MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 1626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021921	CGAGA	2	10	2431	2440	40 %	0 %	40 %	20 %	529076463
2	NC_021921	TCCCG	2	10	4360	4369	0 %	20 %	20 %	60 %	529076464
3	NC_021921	TGGTC	2	10	5699	5708	0 %	40 %	40 %	20 %	529076465
4	NC_021921	CGCGT	2	10	7118	7127	0 %	20 %	40 %	40 %	529076466
5	NC_021921	TCCCG	2	10	8581	8590	0 %	20 %	20 %	60 %	529076467
6	NC_021921	CGACG	2	10	11162	11171	20 %	0 %	40 %	40 %	529076471
7	NC_021921	GCCCG	2	10	16513	16522	0 %	0 %	40 %	60 %	529076477
8	NC_021921	GCTCG	2	10	17148	17157	0 %	20 %	40 %	40 %	529076477
9	NC_021921	ACCCG	2	10	18112	18121	20 %	0 %	20 %	60 %	529076478
10	NC_021921	GGACA	2	10	18203	18212	40 %	0 %	40 %	20 %	529076478
11	NC_021921	CGCCA	2	10	24543	24552	20 %	0 %	20 %	60 %	529076483
12	NC_021921	CCTCA	2	10	25291	25300	20 %	20 %	0 %	60 %	529076484
13	NC_021921	CGGGT	2	10	26191	26200	0 %	20 %	60 %	20 %	529076487
14	NC_021921	GGCGA	2	10	29056	29065	20 %	0 %	60 %	20 %	529076488
15	NC_021921	GCGCT	2	10	29104	29113	0 %	20 %	40 %	40 %	529076488
16	NC_021921	ACGTC	2	10	31343	31352	20 %	20 %	20 %	40 %	529076489
17	NC_021921	CGTTT	2	10	33684	33693	0 %	60 %	20 %	20 %	529076492
18	NC_021921	TCGTC	2	10	33810	33819	0 %	40 %	20 %	40 %	529076493
19	NC_021921	CGTCG	2	10	34027	34036	0 %	20 %	40 %	40 %	529076494
20	NC_021921	GACTC	2	10	34975	34984	20 %	20 %	20 %	40 %	529076494
21	NC_021921	CGACG	2	10	35299	35308	20 %	0 %	40 %	40 %	529076495
22	NC_021921	CGACC	2	10	36593	36602	20 %	0 %	20 %	60 %	529076496
23	NC_021921	CAGCG	2	10	38095	38104	20 %	0 %	40 %	40 %	529076498
24	NC_021921	AGGCG	2	10	38124	38133	20 %	0 %	60 %	20 %	529076498
25	NC_021921	CAAGC	2	10	39329	39338	40 %	0 %	20 %	40 %	529076499
26	NC_021921	TGCTT	2	10	40627	40636	0 %	60 %	20 %	20 %	529076501
27	NC_021921	GGCGT	2	10	40821	40830	0 %	20 %	60 %	20 %	529076501
28	NC_021921	CCTCG	2	10	41859	41868	0 %	20 %	20 %	60 %	529076502
29	NC_021921	TCGGT	2	10	42408	42417	0 %	40 %	40 %	20 %	529076503
30	NC_021921	CGTCA	2	10	50279	50288	20 %	20 %	20 %	40 %	529076512
31	NC_021921	GCCGT	2	10	50328	50337	0 %	20 %	40 %	40 %	529076512
32	NC_021921	ACCGT	2	10	52243	52252	20 %	20 %	20 %	40 %	529076514
33	NC_021921	CGTCA	2	10	52273	52282	20 %	20 %	20 %	40 %	529076514
34	NC_021921	TCCTT	2	10	52343	52352	0 %	60 %	0 %	40 %	529076514
35	NC_021921	GACCG	2	10	53372	53381	20 %	0 %	40 %	40 %	529076514
36	NC_021921	ACCCG	2	10	55870	55879	20 %	0 %	20 %	60 %	529076516
37	NC_021921	TCGCG	2	10	58827	58836	0 %	20 %	40 %	40 %	529076518
38	NC_021921	CACTC	2	10	63384	63393	20 %	20 %	0 %	60 %	529076521
39	NC_021921	AAGCA	2	10	65432	65441	60 %	0 %	20 %	20 %	529076522
40	NC_021921	ACCGT	2	10	71660	71669	20 %	20 %	20 %	40 %	529076529
41	NC_021921	GGAAT	2	10	82306	82315	40 %	20 %	40 %	0 %	529076539
42	NC_021921	CAGCG	2	10	86253	86262	20 %	0 %	40 %	40 %	529076543
43	NC_021921	TTTCG	2	10	86308	86317	0 %	60 %	20 %	20 %	529076543
44	NC_021921	GAACG	2	10	87117	87126	40 %	0 %	40 %	20 %	529076543
45	NC_021921	TCACG	2	10	93836	93845	20 %	20 %	20 %	40 %	529076548
46	NC_021921	CGGGA	2	10	95390	95399	20 %	0 %	60 %	20 %	529076549
47	NC_021921	CGCTG	2	10	97560	97569	0 %	20 %	40 %	40 %	529076550
48	NC_021921	GGACG	2	10	97924	97933	20 %	0 %	60 %	20 %	529076551
49	NC_021921	GGTCC	2	10	98106	98115	0 %	20 %	40 %	40 %	529076551
50	NC_021921	TCGAA	2	10	103550	103559	40 %	20 %	20 %	20 %	529076557
51	NC_021921	CCATC	2	10	107466	107475	20 %	20 %	0 %	60 %	529076562
52	NC_021921	TCGTG	2	10	107872	107881	0 %	40 %	40 %	20 %	529076562
53	NC_021921	CGAAT	2	10	108537	108546	40 %	20 %	20 %	20 %	529076563
54	NC_021921	TCGGC	2	10	109055	109064	0 %	20 %	40 %	40 %	529076564
55	NC_021921	CCGAT	2	10	109399	109408	20 %	20 %	20 %	40 %	529076564
56	NC_021921	ATCAA	2	10	111360	111369	60 %	20 %	0 %	20 %	529076566
57	NC_021921	CGGAC	2	10	115311	115320	20 %	0 %	40 %	40 %	529076569
58	NC_021921	CGATC	2	10	115379	115388	20 %	20 %	20 %	40 %	529076569
59	NC_021921	TGGCG	2	10	117357	117366	0 %	20 %	60 %	20 %	529076570
60	NC_021921	GACGG	2	10	118104	118113	20 %	0 %	60 %	20 %	529076571
61	NC_021921	GTGAC	2	10	119860	119869	20 %	20 %	40 %	20 %	529076572
62	NC_021921	CGAAC	2	10	120168	120177	40 %	0 %	20 %	40 %	529076572
63	NC_021921	TCGGC	2	10	121525	121534	0 %	20 %	40 %	40 %	529076574
64	NC_021921	ATCGA	2	10	123826	123835	40 %	20 %	20 %	20 %	529076578
65	NC_021921	CGACG	2	10	128371	128380	20 %	0 %	40 %	40 %	529076585
66	NC_021921	CGGGA	2	10	128828	128837	20 %	0 %	60 %	20 %	529076585
67	NC_021921	GCTGA	2	10	131422	131431	20 %	20 %	40 %	20 %	529076590
68	NC_021921	GACTC	2	10	131705	131714	20 %	20 %	20 %	40 %	529076591
69	NC_021921	CGTCG	2	10	132173	132182	0 %	20 %	40 %	40 %	529076591
70	NC_021921	CGGCC	2	10	137018	137027	0 %	0 %	40 %	60 %	529076596
71	NC_021921	CGGGC	2	10	139906	139915	0 %	0 %	60 %	40 %	529076600
72	NC_021921	CCGTC	2	10	143556	143565	0 %	20 %	20 %	60 %	529076603
73	NC_021921	GCGAC	2	10	143713	143722	20 %	0 %	40 %	40 %	529076603
74	NC_021921	GTCGC	2	10	146976	146985	0 %	20 %	40 %	40 %	529076603
75	NC_021921	CGTCG	2	10	148439	148448	0 %	20 %	40 %	40 %	529076604
76	NC_021921	CCCAC	2	10	148622	148631	20 %	0 %	0 %	80 %	529076605
77	NC_021921	TCGAT	2	10	149335	149344	20 %	40 %	20 %	20 %	529076606
78	NC_021921	CGGTC	2	10	154224	154233	0 %	20 %	40 %	40 %	529076610
79	NC_021921	ATTTC	2	10	154248	154257	20 %	60 %	0 %	20 %	529076610
80	NC_021921	CAACG	2	10	156386	156395	40 %	0 %	20 %	40 %	529076612
81	NC_021921	GAACT	2	10	158591	158600	40 %	20 %	20 %	20 %	529076614
82	NC_021921	CGCGC	2	10	159437	159446	0 %	0 %	40 %	60 %	529076616
83	NC_021921	CGTTC	2	10	162676	162685	0 %	40 %	20 %	40 %	529076622
84	NC_021921	GGGGT	2	10	163309	163318	0 %	20 %	80 %	0 %	529076622
85	NC_021921	AGTTG	2	10	163842	163851	20 %	40 %	40 %	0 %	529076622
86	NC_021921	TCATC	2	10	167298	167307	20 %	40 %	0 %	40 %	529076625
87	NC_021921	GCGAT	2	10	167882	167891	20 %	20 %	40 %	20 %	529076625
88	NC_021921	GTCGG	2	10	169222	169231	0 %	20 %	60 %	20 %	529076627
89	NC_021921	GAACA	2	10	170378	170387	60 %	0 %	20 %	20 %	529076628
90	NC_021921	TTCGG	2	10	170700	170709	0 %	40 %	40 %	20 %	529076629
91	NC_021921	CCCCG	2	10	173079	173088	0 %	0 %	20 %	80 %	529076631
92	NC_021921	GGCGA	2	10	177281	177290	20 %	0 %	60 %	20 %	529076639
93	NC_021921	CGATC	2	10	178102	178111	20 %	20 %	20 %	40 %	529076639
94	NC_021921	CGTGA	2	10	180097	180106	20 %	20 %	40 %	20 %	529076643
95	NC_021921	GTCGA	2	10	181120	181129	20 %	20 %	40 %	20 %	529076644
96	NC_021921	CGTGA	2	10	187288	187297	20 %	20 %	40 %	20 %	529076651
97	NC_021921	TCGAT	2	10	187478	187487	20 %	40 %	20 %	20 %	529076651
98	NC_021921	AGATT	2	10	188459	188468	40 %	40 %	20 %	0 %	529076652
99	NC_021921	CGGGC	2	10	190069	190078	0 %	0 %	60 %	40 %	529076654
100	NC_021921	CGTCG	2	10	192824	192833	0 %	20 %	40 %	40 %	529076657
101	NC_021921	AGCCG	2	10	193196	193205	20 %	0 %	40 %	40 %	529076658
102	NC_021921	AGGCG	2	10	197916	197925	20 %	0 %	60 %	20 %	529076660
103	NC_021921	GCGAT	2	10	204288	204297	20 %	20 %	40 %	20 %	529076666
104	NC_021921	TCTCC	2	10	204850	204859	0 %	40 %	0 %	60 %	529076666
105	NC_021921	CGGAT	2	10	204933	204942	20 %	20 %	40 %	20 %	529076666
106	NC_021921	CGATC	2	10	206149	206158	20 %	20 %	20 %	40 %	529076668
107	NC_021921	TCGCG	2	10	206700	206709	0 %	20 %	40 %	40 %	529076668
108	NC_021921	CCGAA	2	10	207628	207637	40 %	0 %	20 %	40 %	529076668
109	NC_021921	GTGGG	2	10	208572	208581	0 %	20 %	80 %	0 %	529076669
110	NC_021921	TCGGT	2	10	209582	209591	0 %	40 %	40 %	20 %	529076670
111	NC_021921	GGCAC	2	10	210241	210250	20 %	0 %	40 %	40 %	529076671
112	NC_021921	CGTCG	2	10	210527	210536	0 %	20 %	40 %	40 %	529076671
113	NC_021921	GACCG	2	10	210927	210936	20 %	0 %	40 %	40 %	529076672
114	NC_021921	AGTCG	2	10	211294	211303	20 %	20 %	40 %	20 %	529076672
115	NC_021921	GATCA	2	10	211997	212006	40 %	20 %	20 %	20 %	529076672
116	NC_021921	CGACG	2	10	213418	213427	20 %	0 %	40 %	40 %	529076672
117	NC_021921	CGATC	2	10	213490	213499	20 %	20 %	20 %	40 %	529076672
118	NC_021921	ACGAC	2	10	213762	213771	40 %	0 %	20 %	40 %	529076672
119	NC_021921	TCGGC	2	10	214048	214057	0 %	20 %	40 %	40 %	529076672
120	NC_021921	CGATT	2	10	214942	214951	20 %	40 %	20 %	20 %	529076673
121	NC_021921	GTGTG	2	10	215898	215907	0 %	40 %	60 %	0 %	529076675
122	NC_021921	AGTCG	2	10	216180	216189	20 %	20 %	40 %	20 %	529076675
123	NC_021921	TCGAT	2	10	222244	222253	20 %	40 %	20 %	20 %	529076683
124	NC_021921	TGGCT	2	10	222447	222456	0 %	40 %	40 %	20 %	529076683
125	NC_021921	CGGCC	2	10	222529	222538	0 %	0 %	40 %	60 %	529076683
126	NC_021921	CGGGC	2	10	224586	224595	0 %	0 %	60 %	40 %	529076685
127	NC_021921	GCTGG	2	10	225043	225052	0 %	20 %	60 %	20 %	529076685
128	NC_021921	CGACG	2	10	225452	225461	20 %	0 %	40 %	40 %	529076685
129	NC_021921	ATCGA	2	10	226007	226016	40 %	20 %	20 %	20 %	529076686
130	NC_021921	CGTTC	2	10	226332	226341	0 %	40 %	20 %	40 %	529076687
131	NC_021921	ATGGT	2	10	227052	227061	20 %	40 %	40 %	0 %	529076689
132	NC_021921	CGAGC	2	10	227438	227447	20 %	0 %	40 %	40 %	529076689
133	NC_021921	CCCAG	2	10	228289	228298	20 %	0 %	20 %	60 %	529076690
134	NC_021921	TCGAC	2	10	228814	228823	20 %	20 %	20 %	40 %	529076690
135	NC_021921	CCGTT	2	10	229819	229828	0 %	40 %	20 %	40 %	529076691
136	NC_021921	CGTCG	2	10	231156	231165	0 %	20 %	40 %	40 %	529076692
137	NC_021921	GATCC	2	10	231237	231246	20 %	20 %	20 %	40 %	529076692
138	NC_021921	CGCTC	2	10	231325	231334	0 %	20 %	20 %	60 %	529076693
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148	NC_021921	GATCG	2	10	240015	240024	20 %	20 %	40 %	20 %	529076701
149	NC_021921	GGCGA	2	10	240297	240306	20 %	0 %	60 %	20 %	529076702
150	NC_021921	ACGAG	2	10	240898	240907	40 %	0 %	40 %	20 %	529076702
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156	NC_021921	GGCGA	2	10	247360	247369	20 %	0 %	60 %	20 %	529076707
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163	NC_021921	CGACT	2	10	259126	259135	20 %	20 %	20 %	40 %	529076717
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172	NC_021921	TCGCG	2	10	270218	270227	0 %	20 %	40 %	40 %	529076729
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249	NC_021921	TCGAC	2	10	405298	405307	20 %	20 %	20 %	40 %	529076867
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251	NC_021921	CGATC	2	10	408189	408198	20 %	20 %	20 %	40 %	529076872
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253	NC_021921	GCGGA	2	10	410719	410728	20 %	0 %	60 %	20 %	529076876
254	NC_021921	ACTCG	2	10	412250	412259	20 %	20 %	20 %	40 %	529076878
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256	NC_021921	TCGCC	2	10	413879	413888	0 %	20 %	20 %	60 %	529076879
257	NC_021921	CGCCC	2	10	418468	418477	0 %	0 %	20 %	80 %	529076885
258	NC_021921	GATCG	2	10	420991	421000	20 %	20 %	40 %	20 %	529076888
259	NC_021921	TCGAT	2	10	421481	421490	20 %	40 %	20 %	20 %	529076888
260	NC_021921	GCTCG	2	10	429163	429172	0 %	20 %	40 %	40 %	529076897
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