MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp4

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021977	CCTC	2	8	161	168	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_021977	CCGG	2	8	342	349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021977	GCCC	3	12	575	586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_021977	CCGG	2	8	642	649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021977	CAAC	2	8	689	696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021977	CCGG	2	8	771	778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021977	TCCT	2	8	787	794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021977	GAAA	2	8	973	980	75 %	0 %	25 %	0 %	529218761
9	NC_021977	GGGC	2	8	1300	1307	0 %	0 %	75 %	25 %	529218761
10	NC_021977	TGCG	2	8	1610	1617	0 %	25 %	50 %	25 %	529218761
11	NC_021977	CCCA	2	8	1771	1778	25 %	0 %	0 %	75 %	529218761
12	NC_021977	AGAA	2	8	1887	1894	75 %	0 %	25 %	0 %	529218761
13	NC_021977	TCTG	2	8	2296	2303	0 %	50 %	25 %	25 %	529218761
14	NC_021977	GTTT	2	8	3139	3146	0 %	75 %	25 %	0 %	529218763
15	NC_021977	TGTC	2	8	3376	3383	0 %	50 %	25 %	25 %	529218763
16	NC_021977	CAGA	2	8	3410	3417	50 %	0 %	25 %	25 %	529218763
17	NC_021977	CGGA	2	8	4038	4045	25 %	0 %	50 %	25 %	529218764
18	NC_021977	GCCT	2	8	4434	4441	0 %	25 %	25 %	50 %	529218764
19	NC_021977	CAGA	2	8	5204	5211	50 %	0 %	25 %	25 %	529218765
20	NC_021977	GAAA	2	8	5445	5452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021977	GCGT	2	8	5677	5684	0 %	25 %	50 %	25 %	529218766
22	NC_021977	GCCG	2	8	5853	5860	0 %	0 %	50 %	50 %	529218766
23	NC_021977	TTCG	2	8	5900	5907	0 %	50 %	25 %	25 %	529218766
24	NC_021977	GGGC	2	8	5913	5920	0 %	0 %	75 %	25 %	529218766
25	NC_021977	TCCG	2	8	6296	6303	0 %	25 %	25 %	50 %	529218766
26	NC_021977	GCAG	2	8	6509	6516	25 %	0 %	50 %	25 %	529218766
27	NC_021977	TTAA	2	8	6939	6946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021977	GAAG	2	8	7203	7210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021977	GCTT	2	8	7324	7331	0 %	50 %	25 %	25 %	529218767
30	NC_021977	AAAT	2	8	7644	7651	75 %	25 %	0 %	0 %	529218767
31	NC_021977	TCCA	2	8	7656	7663	25 %	25 %	0 %	50 %	529218767
32	NC_021977	GTCT	2	8	7821	7828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021977	GTTT	2	8	8374	8381	0 %	75 %	25 %	0 %	529218768
34	NC_021977	TGTC	2	8	8611	8618	0 %	50 %	25 %	25 %	529218768
35	NC_021977	CAGA	2	8	8645	8652	50 %	0 %	25 %	25 %	529218768
36	NC_021977	GACG	2	8	8887	8894	25 %	0 %	50 %	25 %	529218768
37	NC_021977	TGAT	2	8	9128	9135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021977	TGGA	2	8	9555	9562	25 %	25 %	50 %	0 %	529218769
39	NC_021977	GATT	2	8	9579	9586	25 %	50 %	25 %	0 %	529218769
40	NC_021977	ATTA	2	8	9754	9761	50 %	50 %	0 %	0 %	529218769
41	NC_021977	AAAT	2	8	9834	9841	75 %	25 %	0 %	0 %	529218769
42	NC_021977	TCTT	2	8	9853	9860	0 %	75 %	0 %	25 %	529218769
43	NC_021977	CTTC	2	8	10027	10034	0 %	50 %	0 %	50 %	529218769
44	NC_021977	TCGG	2	8	10085	10092	0 %	25 %	50 %	25 %	529218769
45	NC_021977	CGGA	2	8	10233	10240	25 %	0 %	50 %	25 %	529218769
46	NC_021977	CGGT	2	8	10324	10331	0 %	25 %	50 %	25 %	529218769
47	NC_021977	GCAA	2	8	10841	10848	50 %	0 %	25 %	25 %	529218769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.