987	TCC	2	6	17357	17362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021987	ACC	2	6	17411	17416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021987	ACC	2	6	18784	18789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021987	TCA	2	6	18832	18837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021987	ATA	2	6	18899	18904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021987	TAT	2	6	18935	18940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021987	TTA	2	6	19282	19287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021987	AAT	2	6	19309	19314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021987	ATT	2	6	19346	19351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021987	ATT	2	6	20698	20703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021987	AGG	2	6	20708	20713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021987	ATT	2	6	20748	20753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021987	TAT	2	6	20802	20807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021987	CTA	2	6	20934	20939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021987	ATT	2	6	21136	21141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021987	ATA	2	6	21722	21727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021987	TTG	2	6	21786	21791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021987	TCC	2	6	22095	22100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021987	ATT	2	6	22113	22118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021987	TCT	2	6	22192	22197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021987	AAT	2	6	22252	22257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021987	ATG	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021987	TAT	3	9	22349	22357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021987	AAC	2	6	22368	22373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021987	ATT	2	6	22430	22435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021987	ATC	2	6	22481	22486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021987	ATT	2	6	22534	22539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021987	TAC	2	6	23919	23924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021987	TCC	2	6	24134	24139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_021987	TAT	2	6	25188	25193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021987	TTA	2	6	25198	25203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021987	CTT	2	6	25408	25413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021987	ATC	2	6	25827	25832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021987	CAA	2	6	28338	28343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021987	ATA	2	6	28350	28355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021987	TTA	2	6	29564	29569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021987	CTA	2	6	29625	29630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021987	AAT	2	6	29644	29649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021987	AGG	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021987	ATA	2	6	30411	30416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021987	CAT	2	6	31422	31427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021987	TAT	2	6	31491	31496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021987	TTA	2	6	31517	31522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021987	ACT	2	6	31551	31556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021987	ATT	3	9	31712	31720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021987	ATA	2	6	32478	32483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021987	TAA	2	6	32530	32535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021987	TGT	2	6	32589	32594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021987	CTA	2	6	32616	32621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021987	TTC	2	6	32629	32634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021987	GAA	2	6	32768	32773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021987	TTA	2	6	32814	32819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021987	TAT	2	6	32872	32877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021987	TGA	2	6	33010	33015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021987	CAT	2	6	33017	33022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021987	AGA	2	6	33095	33100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021987	ATC	2	6	34118	34123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021987	TCT	2	6	34158	34163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021987	CAC	2	6	34354	34359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021987	TTC	2	6	34962	34967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021987	GAA	2	6	34975	34980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021987	ACG	2	6	35014	35019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021987	TTA	2	6	35649	35654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021987	TTC	2	6	40357	40362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021987	CGA	2	6	40467	40472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021987	TAG	2	6	40508	40513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021987	AGA	2	6	41329	41334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021987	GTG	2	6	41337	41342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021987	GCA	2	6	41789	41794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021987	GAA	2	6	41796	41801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021987	GGA	2	6	42165	42170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021987	CTA	2	6	43645	43650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021987	GAT	2	6	43780	43785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021987	ACC	2	6	45673	45678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021987	AAC	2	6	48171	48176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021987	ATA	2	6	48190	48195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021987	AGA	2	6	48452	48457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021987	TCA	2	6	48567	48572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021987	TTC	2	6	48602	48607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021987	AAT	2	6	48614	48619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021987	TCT	2	6	48636	48641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.