MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 2025

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021921	CGAGA	2	10	2431	2440	40 %	0 %	40 %	20 %	529076463
2	NC_021921	TCCCG	2	10	4360	4369	0 %	20 %	20 %	60 %	529076464
3	NC_021921	TGGTC	2	10	5699	5708	0 %	40 %	40 %	20 %	529076465
4	NC_021921	CGCGT	2	10	7118	7127	0 %	20 %	40 %	40 %	529076466
5	NC_021921	TCCCG	2	10	8581	8590	0 %	20 %	20 %	60 %	529076467
6	NC_021921	CGACG	2	10	11162	11171	20 %	0 %	40 %	40 %	529076471
7	NC_021921	CGGCC	2	10	15145	15154	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_021921	GCCCG	2	10	16513	16522	0 %	0 %	40 %	60 %	529076477
9	NC_021921	GCTCG	2	10	17148	17157	0 %	20 %	40 %	40 %	529076477
10	NC_021921	ACCCG	2	10	18112	18121	20 %	0 %	20 %	60 %	529076478
11	NC_021921	GGACA	2	10	18203	18212	40 %	0 %	40 %	20 %	529076478
12	NC_021921	CAGGA	2	10	22489	22498	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021921	CGCCA	2	10	24543	24552	20 %	0 %	20 %	60 %	529076483
14	NC_021921	CCTCA	2	10	25291	25300	20 %	20 %	0 %	60 %	529076484
15	NC_021921	CGGGT	2	10	26191	26200	0 %	20 %	60 %	20 %	529076487
16	NC_021921	GGCGA	2	10	29056	29065	20 %	0 %	60 %	20 %	529076488
17	NC_021921	GCGCT	2	10	29104	29113	0 %	20 %	40 %	40 %	529076488
18	NC_021921	ACGTC	2	10	31343	31352	20 %	20 %	20 %	40 %	529076489
19	NC_021921	CGGGT	2	10	31680	31689	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021921	CGTTT	2	10	33684	33693	0 %	60 %	20 %	20 %	529076492
21	NC_021921	TCGTC	2	10	33810	33819	0 %	40 %	20 %	40 %	529076493
22	NC_021921	CGTCG	2	10	34027	34036	0 %	20 %	40 %	40 %	529076494
23	NC_021921	GACTC	2	10	34975	34984	20 %	20 %	20 %	40 %	529076494
24	NC_021921	CGACG	2	10	35299	35308	20 %	0 %	40 %	40 %	529076495
25	NC_021921	CGACC	2	10	36593	36602	20 %	0 %	20 %	60 %	529076496
26	NC_021921	CAGCG	2	10	38095	38104	20 %	0 %	40 %	40 %	529076498
27	NC_021921	AGGCG	2	10	38124	38133	20 %	0 %	60 %	20 %	529076498
28	NC_021921	CAAGC	2	10	39329	39338	40 %	0 %	20 %	40 %	529076499
29	NC_021921	TGCTT	2	10	40627	40636	0 %	60 %	20 %	20 %	529076501
30	NC_021921	GGCGT	2	10	40821	40830	0 %	20 %	60 %	20 %	529076501
31	NC_021921	TGACG	2	10	41587	41596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021921	CCTCG	2	10	41859	41868	0 %	20 %	20 %	60 %	529076502
33	NC_021921	TCGGT	2	10	42408	42417	0 %	40 %	40 %	20 %	529076503
34	NC_021921	TTCGA	2	10	46949	46958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021921	TCCCG	2	10	49019	49028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_021921	CGTCA	2	10	50279	50288	20 %	20 %	20 %	40 %	529076512
37	NC_021921	GCCGT	2	10	50328	50337	0 %	20 %	40 %	40 %	529076512
38	NC_021921	CCGGT	2	10	51423	51432	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021921	CGGCA	2	10	51800	51809	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_021921	ACCGT	2	10	52243	52252	20 %	20 %	20 %	40 %	529076514
41	NC_021921	CGTCA	2	10	52273	52282	20 %	20 %	20 %	40 %	529076514
42	NC_021921	TCCTT	2	10	52343	52352	0 %	60 %	0 %	40 %	529076514
43	NC_021921	GACCG	2	10	53372	53381	20 %	0 %	40 %	40 %	529076514
44	NC_021921	ACCCG	2	10	55870	55879	20 %	0 %	20 %	60 %	529076516
45	NC_021921	CGGCG	2	10	57117	57126	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_021921	TCGCG	2	10	58827	58836	0 %	20 %	40 %	40 %	529076518
47	NC_021921	CGTTC	2	10	62882	62891	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021921	ACTGA	2	10	63016	63025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021921	CACTC	2	10	63384	63393	20 %	20 %	0 %	60 %	529076521
50	NC_021921	AAGCA	2	10	65432	65441	60 %	0 %	20 %	20 %	529076522
51	NC_021921	ACACC	2	10	69513	69522	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_021921	GTCGT	2	10	69909	69918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021921	ACCGT	2	10	71660	71669	20 %	20 %	20 %	40 %	529076529
54	NC_021921	TTCTC	2	10	72210	72219	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_021921	GACAC	2	10	72373	72382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021921	TACCT	2	10	73518	73527	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_021921	CAGGC	2	10	74631	74640	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_021921	CTGTG	2	10	76017	76026	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021921	ACCAC	2	10	76617	76626	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_021921	CTATA	2	10	80316	80325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021921	GGAAT	2	10	82306	82315	40 %	20 %	40 %	0 %	529076539
62	NC_021921	AGTTT	2	10	82689	82698	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021921	TCGCG	2	10	84145	84154	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021921	ACCGT	2	10	84191	84200	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021921	ACCCT	2	10	84206	84215	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_021921	CAGCG	2	10	86253	86262	20 %	0 %	40 %	40 %	529076543
67	NC_021921	TTTCG	2	10	86308	86317	0 %	60 %	20 %	20 %	529076543
68	NC_021921	GAACG	2	10	87117	87126	40 %	0 %	40 %	20 %	529076543
69	NC_021921	TCACG	2	10	93836	93845	20 %	20 %	20 %	40 %	529076548
70	NC_021921	CGGGA	2	10	95390	95399	20 %	0 %	60 %	20 %	529076549
71	NC_021921	CGCTG	2	10	97560	97569	0 %	20 %	40 %	40 %	529076550
72	NC_021921	GGACG	2	10	97924	97933	20 %	0 %	60 %	20 %	529076551
73	NC_021921	GGTCC	2	10	98106	98115	0 %	20 %	40 %	40 %	529076551
74	NC_021921	GCCGA	2	10	102378	102387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_021921	TCGAA	2	10	103550	103559	40 %	20 %	20 %	20 %	529076557
76	NC_021921	CCATC	2	10	107466	107475	20 %	20 %	0 %	60 %	529076562
77	NC_021921	TCGTG	2	10	107872	107881	0 %	40 %	40 %	20 %	529076562
78	NC_021921	CGAAT	2	10	108537	108546	40 %	20 %	20 %	20 %	529076563
79	NC_021921	TCGGC	2	10	109055	109064	0 %	20 %	40 %	40 %	529076564
80	NC_021921	CCGAT	2	10	109399	109408	20 %	20 %	20 %	40 %	529076564
81	NC_021921	CAAAT	2	10	109574	109583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021921	TACTC	2	10	109655	109664	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021921	ATCAA	2	10	111360	111369	60 %	20 %	0 %	20 %	529076566
84	NC_021921	CGGAC	2	10	115311	115320	20 %	0 %	40 %	40 %	529076569
85	NC_021921	CGATC	2	10	115379	115388	20 %	20 %	20 %	40 %	529076569
86	NC_021921	TCAGA	2	10	116694	116703	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021921	TGGCG	2	10	117357	117366	0 %	20 %	60 %	20 %	529076570
88	NC_021921	GACGG	2	10	118104	118113	20 %	0 %	60 %	20 %	529076571
89	NC_021921	GTGAC	2	10	119860	119869	20 %	20 %	40 %	20 %	529076572
90	NC_021921	CGAAC	2	10	120168	120177	40 %	0 %	20 %	40 %	529076572
91	NC_021921	TCGGC	2	10	121525	121534	0 %	20 %	40 %	40 %	529076574
92	NC_021921	ATCGA	2	10	123826	123835	40 %	20 %	20 %	20 %	529076578
93	NC_021921	CGACG	2	10	128371	128380	20 %	0 %	40 %	40 %	529076585
94	NC_021921	CGGGA	2	10	128828	128837	20 %	0 %	60 %	20 %	529076585
95	NC_021921	ACAGA	2	10	130805	130814	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_021921	GCTGA	2	10	131422	131431	20 %	20 %	40 %	20 %	529076590
97	NC_021921	GAGGT	2	10	131661	131670	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021921	GACTC	2	10	131705	131714	20 %	20 %	20 %	40 %	529076591
99	NC_021921	CGTCG	2	10	132173	132182	0 %	20 %	40 %	40 %	529076591
100	NC_021921	CGGCC	2	10	137018	137027	0 %	0 %	40 %	60 %	529076596
101	NC_021921	CGGGC	2	10	139906	139915	0 %	0 %	60 %	40 %	529076600
102	NC_021921	CGTCG	2	10	140684	140693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021921	CCGTC	2	10	143556	143565	0 %	20 %	20 %	60 %	529076603
104	NC_021921	GCGAC	2	10	143713	143722	20 %	0 %	40 %	40 %	529076603
105	NC_021921	GTCGC	2	10	146976	146985	0 %	20 %	40 %	40 %	529076603
106	NC_021921	CGTCG	2	10	148439	148448	0 %	20 %	40 %	40 %	529076604
107	NC_021921	CCCAC	2	10	148622	148631	20 %	0 %	0 %	80 %	529076605
108	NC_021921	TCGAT	2	10	149335	149344	20 %	40 %	20 %	20 %	529076606
109	NC_021921	CGGTC	2	10	154224	154233	0 %	20 %	40 %	40 %	529076610
110	NC_021921	ATTTC	2	10	154248	154257	20 %	60 %	0 %	20 %	529076610
111	NC_021921	CAACG	2	10	156386	156395	40 %	0 %	20 %	40 %	529076612
112	NC_021921	GAACT	2	10	158591	158600	40 %	20 %	20 %	20 %	529076614
113	NC_021921	CGCGC	2	10	159437	159446	0 %	0 %	40 %	60 %	529076616
114	NC_021921	CGTTC	2	10	162676	162685	0 %	40 %	20 %	40 %	529076622
115	NC_021921	GGGGT	2	10	163309	163318	0 %	20 %	80 %	0 %	529076622
116	NC_021921	AGTTG	2	10	163842	163851	20 %	40 %	40 %	0 %	529076622
117	NC_021921	GTTGA	2	10	163982	163991	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021921	TCATC	2	10	167298	167307	20 %	40 %	0 %	40 %	529076625
119	NC_021921	GCGAT	2	10	167882	167891	20 %	20 %	40 %	20 %	529076625
120	NC_021921	GTCGG	2	10	169222	169231	0 %	20 %	60 %	20 %	529076627
121	NC_021921	GAACA	2	10	170378	170387	60 %	0 %	20 %	20 %	529076628
122	NC_021921	TTCGG	2	10	170700	170709	0 %	40 %	40 %	20 %	529076629
123	NC_021921	CCCCG	2	10	173079	173088	0 %	0 %	20 %	80 %	529076631
124	NC_021921	TTCCG	2	10	174775	174784	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_021921	CCGTC	2	10	175389	175398	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_021921	GGCGA	2	10	177281	177290	20 %	0 %	60 %	20 %	529076639
127	NC_021921	CGATC	2	10	178102	178111	20 %	20 %	20 %	40 %	529076639
128	NC_021921	GGAGA	2	10	179380	179389	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021921	CGTGA	2	10	180097	180106	20 %	20 %	40 %	20 %	529076643
130	NC_021921	GTCGA	2	10	181120	181129	20 %	20 %	40 %	20 %	529076644
131	NC_021921	CGTGA	2	10	187288	187297	20 %	20 %	40 %	20 %	529076651
132	NC_021921	TCGAT	2	10	187478	187487	20 %	40 %	20 %	20 %	529076651
133	NC_021921	AGATT	2	10	188459	188468	40 %	40 %	20 %	0 %	529076652
134	NC_021921	GTGAT	2	10	189150	189159	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021921	CGGGC	2	10	190069	190078	0 %	0 %	60 %	40 %	529076654
136	NC_021921	CGTCG	2	10	192824	192833	0 %	20 %	40 %	40 %	529076657
137	NC_021921	CGTCC	2	10	193012	193021	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_021921	AGCCG	2	10	193196	193205	20 %	0 %	40 %	40 %	529076658
139	NC_021921	AGGCG	2	10	197916	197925	20 %	0 %	60 %	20 %	529076660
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141	NC_021921	GCTCC	2	10	203027	203036	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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159	NC_021921	CGATT	2	10	214942	214951	20 %	40 %	20 %	20 %	529076673
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257	NC_021921	AGCGA	2	10	333100	333109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
258	NC_021921	AGCGA	2	10	333211	333220	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_021921	AGACG	2	10	340719	340728	40 %	0 %	40 %	20 %	529076802
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264	NC_021921	TCGCG	2	10	342649	342658	0 %	20 %	40 %	40 %	529076803
265	NC_021921	AACCG	2	10	343735	343744	40 %	0 %	20 %	40 %	529076804
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401	NC_021921	GGGAT	2	10	528637	528646	20 %	20 %	60 %	0 %	529077003
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436	NC_021921	TCGCT	2	10	582638	582647	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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