MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021921	ACCACG	2	12	51858	51869	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021921	GTGTCA	2	12	63405	63416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021921	GGTTCT	2	12	69170	69181	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021921	TTCGAG	2	12	69442	69453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021921	TGTGGT	2	12	74463	74474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021921	CGTGTT	2	12	76634	76645	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021921	GTGCCG	2	12	81065	81076	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021921	AGGGGG	2	12	84112	84123	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021921	ACGCTG	2	12	164033	164044	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021921	GTCACG	2	12	286074	286085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021921	AGCCAC	2	12	287210	287221	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021921	CGTCAC	2	12	321311	321322	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021921	TCGCGC	2	12	327030	327041	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021921	CTACTC	2	12	351798	351809	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021921	GGTCGT	2	12	351858	351869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021921	TGGCGT	2	12	352922	352933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021921	CGTGGT	2	12	365320	365331	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021921	GTCCGC	2	12	453093	453104	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021921	CGCGAC	2	12	453206	453217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021921	CTACGA	2	12	453395	453406	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021921	CTGTCG	2	12	506123	506134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021921	AGGTGT	2	12	562381	562392	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021921	CTTCGC	2	12	582490	582501	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021921	GACGGC	2	12	627824	627835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021921	GGTCAT	2	12	650100	650111	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021921	GAGCGG	2	12	652175	652186	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021921	CGACAG	2	12	660929	660940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021921	AATTGA	2	12	675528	675539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021921	TCCCCC	2	12	705909	705920	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
30	NC_021921	GACTCA	2	12	739187	739198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021921	CGTCGG	2	12	882958	882969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021921	GTATAT	2	12	918979	918990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021921	AGTTAT	2	12	919033	919044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021921	GATTCT	2	12	921297	921308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021921	GACAAT	2	12	927002	927013	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021921	CTTTAG	2	12	976259	976270	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021921	TCTTTG	2	12	1027045	1027056	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021921	GTAGCG	2	12	1027433	1027444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021921	GTGAAT	2	12	1037832	1037843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021921	AGGAAC	2	12	1037850	1037861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021921	TCCGAT	2	12	1056352	1056363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021921	ATCGGA	2	12	1057284	1057295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021921	TAATAC	2	12	1060979	1060990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021921	GGAAAG	2	12	1062938	1062949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021921	CTACGA	2	12	1108641	1108652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021921	TCGTGT	2	12	1131303	1131314	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021921	GTCCCA	2	12	1137209	1137220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021921	ACGCAC	2	12	1157003	1157014	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021921	GTGAAA	2	12	1158781	1158792	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021921	CCCGTC	2	12	1180151	1180162	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021921	CCGCCA	2	12	1325650	1325661	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021921	CTCTCA	2	12	1359172	1359183	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021921	CGGCGA	2	12	1369559	1369570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021921	CCCTGT	2	12	1392583	1392594	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021921	AGTCGA	2	12	1392605	1392616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021921	AACGGG	2	12	1418769	1418780	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021921	AGTGAA	2	12	1481378	1481389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021921	GTCGGC	2	12	1490963	1490974	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021921	AATCCA	2	12	1602506	1602517	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021921	TGCTCA	2	12	1602639	1602650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021921	CCAATT	2	12	1646658	1646669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021921	GGCCGT	2	12	1660248	1660259	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021921	GGGGTT	2	12	1688212	1688223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021921	ACTCGG	2	12	1700472	1700483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021921	GGAACT	2	12	1701562	1701573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021921	TTCTAT	2	12	1707594	1707605	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021921	GCCGAG	2	12	1760262	1760273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021921	TACCAG	2	12	1774586	1774597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021921	GCCGAT	2	12	1780172	1780183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021921	GGGTTT	2	12	1801306	1801317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021921	TCATAC	2	12	1807385	1807396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021921	GCGATC	2	12	1807923	1807934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021921	CCGAAA	2	12	1847315	1847326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021921	CCGATA	2	12	1880586	1880597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021921	GCGAGC	2	12	1882045	1882056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021921	GTTCCC	2	12	1886321	1886332	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021921	TCGACG	2	12	1904903	1904914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021921	CGCGTC	2	12	1912293	1912304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021921	ATCGGC	2	12	1995564	1995575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021921	GCTTTC	2	12	2023120	2023131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021921	TCGGGA	2	12	2052607	2052618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021921	TTCCCA	2	12	2056279	2056290	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021921	GTTCCT	2	12	2072217	2072228	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021921	TTCACG	2	12	2072241	2072252	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021921	CGAGTT	2	12	2072388	2072399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021921	GTCGAC	2	12	2169234	2169245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021921	GCGACC	2	12	2195952	2195963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021921	AGTGAA	2	12	2208705	2208716	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021921	CGCCGA	2	12	2213040	2213051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021921	GATCGA	2	12	2260869	2260880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021921	CTGCCA	2	12	2368289	2368300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021921	CGGGAA	2	12	2375450	2375461	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021921	CGCGAA	2	12	2395668	2395679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021921	GTGACG	2	12	2411947	2411958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021921	CCGGAC	2	12	2518902	2518913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021921	GTTTAT	2	12	2530690	2530701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021921	TATATT	2	12	2572701	2572712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021921	GTTAAT	2	12	2584901	2584912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021921	CGACAG	2	12	2608109	2608120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021921	TCTCGT	2	12	2621140	2621151	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021921	GAACGT	2	12	2621335	2621346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021921	CCGGGC	2	12	2675583	2675594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021921	GGGCGA	2	12	2744170	2744181	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021921	AACGTG	2	12	2770490	2770501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.