MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp6

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021978	TGC	2	6	2	7	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021978	AAC	2	6	46	51	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021978	GGA	2	6	62	67	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021978	AGG	2	6	94	99	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021978	AGA	2	6	134	139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021978	CTG	2	6	174	179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021978	AGC	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021978	TGT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021978	TGA	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021978	GAT	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021978	ATG	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021978	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021978	GCT	2	6	788	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021978	CTC	2	6	873	878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021978	CAG	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021978	CGA	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021978	TGC	3	9	1078	1086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021978	TTC	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021978	TGC	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021978	CTT	2	6	1277	1282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218771
21	NC_021978	GCC	2	6	1288	1293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218771
22	NC_021978	GAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218771
23	NC_021978	TCA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218771
24	NC_021978	CTT	2	6	1358	1363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218772
25	NC_021978	GGC	2	6	1555	1560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218772
26	NC_021978	ACT	2	6	1599	1604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218772
27	NC_021978	TGA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218772
28	NC_021978	GAG	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218772
29	NC_021978	GAT	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218772
30	NC_021978	TCT	2	6	1989	1994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021978	GCG	2	6	2258	2263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021978	GGT	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021978	CGC	2	6	2363	2368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021978	TGG	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021978	CAC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021978	GCC	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021978	CAG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021978	CGC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021978	GAA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021978	GCT	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
41	NC_021978	TCT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218773
42	NC_021978	CTG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
43	NC_021978	CAG	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218773
44	NC_021978	TAA	2	6	3223	3228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218773
45	NC_021978	GAT	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218773
46	NC_021978	CTT	3	9	3425	3433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218773
47	NC_021978	GAG	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218773
48	NC_021978	TGC	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
49	NC_021978	CTG	3	9	3573	3581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218773
50	NC_021978	CGC	2	6	3639	3644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218773
51	NC_021978	TCT	3	9	3647	3655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218773
52	NC_021978	CGA	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218773
53	NC_021978	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218773
54	NC_021978	AAT	2	6	4049	4054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218773
55	NC_021978	TGA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021978	CTT	2	6	4416	4421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021978	CTG	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021978	CGC	2	6	4491	4496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021978	TTA	2	6	4684	4689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218774
60	NC_021978	TGA	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218775
61	NC_021978	AAG	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218775
62	NC_021978	TCA	2	6	4887	4892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218775
63	NC_021978	GCT	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218775
64	NC_021978	GTC	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021978	TGA	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021978	TCA	2	6	5385	5390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021978	CGC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021978	CTG	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021978	GCT	2	6	5582	5587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021978	GAT	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021978	CAC	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021978	CGG	2	6	5719	5724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021978	ACC	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021978	CCA	2	6	5865	5870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021978	CGG	2	6	5874	5879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021978	AGC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021978	TGA	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021978	GAA	2	6	6239	6244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021978	GAA	2	6	6335	6340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021978	ATG	2	6	6470	6475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.