MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp4

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021977	GTT	2	6	1020	1025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
2	NC_021977	GTT	2	6	1077	1082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
3	NC_021977	CGA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218761
4	NC_021977	GGC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218761
5	NC_021977	ATT	2	6	1227	1232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218761
6	NC_021977	ACA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218761
7	NC_021977	TCA	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218761
8	NC_021977	ATG	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218761
9	NC_021977	TTC	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218761
10	NC_021977	AGA	2	6	1583	1588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218761
11	NC_021977	GAA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218761
12	NC_021977	ACG	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218761
13	NC_021977	TCT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218761
14	NC_021977	ATC	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218761
15	NC_021977	TTG	2	6	2134	2139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
16	NC_021977	TTG	2	6	2146	2151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
17	NC_021977	TTG	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218761
18	NC_021977	CCA	2	6	2212	2217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218761
19	NC_021977	AGA	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218761
20	NC_021977	GAT	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218761
21	NC_021977	GTG	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218762
22	NC_021977	TTC	2	6	2585	2590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218762
23	NC_021977	TTG	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218763
24	NC_021977	GGC	2	6	3249	3254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218763
25	NC_021977	CTC	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218763
26	NC_021977	AAG	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218763
27	NC_021977	GAT	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218764
28	NC_021977	CGT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218764
29	NC_021977	TGC	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218764
30	NC_021977	TGC	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218764
31	NC_021977	AGT	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218764
32	NC_021977	CCA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218764
33	NC_021977	GAG	2	6	4237	4242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218764
34	NC_021977	GCG	2	6	4317	4322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218764
35	NC_021977	GCG	2	6	4399	4404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218764
36	NC_021977	AGG	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218764
37	NC_021977	GGC	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218764
38	NC_021977	TGG	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218764
39	NC_021977	CGA	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218765
40	NC_021977	CAG	2	6	5114	5119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218765
41	NC_021977	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218765
42	NC_021977	CGG	2	6	5283	5288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218765
43	NC_021977	TGG	2	6	5343	5348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218765
44	NC_021977	GTT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218766
45	NC_021977	GAT	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218766
46	NC_021977	GCG	2	6	5735	5740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218766
47	NC_021977	CGA	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218766
48	NC_021977	GTT	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218766
49	NC_021977	GTT	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218766
50	NC_021977	CAT	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
51	NC_021977	GTA	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218766
52	NC_021977	GAA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218766
53	NC_021977	GAA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218766
54	NC_021977	CCG	2	6	6265	6270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218766
55	NC_021977	TCG	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218766
56	NC_021977	ACG	2	6	6398	6403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218766
57	NC_021977	TCA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
58	NC_021977	AGA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218766
59	NC_021977	CTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218766
60	NC_021977	ATC	2	6	6737	6742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
61	NC_021977	ATA	2	6	6834	6839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218766
62	NC_021977	TCA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218766
63	NC_021977	GAT	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218766
64	NC_021977	TTC	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218767
65	NC_021977	GAT	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218767
66	NC_021977	AGC	2	6	7375	7380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218767
67	NC_021977	CCT	2	6	7432	7437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218767
68	NC_021977	TGC	2	6	7543	7548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218767
69	NC_021977	GCA	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218767
70	NC_021977	TTC	2	6	7602	7607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218767
71	NC_021977	AGG	2	6	7725	7730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218767
72	NC_021977	TGC	2	6	8242	8247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218768
73	NC_021977	GGC	2	6	8484	8489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218768
74	NC_021977	CTC	2	6	8565	8570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218768
75	NC_021977	AAG	2	6	8662	8667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218768
76	NC_021977	GAG	2	6	8854	8859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218768
77	NC_021977	TGA	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218768
78	NC_021977	CAA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218769
79	NC_021977	CTG	2	6	9348	9353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218769
80	NC_021977	CAA	2	6	9472	9477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218769
81	NC_021977	CAT	2	6	9504	9509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218769
82	NC_021977	AAT	2	6	9601	9606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218769
83	NC_021977	GGA	2	6	9674	9679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218769
84	NC_021977	GAA	2	6	9776	9781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218769
85	NC_021977	GAT	2	6	9782	9787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218769
86	NC_021977	TAA	3	9	9798	9806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218769
87	NC_021977	AAC	2	6	9874	9879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218769
88	NC_021977	CAG	2	6	9886	9891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218769
89	NC_021977	TCT	2	6	9931	9936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218769
90	NC_021977	CAA	2	6	9981	9986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218769
91	NC_021977	TCA	2	6	10110	10115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218769
92	NC_021977	TCG	2	6	10132	10137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218769
93	NC_021977	TGA	3	9	10186	10194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218769
94	NC_021977	CGG	2	6	10266	10271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218769
95	NC_021977	TCT	2	6	10335	10340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218769
96	NC_021977	ACT	2	6	10365	10370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218769
97	NC_021977	CGT	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218769
98	NC_021977	CCA	2	6	10564	10569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218769
99	NC_021977	GCC	2	6	10758	10763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218769
100	NC_021977	TCG	2	6	10785	10790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218769
101	NC_021977	CTG	2	6	10982	10987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.