MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B complete genome

Total Repeats: 45692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021921	GCT	2	6	192	197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
2	NC_021921	GCC	2	6	210	215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
3	NC_021921	CGT	2	6	230	235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
4	NC_021921	CGT	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
5	NC_021921	CGA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
6	NC_021921	GCC	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
7	NC_021921	GCA	2	6	434	439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
8	NC_021921	CGT	2	6	473	478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
9	NC_021921	CCG	2	6	489	494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
10	NC_021921	CAG	2	6	513	518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
11	NC_021921	ATC	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076461
12	NC_021921	GAA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076461
13	NC_021921	AGT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076461
14	NC_021921	ACG	2	6	685	690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
15	NC_021921	TAG	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076461
16	NC_021921	CGC	2	6	726	731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
17	NC_021921	GAT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076461
18	NC_021921	CGA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
19	NC_021921	AAC	2	6	787	792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529076461
20	NC_021921	TCG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
21	NC_021921	TGG	2	6	934	939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076461
22	NC_021921	GAC	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
23	NC_021921	GAT	2	6	1029	1034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076461
24	NC_021921	AGA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076461
25	NC_021921	GAA	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076461
26	NC_021921	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076461
27	NC_021921	CAG	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
28	NC_021921	GAT	3	9	1212	1220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076461
29	NC_021921	CGT	2	6	1274	1279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
30	NC_021921	TCG	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
31	NC_021921	AGG	2	6	1418	1423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076461
32	NC_021921	CGG	2	6	1479	1484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076461
33	NC_021921	GTC	2	6	1527	1532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
34	NC_021921	CAG	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
35	NC_021921	AGT	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076461
36	NC_021921	GCC	2	6	1570	1575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
37	NC_021921	CGT	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076461
38	NC_021921	ACG	3	9	1690	1698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076461
39	NC_021921	CCG	2	6	1705	1710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
40	NC_021921	AGG	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076461
41	NC_021921	CGC	2	6	1790	1795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
42	NC_021921	CGC	2	6	1838	1843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
43	NC_021921	CGC	2	6	1890	1895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076461
44	NC_021921	GAC	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076462
45	NC_021921	CGG	2	6	2111	2116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076462
46	NC_021921	CTC	2	6	2117	2122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076462
47	NC_021921	CAT	2	6	2192	2197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076462
48	NC_021921	CGA	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076462
49	NC_021921	CGA	3	9	2257	2265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076462
50	NC_021921	CGA	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076462
51	NC_021921	CGA	2	6	2499	2504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076463
52	NC_021921	GAG	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076463
53	NC_021921	CGA	3	9	2565	2573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076463
54	NC_021921	CCG	2	6	2576	2581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076463
55	NC_021921	ACG	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076463
56	NC_021921	GAC	2	6	2593	2598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076463
57	NC_021921	GCC	2	6	2616	2621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076463
58	NC_021921	GGA	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076463
59	NC_021921	CCG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076463
60	NC_021921	CGA	2	6	2751	2756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076463
61	NC_021921	CCG	2	6	2776	2781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076463
62	NC_021921	CGA	2	6	2986	2991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
63	NC_021921	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
64	NC_021921	CTG	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
65	NC_021921	CGA	2	6	3217	3222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
66	NC_021921	CGC	2	6	3252	3257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076464
67	NC_021921	TCG	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
68	NC_021921	GCG	2	6	3330	3335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076464
69	NC_021921	ACT	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076464
70	NC_021921	CGT	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
71	NC_021921	GGT	2	6	3356	3361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076464
72	NC_021921	TCG	2	6	3381	3386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
73	NC_021921	AGG	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076464
74	NC_021921	TCG	3	9	3512	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
75	NC_021921	TGG	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076464
76	NC_021921	CAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
77	NC_021921	GGC	2	6	3613	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076464
78	NC_021921	CGA	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
79	NC_021921	CGA	3	9	3646	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
80	NC_021921	GAG	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076464
81	NC_021921	GAG	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076464
82	NC_021921	TAC	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076464
83	NC_021921	AGT	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076464
84	NC_021921	AGT	2	6	3806	3811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076464
85	NC_021921	AGT	2	6	3824	3829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076464
86	NC_021921	CGC	2	6	3837	3842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076464
87	NC_021921	CCT	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076464
88	NC_021921	CGA	2	6	3979	3984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
89	NC_021921	CGA	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
90	NC_021921	CGG	2	6	4163	4168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076464
91	NC_021921	GGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076464
92	NC_021921	GTC	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
93	NC_021921	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076464
94	NC_021921	CGA	2	6	4534	4539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
95	NC_021921	GAC	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
96	NC_021921	GAG	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076464
97	NC_021921	CGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
98	NC_021921	CGG	2	6	4929	4934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076464
99	NC_021921	TCG	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
100	NC_021921	GAG	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076464
101	NC_021921	CGA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
102	NC_021921	CTC	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076464
103	NC_021921	CGA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
104	NC_021921	CGT	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
105	NC_021921	TCG	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
106	NC_021921	CCG	2	6	5346	5351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076464
107	NC_021921	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076464
108	NC_021921	GCC	2	6	5423	5428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076464
109	NC_021921	GAC	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076464
110	NC_021921	CGG	3	9	5452	5460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076464
111	NC_021921	GCT	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076464
112	NC_021921	GTC	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076465
113	NC_021921	TGG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529076465
114	NC_021921	TGA	2	6	6113	6118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076466
115	NC_021921	CGA	2	6	6147	6152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076466
116	NC_021921	GTC	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076466
117	NC_021921	CGA	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076466
118	NC_021921	CGT	3	9	6195	6203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076466
119	NC_021921	CGA	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076466
120	NC_021921	GCG	2	6	6281	6286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076466
121	NC_021921	CGA	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076466
122	NC_021921	GAG	2	6	6451	6456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076466
123	NC_021921	GAC	2	6	6472	6477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076466
124	NC_021921	CGT	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076466
125	NC_021921	CGC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076466
126	NC_021921	GAG	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076466
127	NC_021921	GAG	2	6	6697	6702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076466
128	NC_021921	ATC	2	6	6820	6825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076466
129	NC_021921	CCT	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076466
130	NC_021921	CGG	2	6	6876	6881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076466
131	NC_021921	GTC	2	6	6931	6936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076466
132	NC_021921	GCG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076466
133	NC_021921	ACG	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076466
134	NC_021921	GAA	2	6	7057	7062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076466
135	NC_021921	ACC	2	6	7285	7290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529076466
136	NC_021921	CGA	2	6	7422	7427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076466
137	NC_021921	ACT	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076467
138	NC_021921	GAT	2	6	7639	7644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529076467
139	NC_021921	CGG	2	6	7647	7652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076467
140	NC_021921	CGT	2	6	7713	7718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076467
141	NC_021921	CCG	2	6	7825	7830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076467
142	NC_021921	CGT	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076467
143	NC_021921	CGA	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076467
144	NC_021921	GTC	2	6	8110	8115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076467
145	NC_021921	CCG	2	6	8131	8136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076467
146	NC_021921	CGC	2	6	8310	8315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076467
147	NC_021921	ACG	2	6	8372	8377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076467
148	NC_021921	CGA	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076467
149	NC_021921	TCG	2	6	8504	8509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076467
150	NC_021921	CGT	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076467
151	NC_021921	AAG	2	6	8727	8732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076468
152	NC_021921	CAT	2	6	8743	8748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076468
153	NC_021921	CTG	2	6	8749	8754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076468
154	NC_021921	TCG	2	6	8811	8816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076468
155	NC_021921	CCG	2	6	8885	8890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076468
156	NC_021921	GAA	2	6	8984	8989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529076469
157	NC_021921	CGA	3	9	9088	9096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076469
158	NC_021921	GTC	2	6	9209	9214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076469
159	NC_021921	CGA	2	6	9292	9297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076469
160	NC_021921	TCG	3	9	9396	9404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076469
161	NC_021921	TCG	3	9	9435	9443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076469
162	NC_021921	TCG	2	6	9477	9482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076469
163	NC_021921	TCG	2	6	9498	9503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076469
164	NC_021921	TCA	2	6	9630	9635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076470
165	NC_021921	CCG	3	9	9642	9650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076470
166	NC_021921	GCT	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076470
167	NC_021921	CGA	2	6	9670	9675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076470
168	NC_021921	GAC	2	6	9829	9834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076470
169	NC_021921	GCC	2	6	9869	9874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076470
170	NC_021921	CCT	2	6	9970	9975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529076470
171	NC_021921	TCG	3	9	9978	9986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076470
172	NC_021921	TCG	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076470
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249	NC_021921	TCA	2	6	14267	14272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076475
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251	NC_021921	CGG	2	6	14351	14356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076475
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253	NC_021921	CCG	2	6	14396	14401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076475
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377	NC_021921	CGA	2	6	20516	20521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076479
378	NC_021921	CGG	2	6	20576	20581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076479
379	NC_021921	CTG	2	6	20589	20594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076479
380	NC_021921	GAC	2	6	20625	20630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076479
381	NC_021921	GAC	2	6	20643	20648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529076479
382	NC_021921	GAG	2	6	20658	20663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529076479
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384	NC_021921	CTA	2	6	20825	20830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529076479
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497	NC_021921	GCG	2	6	26917	26922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529076487
498	NC_021921	CTT	2	6	26994	26999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529076487
499	NC_021921	CGC	3	9	27027	27035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529076487
500	NC_021921	CGT	2	6	27073	27078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529076487

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