MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium maris DSM 45190 plasmid pCmaris1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021920	GTGC	2	8	2368	2375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021920	TGTA	2	8	4212	4219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021920	CAGC	2	8	4290	4297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021920	TTAG	2	8	4383	4390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021920	TGTA	2	8	4609	4616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021920	TACA	2	8	4626	4633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021920	TCTG	2	8	4774	4781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021920	CCCA	2	8	7269	7276	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_021920	GTTC	2	8	7533	7540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021920	GCAG	2	8	7672	7679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021920	TTCC	2	8	9494	9501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021920	TTTG	2	8	14908	14915	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021920	TGGT	2	8	16573	16580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021920	ACAG	2	8	17266	17273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021920	GTGC	2	8	17328	17335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021920	GCCC	2	8	17500	17507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_021920	GGCC	2	8	18057	18064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021920	GCCC	2	8	18235	18242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_021920	GCAT	2	8	18329	18336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021920	CGCC	2	8	18579	18586	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_021920	CTCG	2	8	18672	18679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021920	GCGG	2	8	18719	18726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021920	CGGG	2	8	19064	19071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021920	GTGC	2	8	19512	19519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021920	GCCG	2	8	19941	19948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021920	GACG	2	8	20328	20335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021920	GGAC	2	8	20530	20537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021920	GACC	2	8	20600	20607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021920	GTGG	2	8	22233	22240	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021920	GTGG	2	8	22997	23004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021920	GCAG	2	8	23087	23094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021920	GGAG	2	8	26044	26051	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021920	CTAT	2	8	26535	26542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021920	TTAC	2	8	26694	26701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021920	TATT	2	8	26883	26890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021920	GTAG	2	8	26970	26977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021920	AGGG	2	8	27488	27495	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021920	TTCG	2	8	34796	34803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021920	AAGT	2	8	34953	34960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021920	GGTT	2	8	35088	35095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021920	CAGG	2	8	35186	35193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021920	CATA	2	8	35313	35320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021920	GGGA	2	8	35542	35549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021920	TGGG	2	8	35685	35692	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021920	GGCA	2	8	36757	36764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021920	TCAG	2	8	38154	38161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.