MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	TTCCAA	2	12	643	654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218540
2	NC_021976	ACATCC	2	12	1899	1910	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021976	TTTGGG	2	12	12916	12927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021976	GATGGC	2	12	16541	16552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529218556
5	NC_021976	AAACGG	2	12	21250	21261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	529218559
6	NC_021976	CCCGTT	2	12	23799	23810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	529218562
7	NC_021976	CCAGAC	2	12	25702	25713	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529218564
8	NC_021976	GCTTTG	2	12	31643	31654	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	529218574
9	NC_021976	ATCAAT	2	12	37698	37709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	529218583
10	NC_021976	CTTGAA	2	12	40486	40497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	529218587
11	NC_021976	TATGGT	2	12	41929	41940	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	529218588
12	NC_021976	GGGTGC	2	12	42276	42287	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	529218588
13	NC_021976	ATTCAG	2	12	42477	42488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021976	TTTTTC	2	12	43575	43586	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021976	TGGAAC	2	12	43772	43783	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021976	CCAGCC	2	12	71848	71859	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	529239397
17	NC_021976	GCCATA	2	12	75220	75231	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	529218630
18	NC_021976	GTCTCC	2	12	80911	80922	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	529218637
19	NC_021976	TGAATT	2	12	86459	86470	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021976	GACAAC	2	12	90424	90435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021976	TGATCG	2	12	94788	94799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529218650
22	NC_021976	CTTGAA	2	12	95691	95702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021976	TGCGCG	2	12	103088	103099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529239401
24	NC_021976	CCTTCT	2	12	115504	115515	0 %	50 %	0 %	50 %	529218672
25	NC_021976	CGTGGG	2	12	117299	117310	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	529239402
26	NC_021976	GAGGAA	2	12	117451	117462	50 %	0 %	50 %	0 %	529239402
27	NC_021976	CAACCT	2	12	120830	120841	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	529218677
28	NC_021976	ATCTTG	2	12	121805	121816	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	529218678
29	NC_021976	AGTTTT	2	12	122318	122329	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021976	GCACGT	2	12	129320	129331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529218687
31	NC_021976	GTTTAT	2	12	129828	129839	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021976	AGCCTG	2	12	139341	139352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529218699
33	NC_021976	GCCCCG	2	12	140730	140741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218699
34	NC_021976	TCAGGA	2	12	141553	141564	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021976	CAGCAC	2	12	144060	144071	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529218702
36	NC_021976	ACCACA	2	12	144809	144820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021976	AGCCAA	2	12	146226	146237	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	529218706
38	NC_021976	CCTGCC	2	12	152729	152740	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	529218718
39	NC_021976	ACTCTC	2	12	156067	156078	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	529218730
40	NC_021976	ACTGGC	2	12	156667	156678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021976	AAGATC	2	12	158170	158181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529218732
42	NC_021976	TGAGGA	2	12	161527	161538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	529218734
43	NC_021976	ACCGCT	2	12	162520	162531	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529218736
44	NC_021976	GCAGAT	2	12	166675	166686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529239405
45	NC_021976	GACATG	2	12	169203	169214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	529239405
46	NC_021976	TTATTG	2	12	169918	169929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021976	AAACGT	2	12	175309	175320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	529218741
48	NC_021976	TTTGGT	2	12	179053	179064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218745
49	NC_021976	CCAGCC	2	12	183681	183692	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	529218747
50	NC_021976	TGCCGG	2	12	184985	184996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529218749
51	NC_021976	GCTTCG	2	12	188993	189004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218752

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.