MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021987	TC	3	6	1050	1055	0 %	50 %	0 %	50 %	529229873
2	NC_021987	AT	3	6	1162	1167	50 %	50 %	0 %	0 %	529229873
3	NC_021987	TA	3	6	2408	2413	50 %	50 %	0 %	0 %	529229875
4	NC_021987	TA	3	6	3708	3713	50 %	50 %	0 %	0 %	529229876
5	NC_021987	CA	3	6	3834	3839	50 %	0 %	0 %	50 %	529229876
6	NC_021987	TA	3	6	3885	3890	50 %	50 %	0 %	0 %	529229876
7	NC_021987	AT	3	6	6061	6066	50 %	50 %	0 %	0 %	529229878
8	NC_021987	TA	3	6	6103	6108	50 %	50 %	0 %	0 %	529229878
9	NC_021987	AG	3	6	6770	6775	50 %	0 %	50 %	0 %	529229878
10	NC_021987	TA	3	6	7079	7084	50 %	50 %	0 %	0 %	529229878
11	NC_021987	TA	3	6	8753	8758	50 %	50 %	0 %	0 %	529229880
12	NC_021987	TA	3	6	9846	9851	50 %	50 %	0 %	0 %	529229881
13	NC_021987	CT	3	6	10349	10354	0 %	50 %	0 %	50 %	529229881
14	NC_021987	GC	3	6	11495	11500	0 %	0 %	50 %	50 %	529229882
15	NC_021987	TA	3	6	13025	13030	50 %	50 %	0 %	0 %	529229884
16	NC_021987	CT	3	6	13416	13421	0 %	50 %	0 %	50 %	529229884
17	NC_021987	AT	3	6	15919	15924	50 %	50 %	0 %	0 %	529229887
18	NC_021987	AC	3	6	19609	19614	50 %	0 %	0 %	50 %	529229892
19	NC_021987	TA	3	6	23090	23095	50 %	50 %	0 %	0 %	529229896
20	NC_021987	AT	3	6	23236	23241	50 %	50 %	0 %	0 %	529229896
21	NC_021987	TC	3	6	23867	23872	0 %	50 %	0 %	50 %	529229897
22	NC_021987	CG	3	6	24259	24264	0 %	0 %	50 %	50 %	529229899
23	NC_021987	AG	3	6	24284	24289	50 %	0 %	50 %	0 %	529229899
24	NC_021987	AT	4	8	25017	25024	50 %	50 %	0 %	0 %	529229900
25	NC_021987	TA	3	6	25456	25461	50 %	50 %	0 %	0 %	529229901
26	NC_021987	AT	3	6	27520	27525	50 %	50 %	0 %	0 %	529229902
27	NC_021987	TA	3	6	27959	27964	50 %	50 %	0 %	0 %	529229902
28	NC_021987	AC	3	6	30001	30006	50 %	0 %	0 %	50 %	529229905
29	NC_021987	TA	3	6	30271	30276	50 %	50 %	0 %	0 %	529229905
30	NC_021987	CT	3	6	30298	30303	0 %	50 %	0 %	50 %	529229905
31	NC_021987	AT	3	6	30549	30554	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
32	NC_021987	TA	4	8	30650	30657	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
33	NC_021987	TA	3	6	30761	30766	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
34	NC_021987	AT	3	6	30781	30786	50 %	50 %	0 %	0 %	529247610
35	NC_021987	TC	3	6	31776	31781	0 %	50 %	0 %	50 %	529229907
36	NC_021987	TA	4	8	31848	31855	50 %	50 %	0 %	0 %	529229907
37	NC_021987	CT	3	6	32382	32387	0 %	50 %	0 %	50 %	529229907
38	NC_021987	AT	3	6	32422	32427	50 %	50 %	0 %	0 %	529229907
39	NC_021987	GC	3	6	36264	36269	0 %	0 %	50 %	50 %	529229912
40	NC_021987	TG	3	6	38273	38278	0 %	50 %	50 %	0 %	529229914
41	NC_021987	AT	3	6	39461	39466	50 %	50 %	0 %	0 %	529229916
42	NC_021987	TC	3	6	40188	40193	0 %	50 %	0 %	50 %	529229916
43	NC_021987	TA	3	6	40693	40698	50 %	50 %	0 %	0 %	529229917
44	NC_021987	TG	3	6	44891	44896	0 %	50 %	50 %	0 %	529229921
45	NC_021987	AT	3	6	45793	45798	50 %	50 %	0 %	0 %	529229922
46	NC_021987	AT	3	6	45997	46002	50 %	50 %	0 %	0 %	529229922
47	NC_021987	TC	3	6	46302	46307	0 %	50 %	0 %	50 %	529229922
48	NC_021987	AT	3	6	47271	47276	50 %	50 %	0 %	0 %	529229923
49	NC_021987	AT	3	6	47538	47543	50 %	50 %	0 %	0 %	529229923
50	NC_021987	AT	3	6	47775	47780	50 %	50 %	0 %	0 %	529229923
51	NC_021987	AT	3	6	48216	48221	50 %	50 %	0 %	0 %	529247612
52	NC_021987	AT	3	6	49046	49051	50 %	50 %	0 %	0 %	529229926
53	NC_021987	TA	3	6	51337	51342	50 %	50 %	0 %	0 %	529229930
54	NC_021987	AT	3	6	53808	53813	50 %	50 %	0 %	0 %	529229935
55	NC_021987	TA	3	6	55689	55694	50 %	50 %	0 %	0 %	529229937
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57	NC_021987	TA	3	6	56145	56150	50 %	50 %	0 %	0 %	529229938
58	NC_021987	AT	3	6	59651	59656	50 %	50 %	0 %	0 %	529229942
59	NC_021987	TA	3	6	60027	60032	50 %	50 %	0 %	0 %	529229942
60	NC_021987	AT	3	6	60671	60676	50 %	50 %	0 %	0 %	529229942
61	NC_021987	TC	3	6	63384	63389	0 %	50 %	0 %	50 %	529229948
62	NC_021987	TC	3	6	64714	64719	0 %	50 %	0 %	50 %	529229948
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67	NC_021987	AT	3	6	66950	66955	50 %	50 %	0 %	0 %	529229952
68	NC_021987	TA	3	6	67007	67012	50 %	50 %	0 %	0 %	529229952
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70	NC_021987	TC	3	6	67810	67815	0 %	50 %	0 %	50 %	529229953
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73	NC_021987	AT	3	6	69959	69964	50 %	50 %	0 %	0 %	529229955
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77	NC_021987	AT	3	6	72105	72110	50 %	50 %	0 %	0 %	529229957
78	NC_021987	TA	3	6	72188	72193	50 %	50 %	0 %	0 %	529229957
79	NC_021987	GC	3	6	72421	72426	0 %	0 %	50 %	50 %	529229957
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81	NC_021987	CT	3	6	74496	74501	0 %	50 %	0 %	50 %	529229962
82	NC_021987	TA	3	6	74596	74601	50 %	50 %	0 %	0 %	529229963
83	NC_021987	TA	3	6	74743	74748	50 %	50 %	0 %	0 %	529229963
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91	NC_021987	GA	3	6	81204	81209	50 %	0 %	50 %	0 %	529229969
92	NC_021987	AG	3	6	81554	81559	50 %	0 %	50 %	0 %	529229970
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95	NC_021987	AT	3	6	90067	90072	50 %	50 %	0 %	0 %	529229983
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103	NC_021987	AT	3	6	99837	99842	50 %	50 %	0 %	0 %	529229994
104	NC_021987	AT	3	6	101062	101067	50 %	50 %	0 %	0 %	529229996
105	NC_021987	AG	3	6	101260	101265	50 %	0 %	50 %	0 %	529229996
106	NC_021987	AG	3	6	102501	102506	50 %	0 %	50 %	0 %	529229998
107	NC_021987	AG	3	6	107148	107153	50 %	0 %	50 %	0 %	529230001
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113	NC_021987	TG	3	6	113615	113620	0 %	50 %	50 %	0 %	529230005
114	NC_021987	GA	3	6	114825	114830	50 %	0 %	50 %	0 %	529230006
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117	NC_021987	AT	3	6	117306	117311	50 %	50 %	0 %	0 %	529247616
118	NC_021987	TC	3	6	117491	117496	0 %	50 %	0 %	50 %	529247616
119	NC_021987	CA	3	6	117720	117725	50 %	0 %	0 %	50 %	529247616
120	NC_021987	CA	3	6	117929	117934	50 %	0 %	0 %	50 %	529230010
121	NC_021987	GA	3	6	118650	118655	50 %	0 %	50 %	0 %	529230011
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123	NC_021987	GA	3	6	119638	119643	50 %	0 %	50 %	0 %	529230012
124	NC_021987	TG	3	6	119799	119804	0 %	50 %	50 %	0 %	529230013
125	NC_021987	GT	3	6	119914	119919	0 %	50 %	50 %	0 %	529230013
126	NC_021987	AT	3	6	124010	124015	50 %	50 %	0 %	0 %	529230023
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128	NC_021987	AT	3	6	124956	124961	50 %	50 %	0 %	0 %	529230025
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131	NC_021987	AC	3	6	126989	126994	50 %	0 %	0 %	50 %	529230028
132	NC_021987	TA	3	6	128612	128617	50 %	50 %	0 %	0 %	529230030
133	NC_021987	TA	3	6	130036	130041	50 %	50 %	0 %	0 %	529230032
134	NC_021987	GT	3	6	130142	130147	0 %	50 %	50 %	0 %	529230032

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.