MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	TG	3	6	543	548	0 %	50 %	50 %	0 %	529218540
2	NC_021976	GC	3	6	933	938	0 %	0 %	50 %	50 %	529218541
3	NC_021976	CG	3	6	1030	1035	0 %	0 %	50 %	50 %	529218541
4	NC_021976	CG	3	6	1072	1077	0 %	0 %	50 %	50 %	529218541
5	NC_021976	CG	3	6	2611	2616	0 %	0 %	50 %	50 %	529218542
6	NC_021976	CA	3	6	2752	2757	50 %	0 %	0 %	50 %	529218542
7	NC_021976	CG	3	6	2999	3004	0 %	0 %	50 %	50 %	529218542
8	NC_021976	CA	3	6	3947	3952	50 %	0 %	0 %	50 %	529218543
9	NC_021976	GA	3	6	4214	4219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021976	AT	3	6	4622	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	529218544
11	NC_021976	GA	3	6	5075	5080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021976	CG	3	6	5199	5204	0 %	0 %	50 %	50 %	529218545
13	NC_021976	AC	3	6	5814	5819	50 %	0 %	0 %	50 %	529218545
14	NC_021976	AC	3	6	6009	6014	50 %	0 %	0 %	50 %	529218545
15	NC_021976	TG	3	6	6652	6657	0 %	50 %	50 %	0 %	529218546
16	NC_021976	GC	3	6	6898	6903	0 %	0 %	50 %	50 %	529218546
17	NC_021976	CA	3	6	7482	7487	50 %	0 %	0 %	50 %	529218547
18	NC_021976	TC	3	6	7698	7703	0 %	50 %	0 %	50 %	529218547
19	NC_021976	GA	3	6	9176	9181	50 %	0 %	50 %	0 %	529218548
20	NC_021976	CG	3	6	9346	9351	0 %	0 %	50 %	50 %	529218548
21	NC_021976	AT	3	6	11486	11491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021976	GT	3	6	12196	12201	0 %	50 %	50 %	0 %	529218551
23	NC_021976	GC	3	6	12536	12541	0 %	0 %	50 %	50 %	529218551
24	NC_021976	GC	4	8	12792	12799	0 %	0 %	50 %	50 %	529218551
25	NC_021976	CG	3	6	13038	13043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021976	GA	3	6	13240	13245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021976	CT	3	6	13725	13730	0 %	50 %	0 %	50 %	529218552
28	NC_021976	GC	3	6	14264	14269	0 %	0 %	50 %	50 %	529218553
29	NC_021976	TC	3	6	14499	14504	0 %	50 %	0 %	50 %	529218553
30	NC_021976	GC	3	6	14909	14914	0 %	0 %	50 %	50 %	529218554
31	NC_021976	CT	3	6	16444	16449	0 %	50 %	0 %	50 %	529218556
32	NC_021976	AC	3	6	16780	16785	50 %	0 %	0 %	50 %	529218556
33	NC_021976	TG	3	6	17444	17449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021976	CG	3	6	17745	17750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021976	AC	3	6	19131	19136	50 %	0 %	0 %	50 %	529218558
36	NC_021976	CA	3	6	19204	19209	50 %	0 %	0 %	50 %	529218558
37	NC_021976	TG	3	6	19418	19423	0 %	50 %	50 %	0 %	529218558
38	NC_021976	TC	3	6	21312	21317	0 %	50 %	0 %	50 %	529218559
39	NC_021976	AG	3	6	22569	22574	50 %	0 %	50 %	0 %	529218560
40	NC_021976	GT	3	6	22652	22657	0 %	50 %	50 %	0 %	529218560
41	NC_021976	GT	3	6	22973	22978	0 %	50 %	50 %	0 %	529218561
42	NC_021976	CG	3	6	23377	23382	0 %	0 %	50 %	50 %	529218561
43	NC_021976	GA	3	6	23397	23402	50 %	0 %	50 %	0 %	529218561
44	NC_021976	GC	3	6	23942	23947	0 %	0 %	50 %	50 %	529218562
45	NC_021976	CA	3	6	24212	24217	50 %	0 %	0 %	50 %	529218562
46	NC_021976	CG	3	6	24520	24525	0 %	0 %	50 %	50 %	529218562
47	NC_021976	GC	3	6	24541	24546	0 %	0 %	50 %	50 %	529218562
48	NC_021976	AT	3	6	25738	25743	50 %	50 %	0 %	0 %	529218564
49	NC_021976	AT	3	6	26148	26153	50 %	50 %	0 %	0 %	529218564
50	NC_021976	GA	3	6	26388	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	529218565
51	NC_021976	CT	3	6	26593	26598	0 %	50 %	0 %	50 %	529218566
52	NC_021976	GA	3	6	26734	26739	50 %	0 %	50 %	0 %	529218566
53	NC_021976	AC	3	6	27193	27198	50 %	0 %	0 %	50 %	529218567
54	NC_021976	AC	3	6	28482	28487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021976	CT	3	6	29703	29708	0 %	50 %	0 %	50 %	529218571
56	NC_021976	TG	3	6	30127	30132	0 %	50 %	50 %	0 %	529218571
57	NC_021976	TG	3	6	31327	31332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021976	AC	3	6	31707	31712	50 %	0 %	0 %	50 %	529218574
59	NC_021976	GT	3	6	32291	32296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021976	TA	3	6	33313	33318	50 %	50 %	0 %	0 %	529218576
61	NC_021976	TA	3	6	33380	33385	50 %	50 %	0 %	0 %	529218576
62	NC_021976	GC	3	6	35900	35905	0 %	0 %	50 %	50 %	529218579
63	NC_021976	CT	3	6	36310	36315	0 %	50 %	0 %	50 %	529218581
64	NC_021976	GA	3	6	37770	37775	50 %	0 %	50 %	0 %	529218583
65	NC_021976	GC	3	6	37921	37926	0 %	0 %	50 %	50 %	529218584
66	NC_021976	AC	3	6	39047	39052	50 %	0 %	0 %	50 %	529218585
67	NC_021976	GT	3	6	39305	39310	0 %	50 %	50 %	0 %	529218585
68	NC_021976	CA	3	6	39317	39322	50 %	0 %	0 %	50 %	529218585
69	NC_021976	TC	3	6	39428	39433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021976	TC	3	6	39655	39660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021976	CG	3	6	39890	39895	0 %	0 %	50 %	50 %	529218586
72	NC_021976	GC	3	6	39943	39948	0 %	0 %	50 %	50 %	529218586
73	NC_021976	TC	3	6	41284	41289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021976	GC	3	6	41605	41610	0 %	0 %	50 %	50 %	529218588
75	NC_021976	TC	3	6	42038	42043	0 %	50 %	0 %	50 %	529218588
76	NC_021976	CG	3	6	42242	42247	0 %	0 %	50 %	50 %	529218588
77	NC_021976	TA	3	6	42604	42609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021976	CG	3	6	42680	42685	0 %	0 %	50 %	50 %	529218589
79	NC_021976	GC	3	6	44518	44523	0 %	0 %	50 %	50 %	529218590
80	NC_021976	GA	3	6	44809	44814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021976	TG	3	6	45014	45019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021976	GC	3	6	45092	45097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021976	AC	3	6	46903	46908	50 %	0 %	0 %	50 %	529218593
84	NC_021976	GT	3	6	47226	47231	0 %	50 %	50 %	0 %	529218593
85	NC_021976	GC	3	6	47300	47305	0 %	0 %	50 %	50 %	529218593
86	NC_021976	CA	3	6	47321	47326	50 %	0 %	0 %	50 %	529218593
87	NC_021976	CT	3	6	47624	47629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021976	AT	3	6	49470	49475	50 %	50 %	0 %	0 %	529218596
89	NC_021976	GC	3	6	49744	49749	0 %	0 %	50 %	50 %	529218596
90	NC_021976	CA	3	6	49822	49827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021976	GA	3	6	49947	49952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021976	AC	3	6	50245	50250	50 %	0 %	0 %	50 %	529218597
93	NC_021976	CT	3	6	50554	50559	0 %	50 %	0 %	50 %	529218597
94	NC_021976	TG	3	6	50644	50649	0 %	50 %	50 %	0 %	529218597
95	NC_021976	CA	3	6	51408	51413	50 %	0 %	0 %	50 %	529218598
96	NC_021976	TG	3	6	51506	51511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021976	CG	3	6	51841	51846	0 %	0 %	50 %	50 %	529239394
98	NC_021976	TA	3	6	52242	52247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021976	TA	3	6	52436	52441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021976	TG	4	8	52552	52559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021976	CT	3	6	53390	53395	0 %	50 %	0 %	50 %	529239395
102	NC_021976	GT	3	6	53739	53744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021976	AG	3	6	53788	53793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021976	CA	3	6	54066	54071	50 %	0 %	0 %	50 %	529218601
105	NC_021976	AG	3	6	54433	54438	50 %	0 %	50 %	0 %	529218602
106	NC_021976	GC	3	6	55426	55431	0 %	0 %	50 %	50 %	529218603
107	NC_021976	CA	3	6	55504	55509	50 %	0 %	0 %	50 %	529218603
108	NC_021976	TC	3	6	55709	55714	0 %	50 %	0 %	50 %	529218604
109	NC_021976	GC	3	6	58950	58955	0 %	0 %	50 %	50 %	529218607
110	NC_021976	CT	3	6	60308	60313	0 %	50 %	0 %	50 %	529218611
111	NC_021976	CG	3	6	60838	60843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021976	GA	3	6	61135	61140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021976	AG	3	6	62103	62108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021976	TG	3	6	63021	63026	0 %	50 %	50 %	0 %	529218617
115	NC_021976	TC	3	6	63116	63121	0 %	50 %	0 %	50 %	529218617
116	NC_021976	GT	3	6	63869	63874	0 %	50 %	50 %	0 %	529218618
117	NC_021976	AT	3	6	64451	64456	50 %	50 %	0 %	0 %	529218620
118	NC_021976	AC	3	6	65533	65538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021976	TG	3	6	65539	65544	0 %	50 %	50 %	0 %	529218621
120	NC_021976	AG	3	6	66334	66339	50 %	0 %	50 %	0 %	529218622
121	NC_021976	AG	4	8	67171	67178	50 %	0 %	50 %	0 %	529218622
122	NC_021976	AG	3	6	67250	67255	50 %	0 %	50 %	0 %	529218622
123	NC_021976	TG	3	6	67705	67710	0 %	50 %	50 %	0 %	529218623
124	NC_021976	GC	3	6	68309	68314	0 %	0 %	50 %	50 %	529218623
125	NC_021976	AG	3	6	69710	69715	50 %	0 %	50 %	0 %	529218624
126	NC_021976	TC	3	6	70097	70102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021976	GC	3	6	70935	70940	0 %	0 %	50 %	50 %	529239396
128	NC_021976	AG	3	6	70981	70986	50 %	0 %	50 %	0 %	529239396
129	NC_021976	GA	3	6	71523	71528	50 %	0 %	50 %	0 %	529218626
130	NC_021976	CG	3	6	71910	71915	0 %	0 %	50 %	50 %	529239397
131	NC_021976	TG	3	6	72388	72393	0 %	50 %	50 %	0 %	529239397
132	NC_021976	GC	3	6	72394	72399	0 %	0 %	50 %	50 %	529239397
133	NC_021976	TG	3	6	72619	72624	0 %	50 %	50 %	0 %	529239397
134	NC_021976	GT	3	6	73030	73035	0 %	50 %	50 %	0 %	529218628
135	NC_021976	CA	3	6	73407	73412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021976	CG	3	6	73891	73896	0 %	0 %	50 %	50 %	529218629
137	NC_021976	GC	3	6	73928	73933	0 %	0 %	50 %	50 %	529218629
138	NC_021976	AG	3	6	74240	74245	50 %	0 %	50 %	0 %	529218629
139	NC_021976	TC	3	6	74302	74307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021976	CG	3	6	75767	75772	0 %	0 %	50 %	50 %	529218631
141	NC_021976	TC	3	6	78492	78497	0 %	50 %	0 %	50 %	529239399
142	NC_021976	CT	3	6	78970	78975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021976	TC	3	6	79082	79087	0 %	50 %	0 %	50 %	529239400
144	NC_021976	GT	3	6	79735	79740	0 %	50 %	50 %	0 %	529218636
145	NC_021976	CG	3	6	80018	80023	0 %	0 %	50 %	50 %	529218636
146	NC_021976	CG	3	6	80320	80325	0 %	0 %	50 %	50 %	529218636
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.