MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 2342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021984	AGGTA	2	10	2443	2452	40 %	20 %	40 %	0 %	529218782
2	NC_021984	CGGCG	2	10	4012	4021	0 %	0 %	60 %	40 %	529218783
3	NC_021984	CCGCG	2	10	7052	7061	0 %	0 %	40 %	60 %	529218785
4	NC_021984	GCGTG	2	10	13836	13845	0 %	20 %	60 %	20 %	529218791
5	NC_021984	GGCTG	2	10	18698	18707	0 %	20 %	60 %	20 %	529218796
6	NC_021984	AGAGC	2	10	19219	19228	40 %	0 %	40 %	20 %	529218796
7	NC_021984	CCTGA	2	10	19760	19769	20 %	20 %	20 %	40 %	529218796
8	NC_021984	CTTTT	2	10	23240	23249	0 %	80 %	0 %	20 %	529218797
9	NC_021984	CGGTA	2	10	24408	24417	20 %	20 %	40 %	20 %	529218798
10	NC_021984	CTGTT	2	10	24447	24456	0 %	60 %	20 %	20 %	529218798
11	NC_021984	TATTT	2	10	25281	25290	20 %	80 %	0 %	0 %	529218799
12	NC_021984	ATCTG	2	10	30810	30819	20 %	40 %	20 %	20 %	529218804
13	NC_021984	TTACG	2	10	30865	30874	20 %	40 %	20 %	20 %	529218804
14	NC_021984	GGGCG	2	10	31633	31642	0 %	0 %	80 %	20 %	529218805
15	NC_021984	TGCGT	2	10	32012	32021	0 %	40 %	40 %	20 %	529221971
16	NC_021984	AAAAG	2	10	32406	32415	80 %	0 %	20 %	0 %	529218806
17	NC_021984	TATAA	2	10	34009	34018	60 %	40 %	0 %	0 %	529221972
18	NC_021984	AGCGA	2	10	35435	35444	40 %	0 %	40 %	20 %	529221973
19	NC_021984	TCCTG	2	10	35645	35654	0 %	40 %	20 %	40 %	529221973
20	NC_021984	GGTCA	2	10	37880	37889	20 %	20 %	40 %	20 %	529218808
21	NC_021984	TTCAT	2	10	39152	39161	20 %	60 %	0 %	20 %	529218809
22	NC_021984	TGAAA	2	10	39968	39977	60 %	20 %	20 %	0 %	529218810
23	NC_021984	ACGGC	2	10	44328	44337	20 %	0 %	40 %	40 %	529221974
24	NC_021984	TTTTA	2	10	44654	44663	20 %	80 %	0 %	0 %	529221974
25	NC_021984	GGGCT	2	10	46402	46411	0 %	20 %	60 %	20 %	529218813
26	NC_021984	GCGTA	2	10	48278	48287	20 %	20 %	40 %	20 %	529218815
27	NC_021984	GACCA	2	10	48883	48892	40 %	0 %	20 %	40 %	529218815
28	NC_021984	CCGGC	2	10	49025	49034	0 %	0 %	40 %	60 %	529218815
29	NC_021984	CAGAC	2	10	50215	50224	40 %	0 %	20 %	40 %	529218815
30	NC_021984	TGTGC	2	10	52974	52983	0 %	40 %	40 %	20 %	529218816
31	NC_021984	GTTTG	2	10	55296	55305	0 %	60 %	40 %	0 %	529218817
32	NC_021984	CACTA	2	10	56427	56436	40 %	20 %	0 %	40 %	529218817
33	NC_021984	CGGCG	2	10	56965	56974	0 %	0 %	60 %	40 %	529218818
34	NC_021984	TTCAC	2	10	57220	57229	20 %	40 %	0 %	40 %	529218819
35	NC_021984	AAAAT	2	10	58791	58800	80 %	20 %	0 %	0 %	529218821
36	NC_021984	GGAAA	2	10	59578	59587	60 %	0 %	40 %	0 %	529218821
37	NC_021984	CGCTG	2	10	60068	60077	0 %	20 %	40 %	40 %	529218822
38	NC_021984	GCGCG	2	10	64780	64789	0 %	0 %	60 %	40 %	529221977
39	NC_021984	CGTGC	2	10	71104	71113	0 %	20 %	40 %	40 %	529218828
40	NC_021984	TTGAT	2	10	71274	71283	20 %	60 %	20 %	0 %	529218828
41	NC_021984	ACCGC	2	10	71834	71843	20 %	0 %	20 %	60 %	529218828
42	NC_021984	CTGGT	2	10	72786	72795	0 %	40 %	40 %	20 %	529218830
43	NC_021984	TTGCC	2	10	80761	80770	0 %	40 %	20 %	40 %	529218834
44	NC_021984	CGTCC	2	10	80871	80880	0 %	20 %	20 %	60 %	529218834
45	NC_021984	TCAGC	2	10	83990	83999	20 %	20 %	20 %	40 %	529221979
46	NC_021984	GGCCA	2	10	84138	84147	20 %	0 %	40 %	40 %	529221979
47	NC_021984	TGGCG	2	10	91806	91815	0 %	20 %	60 %	20 %	529218840
48	NC_021984	GCGCT	2	10	97439	97448	0 %	20 %	40 %	40 %	529221980
49	NC_021984	AGCGC	2	10	97506	97515	20 %	0 %	40 %	40 %	529221980
50	NC_021984	TGCAC	2	10	98204	98213	20 %	20 %	20 %	40 %	529218844
51	NC_021984	TGGCA	2	10	98273	98282	20 %	20 %	40 %	20 %	529218844
52	NC_021984	TCTGT	2	10	98599	98608	0 %	60 %	20 %	20 %	529218845
53	NC_021984	GCGCT	2	10	98909	98918	0 %	20 %	40 %	40 %	529218845
54	NC_021984	GGCGC	2	10	99323	99332	0 %	0 %	60 %	40 %	529218845
55	NC_021984	AACGT	2	10	102093	102102	40 %	20 %	20 %	20 %	529218848
56	NC_021984	CCCAA	2	10	104243	104252	40 %	0 %	0 %	60 %	529218851
57	NC_021984	TTGTT	2	10	104950	104959	0 %	80 %	20 %	0 %	529218851
58	NC_021984	GCTTC	2	10	106330	106339	0 %	40 %	20 %	40 %	529218852
59	NC_021984	TGCGT	2	10	106617	106626	0 %	40 %	40 %	20 %	529218852
60	NC_021984	TGATC	2	10	108317	108326	20 %	40 %	20 %	20 %	529218853
61	NC_021984	TGGCG	2	10	111477	111486	0 %	20 %	60 %	20 %	529218855
62	NC_021984	AGCGC	2	10	112037	112046	20 %	0 %	40 %	40 %	529218855
63	NC_021984	ACGTT	2	10	112854	112863	20 %	40 %	20 %	20 %	529218856
64	NC_021984	CCGCG	2	10	113122	113131	0 %	0 %	40 %	60 %	529218856
65	NC_021984	GGGGT	2	10	114518	114527	0 %	20 %	80 %	0 %	529218856
66	NC_021984	ACAGA	2	10	116248	116257	60 %	0 %	20 %	20 %	529218858
67	NC_021984	CAGCG	2	10	117423	117432	20 %	0 %	40 %	40 %	529218860
68	NC_021984	GCCGG	2	10	117699	117708	0 %	0 %	60 %	40 %	529218860
69	NC_021984	CGAGC	2	10	117824	117833	20 %	0 %	40 %	40 %	529218860
70	NC_021984	ATTTG	2	10	118267	118276	20 %	60 %	20 %	0 %	529218860
71	NC_021984	TTGCC	2	10	122770	122779	0 %	40 %	20 %	40 %	529221981
72	NC_021984	AGCAG	2	10	123447	123456	40 %	0 %	40 %	20 %	529218864
73	NC_021984	AGTTT	2	10	125677	125686	20 %	60 %	20 %	0 %	529218865
74	NC_021984	TCGAT	2	10	127525	127534	20 %	40 %	20 %	20 %	529218866
75	NC_021984	ATTGG	2	10	130858	130867	20 %	40 %	40 %	0 %	529218867
76	NC_021984	AAAGC	2	10	137991	138000	60 %	0 %	20 %	20 %	529218870
77	NC_021984	CCGCA	2	10	138524	138533	20 %	0 %	20 %	60 %	529218870
78	NC_021984	AGTTC	2	10	140895	140904	20 %	40 %	20 %	20 %	529218872
79	NC_021984	TGCCT	2	10	140995	141004	0 %	40 %	20 %	40 %	529221984
80	NC_021984	AAGCG	2	10	145647	145656	40 %	0 %	40 %	20 %	529218875
81	NC_021984	GTTTG	2	10	147550	147559	0 %	60 %	40 %	0 %	529221985
82	NC_021984	ATCAG	2	10	150813	150822	40 %	20 %	20 %	20 %	529218877
83	NC_021984	CGGCG	2	10	155552	155561	0 %	0 %	60 %	40 %	529218880
84	NC_021984	CCGGC	2	10	158906	158915	0 %	0 %	40 %	60 %	529218883
85	NC_021984	CGCTG	2	10	159798	159807	0 %	20 %	40 %	40 %	529218883
86	NC_021984	GATCA	2	10	163949	163958	40 %	20 %	20 %	20 %	529218886
87	NC_021984	CGTCA	2	10	164695	164704	20 %	20 %	20 %	40 %	529218887
88	NC_021984	ATCCC	2	10	166395	166404	20 %	20 %	0 %	60 %	529218889
89	NC_021984	AGCGC	2	10	167103	167112	20 %	0 %	40 %	40 %	529218889
90	NC_021984	TGAGC	2	10	168952	168961	20 %	20 %	40 %	20 %	529218890
91	NC_021984	CGCAT	2	10	169214	169223	20 %	20 %	20 %	40 %	529218891
92	NC_021984	CGAAC	2	10	169943	169952	40 %	0 %	20 %	40 %	529218892
93	NC_021984	GTTCA	2	10	170209	170218	20 %	40 %	20 %	20 %	529218892
94	NC_021984	ATGAC	2	10	171175	171184	40 %	20 %	20 %	20 %	529218893
95	NC_021984	CTGGA	2	10	171765	171774	20 %	20 %	40 %	20 %	529218894
96	NC_021984	CAGAA	2	10	173865	173874	60 %	0 %	20 %	20 %	529218895
97	NC_021984	CGAAG	2	10	176736	176745	40 %	0 %	40 %	20 %	529218897
98	NC_021984	GACTG	2	10	178537	178546	20 %	20 %	40 %	20 %	529218898
99	NC_021984	AGCAA	2	10	178949	178958	60 %	0 %	20 %	20 %	529218898
100	NC_021984	GGCAT	2	10	184305	184314	20 %	20 %	40 %	20 %	529218901
101	NC_021984	GGCCA	2	10	184727	184736	20 %	0 %	40 %	40 %	529218902
102	NC_021984	GCGCC	2	10	184740	184749	0 %	0 %	40 %	60 %	529218902
103	NC_021984	CGTTT	2	10	185242	185251	0 %	60 %	20 %	20 %	529218902
104	NC_021984	GGGGA	2	10	185294	185303	20 %	0 %	80 %	0 %	529218902
105	NC_021984	CGGCG	2	10	192216	192225	0 %	0 %	60 %	40 %	529218904
106	NC_021984	CCGCT	2	10	192923	192932	0 %	20 %	20 %	60 %	529218904
107	NC_021984	GCCCA	2	10	195406	195415	20 %	0 %	20 %	60 %	529218905
108	NC_021984	GCGCA	2	10	195811	195820	20 %	0 %	40 %	40 %	529218905
109	NC_021984	ATCGG	2	10	197202	197211	20 %	20 %	40 %	20 %	529218907
110	NC_021984	GCCGC	2	10	198412	198421	0 %	0 %	40 %	60 %	529218909
111	NC_021984	ATCCA	2	10	203762	203771	40 %	20 %	0 %	40 %	529218912
112	NC_021984	CGGCG	2	10	205882	205891	0 %	0 %	60 %	40 %	529218915
113	NC_021984	TGGTC	2	10	206748	206757	0 %	40 %	40 %	20 %	529218915
114	NC_021984	GTGTT	2	10	209781	209790	0 %	60 %	40 %	0 %	529218916
115	NC_021984	CGGCG	2	10	211311	211320	0 %	0 %	60 %	40 %	529218918
116	NC_021984	TTCGG	2	10	212191	212200	0 %	40 %	40 %	20 %	529218919
117	NC_021984	CTTGC	2	10	213200	213209	0 %	40 %	20 %	40 %	529218920
118	NC_021984	TGAGC	2	10	213612	213621	20 %	20 %	40 %	20 %	529218921
119	NC_021984	CGGCA	2	10	214697	214706	20 %	0 %	40 %	40 %	529218922
120	NC_021984	GCACG	2	10	214876	214885	20 %	0 %	40 %	40 %	529218922
121	NC_021984	AGATC	2	10	215281	215290	40 %	20 %	20 %	20 %	529218923
122	NC_021984	CGCGG	2	10	215703	215712	0 %	0 %	60 %	40 %	529218924
123	NC_021984	CGCGG	2	10	215887	215896	0 %	0 %	60 %	40 %	529218924
124	NC_021984	GCCAG	2	10	217871	217880	20 %	0 %	40 %	40 %	529218925
125	NC_021984	GCGCG	2	10	218437	218446	0 %	0 %	60 %	40 %	529218926
126	NC_021984	CGGGG	2	10	220255	220264	0 %	0 %	80 %	20 %	529218929
127	NC_021984	GCGAA	2	10	222375	222384	40 %	0 %	40 %	20 %	529218929
128	NC_021984	CAGCG	2	10	222438	222447	20 %	0 %	40 %	40 %	529218929
129	NC_021984	GGCGG	2	10	224188	224197	0 %	0 %	80 %	20 %	529221992
130	NC_021984	TCACC	2	10	235445	235454	20 %	20 %	0 %	60 %	529218931
131	NC_021984	GCCGC	2	10	236128	236137	0 %	0 %	40 %	60 %	529218932
132	NC_021984	CAGGT	2	10	238952	238961	20 %	20 %	40 %	20 %	529218934
133	NC_021984	CGGCG	2	10	240445	240454	0 %	0 %	60 %	40 %	529218935
134	NC_021984	TGCTT	2	10	240939	240948	0 %	60 %	20 %	20 %	529218935
135	NC_021984	CGGCG	2	10	251281	251290	0 %	0 %	60 %	40 %	529218944
136	NC_021984	TTCGG	2	10	253834	253843	0 %	40 %	40 %	20 %	529218945
137	NC_021984	CTGAA	2	10	255677	255686	40 %	20 %	20 %	20 %	529218947
138	NC_021984	AAGCG	2	10	255741	255750	40 %	0 %	40 %	20 %	529218947
139	NC_021984	TGGTG	2	10	257645	257654	0 %	40 %	60 %	0 %	529218949
140	NC_021984	ATGGC	2	10	259913	259922	20 %	20 %	40 %	20 %	530331563
141	NC_021984	ACTTT	2	10	261208	261217	20 %	60 %	0 %	20 %	529218952
142	NC_021984	TACGG	2	10	265121	265130	20 %	20 %	40 %	20 %	529218955
143	NC_021984	TCCAG	2	10	267155	267164	20 %	20 %	20 %	40 %	529218957
144	NC_021984	GTGAA	2	10	268436	268445	40 %	20 %	40 %	0 %	529218959
145	NC_021984	ATGCC	2	10	269527	269536	20 %	20 %	20 %	40 %	529218960
146	NC_021984	CCGCG	2	10	273465	273474	0 %	0 %	40 %	60 %	529218962
147	NC_021984	GCCGC	2	10	275491	275500	0 %	0 %	40 %	60 %	529218964
148	NC_021984	GCCGG	2	10	276721	276730	0 %	0 %	60 %	40 %	529218964
149	NC_021984	TGCTC	2	10	279290	279299	0 %	40 %	20 %	40 %	529218965
150	NC_021984	TCCCT	2	10	279637	279646	0 %	40 %	0 %	60 %	529218966
151	NC_021984	GACCA	2	10	286149	286158	40 %	0 %	20 %	40 %	529218971
152	NC_021984	CACCG	2	10	286767	286776	20 %	0 %	20 %	60 %	529218972
153	NC_021984	GGTCG	2	10	287151	287160	0 %	20 %	60 %	20 %	529218972
154	NC_021984	GATTT	2	10	287203	287212	20 %	60 %	20 %	0 %	529218972
155	NC_021984	ACCAG	2	10	287823	287832	40 %	0 %	20 %	40 %	529218973
156	NC_021984	GGCGC	2	10	287958	287967	0 %	0 %	60 %	40 %	529218973
157	NC_021984	CTATG	2	10	297472	297481	20 %	40 %	20 %	20 %	529218976
158	NC_021984	AAAGG	2	10	297816	297825	60 %	0 %	40 %	0 %	529218976
159	NC_021984	CGCTG	2	10	297994	298003	0 %	20 %	40 %	40 %	529218977
160	NC_021984	AACCC	2	10	299876	299885	40 %	0 %	0 %	60 %	529218979
161	NC_021984	GGCCA	2	10	300652	300661	20 %	0 %	40 %	40 %	529218979
162	NC_021984	GGCGC	2	10	301444	301453	0 %	0 %	60 %	40 %	529218979
163	NC_021984	CGGGA	2	10	301911	301920	20 %	0 %	60 %	20 %	529218979
164	NC_021984	GGCCA	2	10	302161	302170	20 %	0 %	40 %	40 %	529218979
165	NC_021984	CGCCC	2	10	303915	303924	0 %	0 %	20 %	80 %	529218981
166	NC_021984	GCGCT	2	10	304197	304206	0 %	20 %	40 %	40 %	529218981
167	NC_021984	GGCGG	2	10	304503	304512	0 %	0 %	80 %	20 %	529218981
168	NC_021984	GCCTG	2	10	305216	305225	0 %	20 %	40 %	40 %	529218982
169	NC_021984	GCTTG	2	10	308020	308029	0 %	40 %	40 %	20 %	529218985
170	NC_021984	ATCGC	2	10	308732	308741	20 %	20 %	20 %	40 %	529218985
171	NC_021984	GCCGC	2	10	311737	311746	0 %	0 %	40 %	60 %	529218987
172	NC_021984	ACGCT	2	10	317115	317124	20 %	20 %	20 %	40 %	529218993
173	NC_021984	GCTAC	2	10	319935	319944	20 %	20 %	20 %	40 %	529218996
174	NC_021984	TGAAA	2	10	321200	321209	60 %	20 %	20 %	0 %	529218997
175	NC_021984	TTAAT	2	10	322781	322790	40 %	60 %	0 %	0 %	529219000
176	NC_021984	TATTT	2	10	323969	323978	20 %	80 %	0 %	0 %	529219001
177	NC_021984	CTTTT	2	10	329901	329910	0 %	80 %	0 %	20 %	529219005
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181	NC_021984	AGCGC	2	10	337646	337655	20 %	0 %	40 %	40 %	529222002
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193	NC_021984	CGCCA	2	10	354846	354855	20 %	0 %	20 %	60 %	529219019
194	NC_021984	CAGCG	2	10	355116	355125	20 %	0 %	40 %	40 %	529219019
195	NC_021984	ATTAC	2	10	359189	359198	40 %	40 %	0 %	20 %	529219020
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198	NC_021984	AAATA	2	10	362552	362561	80 %	20 %	0 %	0 %	529219024
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203	NC_021984	CCGTA	2	10	366461	366470	20 %	20 %	20 %	40 %	529219030
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212	NC_021984	CCAGC	2	10	371380	371389	20 %	0 %	20 %	60 %	529219033
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236	NC_021984	CTTCC	2	10	429795	429804	0 %	40 %	0 %	60 %	529219054
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240	NC_021984	TGCCC	2	10	439097	439106	0 %	20 %	20 %	60 %	529222013
241	NC_021984	TTCAT	2	10	441489	441498	20 %	60 %	0 %	20 %	529219062
242	NC_021984	GCCGC	2	10	443023	443032	0 %	0 %	40 %	60 %	529219064
243	NC_021984	CGCTA	2	10	443184	443193	20 %	20 %	20 %	40 %	529219064
244	NC_021984	GGCGC	2	10	448576	448585	0 %	0 %	60 %	40 %	529219067
245	NC_021984	TGACC	2	10	459305	459314	20 %	20 %	20 %	40 %	529219070
246	NC_021984	CAACT	2	10	459389	459398	40 %	20 %	0 %	40 %	529219070
247	NC_021984	GCGCC	2	10	462583	462592	0 %	0 %	40 %	60 %	529219071
248	NC_021984	ATCCG	2	10	466119	466128	20 %	20 %	20 %	40 %	529219073
249	NC_021984	GCCTG	2	10	468775	468784	0 %	20 %	40 %	40 %	529219076
250	NC_021984	CGCGC	2	10	469137	469146	0 %	0 %	40 %	60 %	529219077
251	NC_021984	ACGCC	2	10	474223	474232	20 %	0 %	20 %	60 %	529219080
252	NC_021984	GGCCA	2	10	474435	474444	20 %	0 %	40 %	40 %	529219080
253	NC_021984	GTTCG	2	10	476665	476674	0 %	40 %	40 %	20 %	529219081
254	NC_021984	GCGCC	2	10	478961	478970	0 %	0 %	40 %	60 %	529219082
255	NC_021984	GCGCA	2	10	480599	480608	20 %	0 %	40 %	40 %	529219083
256	NC_021984	TTCTG	2	10	485260	485269	0 %	60 %	20 %	20 %	529219086
257	NC_021984	GGCAG	2	10	488528	488537	20 %	0 %	60 %	20 %	529219089
258	NC_021984	CGCGA	2	10	491493	491502	20 %	0 %	40 %	40 %	529219091
259	NC_021984	GCGAG	2	10	492743	492752	20 %	0 %	60 %	20 %	529219092
260	NC_021984	GCAGC	2	10	495979	495988	20 %	0 %	40 %	40 %	529219095
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262	NC_021984	ATCAT	2	10	498886	498895	40 %	40 %	0 %	20 %	529219099
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388	NC_021984	TGTTC	2	10	781616	781625	0 %	60 %	20 %	20 %	529219295
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