MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 52626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021984	CGG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
2	NC_021984	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
3	NC_021984	GAT	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
4	NC_021984	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
5	NC_021984	CTG	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
6	NC_021984	CGC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
7	NC_021984	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
8	NC_021984	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
9	NC_021984	TGG	2	6	822	827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
10	NC_021984	CCG	3	9	855	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
11	NC_021984	GCC	2	6	869	874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
12	NC_021984	CTG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
13	NC_021984	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
14	NC_021984	TTC	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
15	NC_021984	CGA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
16	NC_021984	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218782
17	NC_021984	GAT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
18	NC_021984	GGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
19	NC_021984	CGC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
20	NC_021984	GGT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
21	NC_021984	TCC	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218782
22	NC_021984	CCG	2	6	1336	1341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
23	NC_021984	GCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
24	NC_021984	TGT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218782
25	NC_021984	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
26	NC_021984	TCT	2	6	1526	1531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218782
27	NC_021984	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218782
28	NC_021984	ACG	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
29	NC_021984	CCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218782
30	NC_021984	CGG	2	6	1645	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
31	NC_021984	CGG	2	6	1654	1659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
32	NC_021984	GAA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218782
33	NC_021984	GCG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
34	NC_021984	ATC	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218782
35	NC_021984	TTG	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218782
36	NC_021984	TCG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
37	NC_021984	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218782
38	NC_021984	CGC	3	9	2008	2016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
39	NC_021984	CTG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
40	NC_021984	TGA	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
41	NC_021984	GAC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218782
42	NC_021984	GCC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218782
43	NC_021984	TGA	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
44	NC_021984	TAT	2	6	2576	2581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218782
45	NC_021984	TGC	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218782
46	NC_021984	ATG	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218782
47	NC_021984	CGG	3	9	2631	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218782
48	NC_021984	CAG	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218783
49	NC_021984	TGA	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
50	NC_021984	GCA	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218783
51	NC_021984	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
52	NC_021984	GCG	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
53	NC_021984	GTC	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
54	NC_021984	GGC	2	6	4121	4126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
55	NC_021984	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
56	NC_021984	GAA	2	6	4199	4204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218783
57	NC_021984	GCC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
58	NC_021984	CTA	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218783
59	NC_021984	CTG	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
60	NC_021984	CGC	2	6	4411	4416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
61	NC_021984	GGA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218783
62	NC_021984	CCG	2	6	4549	4554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
63	NC_021984	GCG	2	6	4586	4591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
64	NC_021984	ACA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218783
65	NC_021984	GCG	2	6	4661	4666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218783
66	NC_021984	GCT	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218783
67	NC_021984	CAT	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218783
68	NC_021984	GCC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218783
69	NC_021984	TGA	3	9	4869	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218783
70	NC_021984	TCA	2	6	5031	5036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
71	NC_021984	AAT	2	6	5096	5101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218784
72	NC_021984	TCA	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
73	NC_021984	ACC	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218784
74	NC_021984	TCA	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218784
75	NC_021984	TTC	2	6	5208	5213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218784
76	NC_021984	CAC	3	9	5252	5260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218784
77	NC_021984	TGT	2	6	5436	5441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218784
78	NC_021984	CGT	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218784
79	NC_021984	GCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218784
80	NC_021984	GCT	2	6	5656	5661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218784
81	NC_021984	CGC	2	6	5846	5851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218785
82	NC_021984	ACC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218785
83	NC_021984	CAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218785
84	NC_021984	TGA	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
85	NC_021984	CGA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
86	NC_021984	CAG	2	6	6305	6310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
87	NC_021984	ATC	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218785
88	NC_021984	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
89	NC_021984	ACG	2	6	6403	6408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
90	NC_021984	GAT	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
91	NC_021984	GCG	2	6	6730	6735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218785
92	NC_021984	CGA	2	6	6808	6813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
93	NC_021984	GCC	2	6	6881	6886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218785
94	NC_021984	AGG	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218785
95	NC_021984	ATG	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218785
96	NC_021984	GCG	2	6	7008	7013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218785
97	NC_021984	GCC	2	6	7094	7099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218785
98	NC_021984	AGC	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218785
99	NC_021984	TAA	2	6	7240	7245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218785
100	NC_021984	CAC	2	6	7565	7570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218786
101	NC_021984	AGC	2	6	7711	7716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218786
102	NC_021984	AGC	2	6	7719	7724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218786
103	NC_021984	CAG	2	6	7734	7739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218786
104	NC_021984	GTT	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218786
105	NC_021984	ATG	2	6	7891	7896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218786
106	NC_021984	AAG	2	6	7975	7980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218786
107	NC_021984	GCT	2	6	8000	8005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218786
108	NC_021984	TAC	2	6	8166	8171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218786
109	NC_021984	CGT	2	6	8192	8197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218786
110	NC_021984	GCA	2	6	8381	8386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218786
111	NC_021984	CTG	2	6	8478	8483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218786
112	NC_021984	GCG	2	6	8646	8651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218787
113	NC_021984	GAG	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218787
114	NC_021984	GCG	2	6	8725	8730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218787
115	NC_021984	TGA	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218787
116	NC_021984	TGA	2	6	8782	8787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218787
117	NC_021984	GCT	2	6	9097	9102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218787
118	NC_021984	TGC	2	6	9139	9144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218787
119	NC_021984	GTC	2	6	9178	9183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218787
120	NC_021984	CAG	2	6	9397	9402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218788
121	NC_021984	GGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218788
122	NC_021984	GAA	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218788
123	NC_021984	CAG	2	6	9559	9564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218788
124	NC_021984	CAG	2	6	9643	9648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218788
125	NC_021984	CCG	2	6	9671	9676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218788
126	NC_021984	AAT	2	6	9697	9702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218788
127	NC_021984	TGG	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218788
128	NC_021984	CAT	2	6	9978	9983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218789
129	NC_021984	TCG	2	6	9984	9989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218789
130	NC_021984	CGC	2	6	10065	10070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218789
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133	NC_021984	AGC	2	6	10210	10215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218789
134	NC_021984	GCA	2	6	10217	10222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218789
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153	NC_021984	ATC	2	6	11940	11945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218790
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249	NC_021984	TGA	2	6	18618	18623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218796
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251	NC_021984	CCA	2	6	18664	18669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218796
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253	NC_021984	CGC	2	6	18819	18824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218796
254	NC_021984	CTA	2	6	18855	18860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218796
255	NC_021984	CGC	2	6	19026	19031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218796
256	NC_021984	CGA	2	6	19234	19239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218796
257	NC_021984	GCG	2	6	19268	19273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218796
258	NC_021984	CTG	2	6	19280	19285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218796
259	NC_021984	TTC	2	6	19324	19329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218796
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262	NC_021984	GAA	2	6	19592	19597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218796
263	NC_021984	GAT	2	6	19616	19621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218796
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274	NC_021984	ATG	2	6	23411	23416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218797
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282	NC_021984	AGA	2	6	24543	24548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218798
283	NC_021984	GCG	2	6	24595	24600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218798
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