MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	ATC	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021976	TGA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021976	CTT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021976	CGC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021976	TGT	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021976	CGA	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021976	ATT	2	6	6206	6211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021976	GAA	2	6	6269	6274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021976	TCA	2	6	9410	9415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021976	TGG	2	6	9505	9510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021976	TTA	3	9	9520	9528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021976	TAA	2	6	9538	9543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021976	TTC	2	6	11301	11306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021976	GCC	2	6	11496	11501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021976	CAT	2	6	12989	12994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021976	ATT	2	6	13069	13074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021976	GGC	2	6	17407	17412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021976	GTG	2	6	17413	17418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021976	ACG	2	6	17459	17464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021976	TTC	2	6	17500	17505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021976	TGG	2	6	17567	17572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021976	CGT	2	6	17575	17580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021976	TGC	2	6	17624	17629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021976	CCA	2	6	17709	17714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021976	GCG	2	6	17770	17775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021976	ATC	2	6	17921	17926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021976	AGC	2	6	17969	17974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021976	GCT	2	6	18063	18068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021976	TGA	2	6	18156	18161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021976	GTG	3	9	18265	18273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021976	CCG	2	6	18423	18428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021976	ATT	2	6	26480	26485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021976	TGT	2	6	27064	27069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021976	GCG	2	6	27072	27077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021976	GAA	2	6	27501	27506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021976	GCA	2	6	28513	28518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021976	GAT	2	6	28553	28558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021976	TCA	2	6	28618	28623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021976	ATA	2	6	28704	28709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021976	TGA	2	6	28775	28780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021976	AAT	2	6	29125	29130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021976	AAT	2	6	29216	29221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021976	AGA	2	6	29288	29293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021976	GCT	2	6	30277	30282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021976	GAA	2	6	30464	30469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021976	GAT	2	6	31395	31400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021976	AGA	2	6	31404	31409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021976	AAC	2	6	31427	31432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021976	AAT	2	6	32172	32177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021976	TTA	2	6	32197	32202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021976	ATT	2	6	32205	32210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021976	ATT	2	6	32240	32245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021976	TCG	2	6	32432	32437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021976	CAA	2	6	32462	32467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021976	GGA	2	6	35087	35092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021976	TTC	2	6	35175	35180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021976	GAA	2	6	35197	35202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021976	GAG	2	6	35260	35265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021976	CGC	2	6	35285	35290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021976	GCG	2	6	35301	35306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021976	AGC	2	6	35313	35318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021976	GTG	2	6	35379	35384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021976	CAG	2	6	37397	37402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021976	GCT	2	6	37572	37577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021976	CAG	2	6	39614	39619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021976	TGG	2	6	39623	39628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021976	TGG	2	6	39688	39693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021976	CAG	2	6	39794	39799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021976	AGC	2	6	39821	39826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021976	ATG	3	9	40169	40177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021976	CAT	2	6	40225	40230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021976	ACA	2	6	40273	40278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021976	AGG	2	6	42461	42466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021976	ATT	2	6	42505	42510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021976	GAT	2	6	42517	42522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021976	CAT	2	6	42553	42558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021976	GGA	2	6	43735	43740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021976	TGA	3	9	44680	44688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021976	CTG	2	6	44761	44766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021976	GAG	2	6	44915	44920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021976	TAT	2	6	44981	44986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021976	TAA	2	6	46414	46419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021976	GCC	2	6	46606	46611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021976	GAT	2	6	48106	48111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021976	TCT	2	6	49815	49820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021976	AGG	2	6	49857	49862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021976	AGA	2	6	49876	49881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021976	CTT	2	6	49894	49899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021976	GGT	2	6	51542	51547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021976	TTG	2	6	51952	51957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021976	CAT	2	6	52065	52070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021976	CAG	2	6	52072	52077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021976	CTT	2	6	52170	52175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021976	AAT	2	6	52466	52471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021976	GCA	2	6	52503	52508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021976	CAT	2	6	52544	52549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021976	ATT	2	6	52578	52583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021976	CAT	2	6	52723	52728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021976	GTG	2	6	52861	52866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021976	GGT	2	6	54262	54267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021976	TCA	2	6	56347	56352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021976	ATC	2	6	56375	56380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021976	CGG	2	6	56429	56434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021976	CAT	2	6	56495	56500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021976	AAT	2	6	56529	56534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021976	ATA	2	6	56538	56543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021976	ATT	2	6	56590	56595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021976	ATC	2	6	58774	58779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021976	TGA	2	6	58833	58838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021976	GAC	2	6	58859	58864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021976	TCA	2	6	60055	60060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021976	ACT	2	6	60117	60122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021976	TGC	2	6	61591	61596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021976	TGT	2	6	61663	61668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021976	CTG	2	6	61691	61696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021976	GGA	2	6	61713	61718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021976	GCC	2	6	61724	61729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021976	ATT	2	6	61731	61736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021976	CCA	2	6	63929	63934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021976	ACT	2	6	63997	64002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021976	GAT	2	6	65080	65085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021976	CTG	2	6	65121	65126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021976	GTC	2	6	65246	65251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021976	GAC	2	6	65334	65339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021976	CTT	2	6	65362	65367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021976	CGT	2	6	65420	65425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021976	AGC	2	6	65426	65431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021976	GGC	2	6	65490	65495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021976	GAC	2	6	70146	70151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021976	AGC	2	6	70166	70171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021976	ATG	2	6	71589	71594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021976	CGT	2	6	72756	72761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021976	TAC	2	6	73062	73067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021976	GTA	2	6	73095	73100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021976	AAC	2	6	73283	73288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021976	CAA	2	6	73393	73398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021976	GAC	2	6	76363	76368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021976	TGC	2	6	76458	76463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021976	ACG	2	6	76988	76993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.