MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021986	ACGG	2	8	54	61	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021986	CCGG	2	8	197	204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021986	CGGC	2	8	215	222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021986	GGGA	2	8	1075	1082	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021986	GACG	2	8	1515	1522	25 %	0 %	50 %	25 %	529229841
6	NC_021986	CGGG	2	8	2089	2096	0 %	0 %	75 %	25 %	529229842
7	NC_021986	CACC	2	8	2585	2592	25 %	0 %	0 %	75 %	529229842
8	NC_021986	GATG	2	8	2863	2870	25 %	25 %	50 %	0 %	529229842
9	NC_021986	CCGG	2	8	3113	3120	0 %	0 %	50 %	50 %	529229842
10	NC_021986	CCGG	2	8	3244	3251	0 %	0 %	50 %	50 %	529229842
11	NC_021986	CCGG	2	8	3282	3289	0 %	0 %	50 %	50 %	529229842
12	NC_021986	TCAC	2	8	3835	3842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021986	ACCT	2	8	4365	4372	25 %	25 %	0 %	50 %	529229844
14	NC_021986	CGTG	2	8	4591	4598	0 %	25 %	50 %	25 %	529229844
15	NC_021986	CGGT	2	8	4647	4654	0 %	25 %	50 %	25 %	529229844
16	NC_021986	ACGG	2	8	5593	5600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021986	GGCC	2	8	5929	5936	0 %	0 %	50 %	50 %	529229846
18	NC_021986	CCGG	2	8	6534	6541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021986	CCCA	2	8	6648	6655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_021986	ACCT	2	8	7086	7093	25 %	25 %	0 %	50 %	529229847
21	NC_021986	GGCC	2	8	8128	8135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021986	TGCC	2	8	8138	8145	0 %	25 %	25 %	50 %	529229849
23	NC_021986	GGGC	2	8	8304	8311	0 %	0 %	75 %	25 %	529229849
24	NC_021986	CCGG	2	8	8655	8662	0 %	0 %	50 %	50 %	529229850
25	NC_021986	CCGG	2	8	8797	8804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021986	ATCA	2	8	9512	9519	50 %	25 %	0 %	25 %	529229852
27	NC_021986	AGGG	2	8	10187	10194	25 %	0 %	75 %	0 %	529229853
28	NC_021986	GTGG	2	8	10255	10262	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021986	GCCC	2	8	10607	10614	0 %	0 %	25 %	75 %	529229854
30	NC_021986	GGCG	2	8	10855	10862	0 %	0 %	75 %	25 %	529229855
31	NC_021986	GGGC	2	8	10872	10879	0 %	0 %	75 %	25 %	529229855
32	NC_021986	CCGG	2	8	11105	11112	0 %	0 %	50 %	50 %	529229855
33	NC_021986	CGTC	2	8	11133	11140	0 %	25 %	25 %	50 %	529229855
34	NC_021986	GGTG	2	8	12266	12273	0 %	25 %	75 %	0 %	529229858
35	NC_021986	GGAC	2	8	12496	12503	25 %	0 %	50 %	25 %	529229858
36	NC_021986	CCGG	2	8	14846	14853	0 %	0 %	50 %	50 %	529229860
37	NC_021986	CCGG	2	8	15143	15150	0 %	0 %	50 %	50 %	529229861
38	NC_021986	GGCC	2	8	15942	15949	0 %	0 %	50 %	50 %	529229864
39	NC_021986	CGGG	2	8	18510	18517	0 %	0 %	75 %	25 %	529229870
40	NC_021986	CGGC	2	8	18958	18965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021986	CCAC	2	8	19198	19205	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.