MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium maris DSM 45190 plasmid pCmaris1

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021920	GTCG	2	8	404	411	0 %	25 %	50 %	25 %	529067772
2	NC_021920	GTGC	2	8	2368	2375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021920	CGGG	2	8	3482	3489	0 %	0 %	75 %	25 %	529067776
4	NC_021920	GTGG	2	8	3571	3578	0 %	25 %	75 %	0 %	529067777
5	NC_021920	GCAC	2	8	3692	3699	25 %	0 %	25 %	50 %	529067777
6	NC_021920	GCGG	2	8	3720	3727	0 %	0 %	75 %	25 %	529067777
7	NC_021920	TGTA	2	8	4212	4219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021920	CAGC	2	8	4290	4297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021920	TTAG	2	8	4383	4390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021920	TGTA	2	8	4609	4616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021920	TACA	2	8	4626	4633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021920	TCTG	2	8	4774	4781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021920	ACCC	2	8	5533	5540	25 %	0 %	0 %	75 %	529067778
14	NC_021920	TCGG	2	8	5858	5865	0 %	25 %	50 %	25 %	529067778
15	NC_021920	GACG	2	8	5968	5975	25 %	0 %	50 %	25 %	529067778
16	NC_021920	CTGA	2	8	6136	6143	25 %	25 %	25 %	25 %	529067778
17	NC_021920	AAGA	2	8	7084	7091	75 %	0 %	25 %	0 %	529067779
18	NC_021920	CCCA	2	8	7269	7276	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_021920	GTTC	2	8	7533	7540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021920	GCAG	2	8	7672	7679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021920	AGCA	2	8	8607	8614	50 %	0 %	25 %	25 %	529067780
22	NC_021920	GCTC	2	8	8741	8748	0 %	25 %	25 %	50 %	529067780
23	NC_021920	GTAG	2	8	8868	8875	25 %	25 %	50 %	0 %	529067780
24	NC_021920	ATAA	2	8	9478	9485	75 %	25 %	0 %	0 %	529067780
25	NC_021920	TTCC	2	8	9494	9501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021920	CGGC	2	8	10273	10280	0 %	0 %	50 %	50 %	529067781
27	NC_021920	CGCC	2	8	10858	10865	0 %	0 %	25 %	75 %	529067781
28	NC_021920	GACG	2	8	11117	11124	25 %	0 %	50 %	25 %	529067781
29	NC_021920	AGTG	2	8	11467	11474	25 %	25 %	50 %	0 %	529067781
30	NC_021920	CGCC	2	8	12205	12212	0 %	0 %	25 %	75 %	529067782
31	NC_021920	GCCA	2	8	12537	12544	25 %	0 %	25 %	50 %	529067782
32	NC_021920	TCGG	2	8	12558	12565	0 %	25 %	50 %	25 %	529067782
33	NC_021920	GCCG	2	8	13542	13549	0 %	0 %	50 %	50 %	529067782
34	NC_021920	CTGA	2	8	13956	13963	25 %	25 %	25 %	25 %	529067782
35	NC_021920	CCAC	2	8	14000	14007	25 %	0 %	0 %	75 %	529067782
36	NC_021920	GGCC	2	8	14432	14439	0 %	0 %	50 %	50 %	529067782
37	NC_021920	TTTG	2	8	14908	14915	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021920	CATC	2	8	16248	16255	25 %	25 %	0 %	50 %	529067783
39	NC_021920	TGGT	2	8	16573	16580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021920	ACAG	2	8	17266	17273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021920	GTGC	2	8	17328	17335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021920	GCCC	2	8	17500	17507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_021920	GGCC	2	8	18057	18064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021920	GCCC	2	8	18235	18242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_021920	GCAT	2	8	18329	18336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021920	CGCC	2	8	18579	18586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_021920	CTCG	2	8	18672	18679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021920	GCGG	2	8	18719	18726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021920	CGGG	2	8	19064	19071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021920	GTGC	2	8	19512	19519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021920	GCCG	2	8	19941	19948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021920	GACG	2	8	20328	20335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021920	GGAC	2	8	20530	20537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021920	GACC	2	8	20600	20607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021920	ACCG	2	8	21485	21492	25 %	0 %	25 %	50 %	529067785
56	NC_021920	GCCT	2	8	21575	21582	0 %	25 %	25 %	50 %	529067785
57	NC_021920	GTGG	2	8	22233	22240	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021920	GTGG	2	8	22997	23004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021920	GCAG	2	8	23087	23094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021920	GGTT	2	8	23132	23139	0 %	50 %	50 %	0 %	529067787
61	NC_021920	GTCG	2	8	23495	23502	0 %	25 %	50 %	25 %	529067787
62	NC_021920	CAGG	2	8	23544	23551	25 %	0 %	50 %	25 %	529067787
63	NC_021920	GGCG	2	8	23642	23649	0 %	0 %	75 %	25 %	529067787
64	NC_021920	GGGT	2	8	23901	23908	0 %	25 %	75 %	0 %	529067787
65	NC_021920	CACG	2	8	23933	23940	25 %	0 %	25 %	50 %	529067787
66	NC_021920	TCGT	2	8	24725	24732	0 %	50 %	25 %	25 %	529067788
67	NC_021920	GGCG	2	8	24906	24913	0 %	0 %	75 %	25 %	529067788
68	NC_021920	GGCG	2	8	25359	25366	0 %	0 %	75 %	25 %	529067788
69	NC_021920	ACGA	2	8	25601	25608	50 %	0 %	25 %	25 %	529067788
70	NC_021920	GCTT	2	8	25688	25695	0 %	50 %	25 %	25 %	529067788
71	NC_021920	GGAG	2	8	26044	26051	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021920	GGGC	2	8	26083	26090	0 %	0 %	75 %	25 %	529067789
73	NC_021920	CCGA	2	8	26139	26146	25 %	0 %	25 %	50 %	529067789
74	NC_021920	CTAT	2	8	26535	26542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021920	TTAC	2	8	26694	26701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021920	TATT	2	8	26883	26890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021920	GTAG	2	8	26970	26977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021920	AGGG	2	8	27488	27495	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021920	ACGG	2	8	29132	29139	25 %	0 %	50 %	25 %	529067791
80	NC_021920	ATCC	2	8	29730	29737	25 %	25 %	0 %	50 %	529067792
81	NC_021920	GCCC	2	8	29911	29918	0 %	0 %	25 %	75 %	529067792
82	NC_021920	CACC	2	8	30273	30280	25 %	0 %	0 %	75 %	529067792
83	NC_021920	GACG	2	8	30558	30565	25 %	0 %	50 %	25 %	529067792
84	NC_021920	TCGG	2	8	31828	31835	0 %	25 %	50 %	25 %	529067793
85	NC_021920	GGTG	2	8	33211	33218	0 %	25 %	75 %	0 %	529067795
86	NC_021920	AGCC	2	8	33262	33269	25 %	0 %	25 %	50 %	529067795
87	NC_021920	CAGG	2	8	33488	33495	25 %	0 %	50 %	25 %	529067796
88	NC_021920	CGGG	2	8	33564	33571	0 %	0 %	75 %	25 %	529067796
89	NC_021920	CCTG	2	8	33628	33635	0 %	25 %	25 %	50 %	529067796
90	NC_021920	CGGG	2	8	33782	33789	0 %	0 %	75 %	25 %	529067796
91	NC_021920	GGAC	2	8	34048	34055	25 %	0 %	50 %	25 %	529067796
92	NC_021920	CCTC	2	8	34209	34216	0 %	25 %	0 %	75 %	529067796
93	NC_021920	TCGG	2	8	34418	34425	0 %	25 %	50 %	25 %	529067796
94	NC_021920	TTCG	2	8	34796	34803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021920	AAGT	2	8	34953	34960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021920	GGTT	2	8	35088	35095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021920	CAGG	2	8	35186	35193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021920	CATA	2	8	35313	35320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021920	GGGA	2	8	35542	35549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021920	TGGG	2	8	35685	35692	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021920	AGGG	2	8	36131	36138	25 %	0 %	75 %	0 %	529067797
102	NC_021920	CACC	2	8	36409	36416	25 %	0 %	0 %	75 %	529067797
103	NC_021920	GGCA	2	8	36757	36764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021920	TCAG	2	8	36976	36983	25 %	25 %	25 %	25 %	529067799
105	NC_021920	GCTC	2	8	37511	37518	0 %	25 %	25 %	50 %	529067800
106	NC_021920	TCAG	2	8	38154	38161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021920	GACC	2	8	39260	39267	25 %	0 %	25 %	50 %	529067801
108	NC_021920	CACC	2	8	39593	39600	25 %	0 %	0 %	75 %	529067801
109	NC_021920	GACT	2	8	39965	39972	25 %	25 %	25 %	25 %	529067802
110	NC_021920	GCGA	2	8	40684	40691	25 %	0 %	50 %	25 %	529067803
111	NC_021920	GGCT	2	8	40703	40710	0 %	25 %	50 %	25 %	529067803
112	NC_021920	CCTC	2	8	42252	42259	0 %	25 %	0 %	75 %	529067805
113	NC_021920	CCTC	2	8	43117	43124	0 %	25 %	0 %	75 %	529067807
114	NC_021920	CCGC	2	8	43630	43637	0 %	0 %	25 %	75 %	529067807

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.