MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	TTGTT	2	10	13120	13129	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021976	AATCA	2	10	27433	27442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021976	TTTAC	2	10	28644	28653	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021976	CCGTC	2	10	39420	39429	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_021976	AAATC	2	10	40122	40131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021976	GTAAC	2	10	52101	52110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021976	ATTGT	2	10	52229	52238	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021976	AATTG	2	10	54690	54699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021976	AAAAT	2	10	56579	56588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021976	ACATT	2	10	86413	86422	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021976	TATGT	2	10	100707	100716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021976	TATAA	2	10	100717	100726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021976	GCGCG	2	10	120115	120124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_021976	TCCAC	2	10	121125	121134	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_021976	CGCAT	2	10	122208	122217	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021976	ATTTT	2	10	128542	128551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021976	GGGAG	2	10	132668	132677	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021976	GCTTG	2	10	132881	132890	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021976	TGAAT	2	10	133271	133280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021976	GGAGC	2	10	169397	169406	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021976	ATTAA	2	10	171131	171140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021976	AAGGT	2	10	176429	176438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021976	GAAAA	2	10	178544	178553	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021976	ATTGT	2	10	192186	192195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.