MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	AGGGG	2	10	2767	2776	20 %	0 %	80 %	0 %	529218542
2	NC_021976	TGAAA	2	10	3423	3432	60 %	20 %	20 %	0 %	529218543
3	NC_021976	CCGCT	2	10	6739	6748	0 %	20 %	20 %	60 %	529218546
4	NC_021976	ATGGC	2	10	6836	6845	20 %	20 %	40 %	20 %	529218546
5	NC_021976	GCATC	2	10	10640	10649	20 %	20 %	20 %	40 %	529218550
6	NC_021976	TGGTG	2	10	12852	12861	0 %	40 %	60 %	0 %	529218551
7	NC_021976	TTGTT	2	10	13120	13129	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021976	AGATC	2	10	14425	14434	40 %	20 %	20 %	20 %	529218553
9	NC_021976	CGGAC	2	10	15176	15185	20 %	0 %	40 %	40 %	529218554
10	NC_021976	CCGGG	2	10	15780	15789	0 %	0 %	60 %	40 %	529218554
11	NC_021976	CGCGA	2	10	15987	15996	20 %	0 %	40 %	40 %	529239391
12	NC_021976	CCGGA	2	10	16047	16056	20 %	0 %	40 %	40 %	529239391
13	NC_021976	TCCGG	2	10	18632	18641	0 %	20 %	40 %	40 %	529218557
14	NC_021976	CCGGA	2	10	20536	20545	20 %	0 %	40 %	40 %	529218559
15	NC_021976	GTTGG	2	10	21775	21784	0 %	40 %	60 %	0 %	529218559
16	NC_021976	AGATG	2	10	22234	22243	40 %	20 %	40 %	0 %	529218560
17	NC_021976	AAGGC	2	10	25061	25070	40 %	0 %	40 %	20 %	529239392
18	NC_021976	TCACT	2	10	27402	27411	20 %	40 %	0 %	40 %	529218567
19	NC_021976	AATCA	2	10	27433	27442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021976	TCCTC	2	10	28334	28343	0 %	40 %	0 %	60 %	529218569
21	NC_021976	TTTAC	2	10	28644	28653	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021976	ATACC	2	10	30571	30580	40 %	20 %	0 %	40 %	529218572
23	NC_021976	ATTAT	2	10	30703	30712	40 %	60 %	0 %	0 %	529218572
24	NC_021976	TCAGT	2	10	31683	31692	20 %	40 %	20 %	20 %	529218574
25	NC_021976	GATAG	2	10	32944	32953	40 %	20 %	40 %	0 %	529218576
26	NC_021976	TGTCC	19	95	34540	34634	0 %	40 %	20 %	40 %	529218578
27	NC_021976	CGAAA	2	10	36938	36947	60 %	0 %	20 %	20 %	529218581
28	NC_021976	CCGTC	2	10	39420	39429	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_021976	AAATC	2	10	40122	40131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021976	ATGCG	2	10	46792	46801	20 %	20 %	40 %	20 %	529218593
31	NC_021976	CACTC	2	10	46887	46896	20 %	20 %	0 %	60 %	529218593
32	NC_021976	GCAAG	2	10	50206	50215	40 %	0 %	40 %	20 %	529218597
33	NC_021976	ATTTG	2	10	50618	50627	20 %	60 %	20 %	0 %	529218597
34	NC_021976	GTAAC	2	10	52101	52110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021976	ATTGT	2	10	52229	52238	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021976	GGTCA	2	10	54334	54343	20 %	20 %	40 %	20 %	529218602
37	NC_021976	AATTG	2	10	54690	54699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021976	AAAAT	2	10	56579	56588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021976	CGGGC	2	10	57338	57347	0 %	0 %	60 %	40 %	529218606
40	NC_021976	TCTGG	2	10	57742	57751	0 %	40 %	40 %	20 %	529218606
41	NC_021976	GACAG	2	10	59187	59196	40 %	0 %	40 %	20 %	529218608
42	NC_021976	GTGGA	2	10	63035	63044	20 %	20 %	60 %	0 %	529218617
43	NC_021976	AGGTC	2	10	65919	65928	20 %	20 %	40 %	20 %	529218621
44	NC_021976	GATCC	2	10	66216	66225	20 %	20 %	20 %	40 %	529218622
45	NC_021976	CCTGC	2	10	70404	70413	0 %	20 %	20 %	60 %	529239396
46	NC_021976	TGGAT	2	10	72243	72252	20 %	40 %	40 %	0 %	529239397
47	NC_021976	ACAGA	2	10	72432	72441	60 %	0 %	20 %	20 %	529239397
48	NC_021976	GAGCA	2	10	78630	78639	40 %	0 %	40 %	20 %	529239399
49	NC_021976	GGGCT	2	10	79054	79063	0 %	20 %	60 %	20 %	529239400
50	NC_021976	ATCCG	2	10	79628	79637	20 %	20 %	20 %	40 %	529239400
51	NC_021976	CGTGA	2	10	84586	84595	20 %	20 %	40 %	20 %	529218640
52	NC_021976	CGCGA	2	10	84970	84979	20 %	0 %	40 %	40 %	529218640
53	NC_021976	GATCG	2	10	85924	85933	20 %	20 %	40 %	20 %	529218640
54	NC_021976	ACATT	2	10	86413	86422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021976	ATGCG	2	10	86567	86576	20 %	20 %	40 %	20 %	529218641
56	NC_021976	GCTTT	2	10	88806	88815	0 %	60 %	20 %	20 %	529218642
57	NC_021976	CGATG	2	10	89378	89387	20 %	20 %	40 %	20 %	529218643
58	NC_021976	ATGTG	2	10	90074	90083	20 %	40 %	40 %	0 %	529218643
59	NC_021976	TGAAA	2	10	90735	90744	60 %	20 %	20 %	0 %	529218644
60	NC_021976	GGACG	2	10	90976	90985	20 %	0 %	60 %	20 %	529218644
61	NC_021976	GCTTT	2	10	91437	91446	0 %	60 %	20 %	20 %	529218645
62	NC_021976	ACGCA	2	10	92479	92488	40 %	0 %	20 %	40 %	529218647
63	NC_021976	GCCTG	2	10	94590	94599	0 %	20 %	40 %	40 %	529218650
64	NC_021976	GGATC	2	10	98157	98166	20 %	20 %	40 %	20 %	529218654
65	NC_021976	GCGTA	2	10	98384	98393	20 %	20 %	40 %	20 %	529218655
66	NC_021976	CCGCG	2	10	98959	98968	0 %	0 %	40 %	60 %	529218655
67	NC_021976	TGGCG	2	10	98980	98989	0 %	20 %	60 %	20 %	529218655
68	NC_021976	ATGAT	2	10	100397	100406	40 %	40 %	20 %	0 %	529218656
69	NC_021976	TATGT	2	10	100707	100716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021976	TATAA	2	10	100717	100726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021976	CCGCA	2	10	100915	100924	20 %	0 %	20 %	60 %	529218657
72	NC_021976	CACGG	2	10	102622	102631	20 %	0 %	40 %	40 %	529239401
73	NC_021976	TCGGA	2	10	103250	103259	20 %	20 %	40 %	20 %	529239401
74	NC_021976	GTTCG	2	10	103509	103518	0 %	40 %	40 %	20 %	529239401
75	NC_021976	AACAT	2	10	105084	105093	60 %	20 %	0 %	20 %	529218660
76	NC_021976	TCTGA	2	10	106375	106384	20 %	40 %	20 %	20 %	529218661
77	NC_021976	GGATC	2	10	109842	109851	20 %	20 %	40 %	20 %	529218663
78	NC_021976	GACCT	2	10	110139	110148	20 %	20 %	20 %	40 %	529218664
79	NC_021976	CAGTC	2	10	111261	111270	20 %	20 %	20 %	40 %	529218666
80	NC_021976	GGGAT	2	10	111575	111584	20 %	20 %	60 %	0 %	529218667
81	NC_021976	TTCAT	2	10	113734	113743	20 %	60 %	0 %	20 %	529218670
82	NC_021976	CACAA	2	10	116362	116371	60 %	0 %	0 %	40 %	529218672
83	NC_021976	GCTTG	2	10	117149	117158	0 %	40 %	40 %	20 %	529218673
84	NC_021976	CGCTG	2	10	117345	117354	0 %	20 %	40 %	40 %	529239402
85	NC_021976	TGATC	2	10	118542	118551	20 %	40 %	20 %	20 %	529239402
86	NC_021976	CCGCA	2	10	119277	119286	20 %	0 %	20 %	60 %	529239402
87	NC_021976	GCGCG	2	10	120115	120124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_021976	ATCCA	2	10	120775	120784	40 %	20 %	0 %	40 %	529218677
89	NC_021976	TCCAC	2	10	121125	121134	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_021976	CGCAT	2	10	122208	122217	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_021976	ACGCA	2	10	124448	124457	40 %	0 %	20 %	40 %	529218682
92	NC_021976	GCCTG	2	10	125586	125595	0 %	20 %	40 %	40 %	529218683
93	NC_021976	CGTCA	2	10	127127	127136	20 %	20 %	20 %	40 %	529218685
94	NC_021976	GCCCG	2	10	127783	127792	0 %	0 %	40 %	60 %	529218685
95	NC_021976	ATTTT	2	10	128542	128551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021976	AGAGA	2	10	129487	129496	60 %	0 %	40 %	0 %	529218687
97	NC_021976	GGGAG	2	10	132668	132677	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021976	GCTTG	2	10	132881	132890	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021976	TGAAT	2	10	133271	133280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021976	ATCCG	2	10	135191	135200	20 %	20 %	20 %	40 %	529218695
101	NC_021976	ACCCA	2	10	140176	140185	40 %	0 %	0 %	60 %	529218699
102	NC_021976	ACGGA	2	10	145838	145847	40 %	0 %	40 %	20 %	529218706
103	NC_021976	GGAAC	2	10	145874	145883	40 %	0 %	40 %	20 %	529218706
104	NC_021976	GGCCA	2	10	146485	146494	20 %	0 %	40 %	40 %	529218706
105	NC_021976	CCAGC	2	10	149909	149918	20 %	0 %	20 %	60 %	529218712
106	NC_021976	CGACG	2	10	151181	151190	20 %	0 %	40 %	40 %	529218715
107	NC_021976	GCCAT	2	10	151336	151345	20 %	20 %	20 %	40 %	529218715
108	NC_021976	GTGGG	2	10	151834	151843	0 %	20 %	80 %	0 %	529218716
109	NC_021976	CATTC	2	10	151961	151970	20 %	40 %	0 %	40 %	529218716
110	NC_021976	CCCCA	2	10	158362	158371	20 %	0 %	0 %	80 %	529218732
111	NC_021976	TGCTG	2	10	160487	160496	0 %	40 %	40 %	20 %	529218732
112	NC_021976	CTCAT	2	10	163310	163319	20 %	40 %	0 %	40 %	529218736
113	NC_021976	CGCCT	2	10	164639	164648	0 %	20 %	20 %	60 %	529239405
114	NC_021976	CCGTG	2	10	166436	166445	0 %	20 %	40 %	40 %	529239405
115	NC_021976	CTGCT	2	10	168941	168950	0 %	40 %	20 %	40 %	529239405
116	NC_021976	GAGGG	2	10	169093	169102	20 %	0 %	80 %	0 %	529239405
117	NC_021976	GGAGC	2	10	169397	169406	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021976	AGCAA	2	10	170303	170312	60 %	0 %	20 %	20 %	529218738
119	NC_021976	ATTAA	2	10	171131	171140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021976	GCGTT	2	10	172572	172581	0 %	40 %	40 %	20 %	529218739
121	NC_021976	GGGCA	2	10	173999	174008	20 %	0 %	60 %	20 %	529218740
122	NC_021976	AAGGT	2	10	176429	176438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021976	GAAAA	2	10	178544	178553	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021976	GCTCT	2	10	180762	180771	0 %	40 %	20 %	40 %	529218746
125	NC_021976	AGGGC	2	10	182473	182482	20 %	0 %	60 %	20 %	529218746
126	NC_021976	TCGGC	2	10	182988	182997	0 %	20 %	40 %	40 %	529218747
127	NC_021976	GATCC	2	10	183964	183973	20 %	20 %	20 %	40 %	529218747
128	NC_021976	AGCTC	2	10	185447	185456	20 %	20 %	20 %	40 %	529218749
129	NC_021976	TCACA	2	10	186015	186024	40 %	20 %	0 %	40 %	529218749
130	NC_021976	CCGAT	2	10	188181	188190	20 %	20 %	20 %	40 %	529218751
131	NC_021976	ATTGT	2	10	192186	192195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021976	AGTGC	2	10	194601	194610	20 %	20 %	40 %	20 %	529218759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.