MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	AGGGG	2	10	2767	2776	20 %	0 %	80 %	0 %	529218542
2	NC_021976	TGAAA	2	10	3423	3432	60 %	20 %	20 %	0 %	529218543
3	NC_021976	CCGCT	2	10	6739	6748	0 %	20 %	20 %	60 %	529218546
4	NC_021976	ATGGC	2	10	6836	6845	20 %	20 %	40 %	20 %	529218546
5	NC_021976	GCATC	2	10	10640	10649	20 %	20 %	20 %	40 %	529218550
6	NC_021976	TGGTG	2	10	12852	12861	0 %	40 %	60 %	0 %	529218551
7	NC_021976	AGATC	2	10	14425	14434	40 %	20 %	20 %	20 %	529218553
8	NC_021976	CGGAC	2	10	15176	15185	20 %	0 %	40 %	40 %	529218554
9	NC_021976	CCGGG	2	10	15780	15789	0 %	0 %	60 %	40 %	529218554
10	NC_021976	CGCGA	2	10	15987	15996	20 %	0 %	40 %	40 %	529239391
11	NC_021976	CCGGA	2	10	16047	16056	20 %	0 %	40 %	40 %	529239391
12	NC_021976	TCCGG	2	10	18632	18641	0 %	20 %	40 %	40 %	529218557
13	NC_021976	CCGGA	2	10	20536	20545	20 %	0 %	40 %	40 %	529218559
14	NC_021976	GTTGG	2	10	21775	21784	0 %	40 %	60 %	0 %	529218559
15	NC_021976	AGATG	2	10	22234	22243	40 %	20 %	40 %	0 %	529218560
16	NC_021976	AAGGC	2	10	25061	25070	40 %	0 %	40 %	20 %	529239392
17	NC_021976	TCACT	2	10	27402	27411	20 %	40 %	0 %	40 %	529218567
18	NC_021976	TCCTC	2	10	28334	28343	0 %	40 %	0 %	60 %	529218569
19	NC_021976	ATACC	2	10	30571	30580	40 %	20 %	0 %	40 %	529218572
20	NC_021976	ATTAT	2	10	30703	30712	40 %	60 %	0 %	0 %	529218572
21	NC_021976	TCAGT	2	10	31683	31692	20 %	40 %	20 %	20 %	529218574
22	NC_021976	GATAG	2	10	32944	32953	40 %	20 %	40 %	0 %	529218576
23	NC_021976	TGTCC	19	95	34540	34634	0 %	40 %	20 %	40 %	529218578
24	NC_021976	CGAAA	2	10	36938	36947	60 %	0 %	20 %	20 %	529218581
25	NC_021976	ATGCG	2	10	46792	46801	20 %	20 %	40 %	20 %	529218593
26	NC_021976	CACTC	2	10	46887	46896	20 %	20 %	0 %	60 %	529218593
27	NC_021976	GCAAG	2	10	50206	50215	40 %	0 %	40 %	20 %	529218597
28	NC_021976	ATTTG	2	10	50618	50627	20 %	60 %	20 %	0 %	529218597
29	NC_021976	GGTCA	2	10	54334	54343	20 %	20 %	40 %	20 %	529218602
30	NC_021976	CGGGC	2	10	57338	57347	0 %	0 %	60 %	40 %	529218606
31	NC_021976	TCTGG	2	10	57742	57751	0 %	40 %	40 %	20 %	529218606
32	NC_021976	GACAG	2	10	59187	59196	40 %	0 %	40 %	20 %	529218608
33	NC_021976	GTGGA	2	10	63035	63044	20 %	20 %	60 %	0 %	529218617
34	NC_021976	AGGTC	2	10	65919	65928	20 %	20 %	40 %	20 %	529218621
35	NC_021976	GATCC	2	10	66216	66225	20 %	20 %	20 %	40 %	529218622
36	NC_021976	CCTGC	2	10	70404	70413	0 %	20 %	20 %	60 %	529239396
37	NC_021976	TGGAT	2	10	72243	72252	20 %	40 %	40 %	0 %	529239397
38	NC_021976	ACAGA	2	10	72432	72441	60 %	0 %	20 %	20 %	529239397
39	NC_021976	GAGCA	2	10	78630	78639	40 %	0 %	40 %	20 %	529239399
40	NC_021976	GGGCT	2	10	79054	79063	0 %	20 %	60 %	20 %	529239400
41	NC_021976	ATCCG	2	10	79628	79637	20 %	20 %	20 %	40 %	529239400
42	NC_021976	CGTGA	2	10	84586	84595	20 %	20 %	40 %	20 %	529218640
43	NC_021976	CGCGA	2	10	84970	84979	20 %	0 %	40 %	40 %	529218640
44	NC_021976	GATCG	2	10	85924	85933	20 %	20 %	40 %	20 %	529218640
45	NC_021976	ATGCG	2	10	86567	86576	20 %	20 %	40 %	20 %	529218641
46	NC_021976	GCTTT	2	10	88806	88815	0 %	60 %	20 %	20 %	529218642
47	NC_021976	CGATG	2	10	89378	89387	20 %	20 %	40 %	20 %	529218643
48	NC_021976	ATGTG	2	10	90074	90083	20 %	40 %	40 %	0 %	529218643
49	NC_021976	TGAAA	2	10	90735	90744	60 %	20 %	20 %	0 %	529218644
50	NC_021976	GGACG	2	10	90976	90985	20 %	0 %	60 %	20 %	529218644
51	NC_021976	GCTTT	2	10	91437	91446	0 %	60 %	20 %	20 %	529218645
52	NC_021976	ACGCA	2	10	92479	92488	40 %	0 %	20 %	40 %	529218647
53	NC_021976	GCCTG	2	10	94590	94599	0 %	20 %	40 %	40 %	529218650
54	NC_021976	GGATC	2	10	98157	98166	20 %	20 %	40 %	20 %	529218654
55	NC_021976	GCGTA	2	10	98384	98393	20 %	20 %	40 %	20 %	529218655
56	NC_021976	CCGCG	2	10	98959	98968	0 %	0 %	40 %	60 %	529218655
57	NC_021976	TGGCG	2	10	98980	98989	0 %	20 %	60 %	20 %	529218655
58	NC_021976	ATGAT	2	10	100397	100406	40 %	40 %	20 %	0 %	529218656
59	NC_021976	CCGCA	2	10	100915	100924	20 %	0 %	20 %	60 %	529218657
60	NC_021976	CACGG	2	10	102622	102631	20 %	0 %	40 %	40 %	529239401
61	NC_021976	TCGGA	2	10	103250	103259	20 %	20 %	40 %	20 %	529239401
62	NC_021976	GTTCG	2	10	103509	103518	0 %	40 %	40 %	20 %	529239401
63	NC_021976	AACAT	2	10	105084	105093	60 %	20 %	0 %	20 %	529218660
64	NC_021976	TCTGA	2	10	106375	106384	20 %	40 %	20 %	20 %	529218661
65	NC_021976	GGATC	2	10	109842	109851	20 %	20 %	40 %	20 %	529218663
66	NC_021976	GACCT	2	10	110139	110148	20 %	20 %	20 %	40 %	529218664
67	NC_021976	CAGTC	2	10	111261	111270	20 %	20 %	20 %	40 %	529218666
68	NC_021976	GGGAT	2	10	111575	111584	20 %	20 %	60 %	0 %	529218667
69	NC_021976	TTCAT	2	10	113734	113743	20 %	60 %	0 %	20 %	529218670
70	NC_021976	CACAA	2	10	116362	116371	60 %	0 %	0 %	40 %	529218672
71	NC_021976	GCTTG	2	10	117149	117158	0 %	40 %	40 %	20 %	529218673
72	NC_021976	CGCTG	2	10	117345	117354	0 %	20 %	40 %	40 %	529239402
73	NC_021976	TGATC	2	10	118542	118551	20 %	40 %	20 %	20 %	529239402
74	NC_021976	CCGCA	2	10	119277	119286	20 %	0 %	20 %	60 %	529239402
75	NC_021976	ATCCA	2	10	120775	120784	40 %	20 %	0 %	40 %	529218677
76	NC_021976	ACGCA	2	10	124448	124457	40 %	0 %	20 %	40 %	529218682
77	NC_021976	GCCTG	2	10	125586	125595	0 %	20 %	40 %	40 %	529218683
78	NC_021976	CGTCA	2	10	127127	127136	20 %	20 %	20 %	40 %	529218685
79	NC_021976	GCCCG	2	10	127783	127792	0 %	0 %	40 %	60 %	529218685
80	NC_021976	AGAGA	2	10	129487	129496	60 %	0 %	40 %	0 %	529218687
81	NC_021976	ATCCG	2	10	135191	135200	20 %	20 %	20 %	40 %	529218695
82	NC_021976	ACCCA	2	10	140176	140185	40 %	0 %	0 %	60 %	529218699
83	NC_021976	ACGGA	2	10	145838	145847	40 %	0 %	40 %	20 %	529218706
84	NC_021976	GGAAC	2	10	145874	145883	40 %	0 %	40 %	20 %	529218706
85	NC_021976	GGCCA	2	10	146485	146494	20 %	0 %	40 %	40 %	529218706
86	NC_021976	CCAGC	2	10	149909	149918	20 %	0 %	20 %	60 %	529218712
87	NC_021976	CGACG	2	10	151181	151190	20 %	0 %	40 %	40 %	529218715
88	NC_021976	GCCAT	2	10	151336	151345	20 %	20 %	20 %	40 %	529218715
89	NC_021976	GTGGG	2	10	151834	151843	0 %	20 %	80 %	0 %	529218716
90	NC_021976	CATTC	2	10	151961	151970	20 %	40 %	0 %	40 %	529218716
91	NC_021976	CCCCA	2	10	158362	158371	20 %	0 %	0 %	80 %	529218732
92	NC_021976	TGCTG	2	10	160487	160496	0 %	40 %	40 %	20 %	529218732
93	NC_021976	CTCAT	2	10	163310	163319	20 %	40 %	0 %	40 %	529218736
94	NC_021976	CGCCT	2	10	164639	164648	0 %	20 %	20 %	60 %	529239405
95	NC_021976	CCGTG	2	10	166436	166445	0 %	20 %	40 %	40 %	529239405
96	NC_021976	CTGCT	2	10	168941	168950	0 %	40 %	20 %	40 %	529239405
97	NC_021976	GAGGG	2	10	169093	169102	20 %	0 %	80 %	0 %	529239405
98	NC_021976	AGCAA	2	10	170303	170312	60 %	0 %	20 %	20 %	529218738
99	NC_021976	GCGTT	2	10	172572	172581	0 %	40 %	40 %	20 %	529218739
100	NC_021976	GGGCA	2	10	173999	174008	20 %	0 %	60 %	20 %	529218740
101	NC_021976	GCTCT	2	10	180762	180771	0 %	40 %	20 %	40 %	529218746
102	NC_021976	AGGGC	2	10	182473	182482	20 %	0 %	60 %	20 %	529218746
103	NC_021976	TCGGC	2	10	182988	182997	0 %	20 %	40 %	40 %	529218747
104	NC_021976	GATCC	2	10	183964	183973	20 %	20 %	20 %	40 %	529218747
105	NC_021976	AGCTC	2	10	185447	185456	20 %	20 %	20 %	40 %	529218749
106	NC_021976	TCACA	2	10	186015	186024	40 %	20 %	0 %	40 %	529218749
107	NC_021976	CCGAT	2	10	188181	188190	20 %	20 %	20 %	40 %	529218751
108	NC_021976	AGTGC	2	10	194601	194610	20 %	20 %	40 %	20 %	529218759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.