MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Nasuia deltocephalinicola str. NAS-ALF

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021919	AATATA	2	12	682	693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067325
2	NC_021919	AGTTAT	2	12	1504	1515	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529067326
3	NC_021919	TTTTGG	2	12	2662	2673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529067328
4	NC_021919	ATTTTT	2	12	3069	3080	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067328
5	NC_021919	GATATT	2	12	6488	6499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529067332
6	NC_021919	ATAAAT	2	12	7662	7673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067335
7	NC_021919	AAATAA	2	12	8126	8137	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067336
8	NC_021919	ATAAAT	2	12	9652	9663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067336
9	NC_021919	ATATTA	2	12	10420	10431	50 %	50 %	0 %	0 %	529067336
10	NC_021919	TATCTT	2	12	11296	11307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	529067336
11	NC_021919	AAAAAG	2	12	12237	12248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	529067337
12	NC_021919	AAATTT	2	12	13465	13476	50 %	50 %	0 %	0 %	529067337
13	NC_021919	TTATAA	2	12	13527	13538	50 %	50 %	0 %	0 %	529067337
14	NC_021919	AAAAAG	2	12	16580	16591	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	529067339
15	NC_021919	TTTTAA	2	12	20257	20268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067343
16	NC_021919	TAAAAA	2	12	21842	21853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067347
17	NC_021919	ATAATT	2	12	22134	22145	50 %	50 %	0 %	0 %	529067348
18	NC_021919	TTTAAA	2	12	22263	22274	50 %	50 %	0 %	0 %	529067348
19	NC_021919	TTTAAT	2	12	25056	25067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067355
20	NC_021919	TTATTT	2	12	25301	25312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067355
21	NC_021919	ATTAAA	2	12	26349	26360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067358
22	NC_021919	TATTTT	2	12	26758	26769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067359
23	NC_021919	TCATAT	2	12	27875	27886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	529067363
24	NC_021919	GGTTTT	2	12	28080	28091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529067363
25	NC_021919	TAATTT	2	12	29929	29940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067366
26	NC_021919	TATAAA	2	12	30973	30984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067369
27	NC_021919	TTAATA	2	12	31490	31501	50 %	50 %	0 %	0 %	529067370
28	NC_021919	GATTTA	2	12	31609	31620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529067370
29	NC_021919	GATAAA	2	12	31807	31818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	529067370
30	NC_021919	AAATAT	2	12	31917	31928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067370
31	NC_021919	AAAATT	2	12	32544	32555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067371
32	NC_021919	ATTTAT	2	12	32624	32635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067371
33	NC_021919	ATTTTA	2	12	33865	33876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067374
34	NC_021919	TAAATA	2	12	34030	34041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067374
35	NC_021919	ATTTTA	2	12	34291	34302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067374
36	NC_021919	ATTTAA	2	12	34313	34324	50 %	50 %	0 %	0 %	529067374
37	NC_021919	TTTTGA	2	12	35815	35826	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	529067375
38	NC_021919	TTTAAT	2	12	37529	37540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067377
39	NC_021919	TATAAT	2	12	37679	37690	50 %	50 %	0 %	0 %	529067377
40	NC_021919	TTTTAA	2	12	37963	37974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067377
41	NC_021919	TAAATT	2	12	37983	37994	50 %	50 %	0 %	0 %	529067377
42	NC_021919	ATTTTT	2	12	38943	38954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067378
43	NC_021919	ATTTTT	2	12	38982	38993	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067378
44	NC_021919	TTTATT	2	12	39999	40010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067380
45	NC_021919	ATTTTT	2	12	40146	40157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067380
46	NC_021919	TATTTA	2	12	40268	40279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067380
47	NC_021919	ATTTTT	2	12	40537	40548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067381
48	NC_021919	AATTTT	2	12	41503	41514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067382
49	NC_021919	TTGAAT	2	12	41918	41929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529067382
50	NC_021919	TAAAAA	2	12	41946	41957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067382
51	NC_021919	ATTTTT	2	12	41966	41977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067382
52	NC_021919	ATTTAT	2	12	43285	43296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067383
53	NC_021919	ATTTAA	2	12	43640	43651	50 %	50 %	0 %	0 %	529067384
54	NC_021919	TTTATT	2	12	44496	44507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067386
55	NC_021919	AAAATT	2	12	44618	44629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067386
56	NC_021919	TATTTT	2	12	45655	45666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067388
57	NC_021919	TTAAAT	2	12	45715	45726	50 %	50 %	0 %	0 %	529067388
58	NC_021919	TTTTAA	2	12	45730	45741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067388
59	NC_021919	TAAAAA	2	12	47502	47513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067390
60	NC_021919	TTCTAT	2	12	48262	48273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	529067390
61	NC_021919	ATAATT	2	12	48459	48470	50 %	50 %	0 %	0 %	529067390
62	NC_021919	CAAAAA	2	12	49005	49016	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529067390
63	NC_021919	TTTTAT	2	12	50462	50473	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067395
64	NC_021919	ATTTAA	2	12	51592	51603	50 %	50 %	0 %	0 %	529067395
65	NC_021919	TATTTT	2	12	51735	51746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067395
66	NC_021919	TTTAAT	2	12	52385	52396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067395
67	NC_021919	ATTTTT	2	12	52397	52408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067395
68	NC_021919	ATTTTT	2	12	52747	52758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067395
69	NC_021919	ATTTTT	2	12	52975	52986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067395
70	NC_021919	TAAAAT	2	12	54266	54277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067396
71	NC_021919	AAGCTT	2	12	55219	55230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	529067396
72	NC_021919	TAAATT	2	12	56529	56540	50 %	50 %	0 %	0 %	529067400
73	NC_021919	TAAAAA	2	12	59333	59344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067401
74	NC_021919	AATATT	2	12	60899	60910	50 %	50 %	0 %	0 %	529067403
75	NC_021919	ATTTTT	2	12	61259	61270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067403
76	NC_021919	ATAGTT	2	12	62705	62716	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529067405
77	NC_021919	AATAAA	3	18	62720	62737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067405
78	NC_021919	TTTATA	2	12	63432	63443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067408
79	NC_021919	AATTAA	2	12	63962	63973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067408
80	NC_021919	ATATTT	2	12	64644	64655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067410
81	NC_021919	AAAATT	2	12	65040	65051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067410
82	NC_021919	AATTTA	2	12	67511	67522	50 %	50 %	0 %	0 %	529067413
83	NC_021919	AATTAA	2	12	67823	67834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067414
84	NC_021919	AAGGAT	2	12	69112	69123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	529067415
85	NC_021919	TTCATT	2	12	69424	69435	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	529067415
86	NC_021919	TAAAAA	2	12	69793	69804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067416
87	NC_021919	TTGATT	2	12	70072	70083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	529067416
88	NC_021919	TCTTTT	2	12	70986	70997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	529067417
89	NC_021919	ATTTTT	2	12	71014	71025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067417
90	NC_021919	TATAGA	2	12	71607	71618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	529067417
91	NC_021919	AAATTA	2	12	72715	72726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067419
92	NC_021919	TTAAAA	2	12	74828	74839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067421
93	NC_021919	TTAAAT	2	12	75064	75075	50 %	50 %	0 %	0 %	529067421
94	NC_021919	TAAAAA	2	12	75641	75652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067421
95	NC_021919	AAATAA	2	12	76918	76929	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067423
96	NC_021919	AAAATT	2	12	77223	77234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067423
97	NC_021919	TAAATA	2	12	77332	77343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067423
98	NC_021919	AAATTA	2	12	77619	77630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067424
99	NC_021919	ATTTTT	2	12	77764	77775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067424
100	NC_021919	AAAATT	2	12	78277	78288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067425
101	NC_021919	TTTAAT	2	12	78804	78815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067425
102	NC_021919	TAAAAA	2	12	79363	79374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067426
103	NC_021919	TAAAAA	2	12	79849	79860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067427
104	NC_021919	AGAAAA	2	12	80422	80433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	529067427
105	NC_021919	AAAATA	2	12	82528	82539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067430
106	NC_021919	ATTAAA	2	12	82730	82741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067431
107	NC_021919	TTTAAA	2	12	83391	83402	50 %	50 %	0 %	0 %	529067431
108	NC_021919	TATTTA	2	12	85135	85146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067432
109	NC_021919	TATAAA	2	12	86599	86610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067434
110	NC_021919	TAATAT	2	12	87044	87055	50 %	50 %	0 %	0 %	529067435
111	NC_021919	ATAAAA	2	12	87098	87109	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067435
112	NC_021919	GATTTG	2	12	87946	87957	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	529067436
113	NC_021919	TTAAAT	2	12	88047	88058	50 %	50 %	0 %	0 %	529067436
114	NC_021919	AAGTTA	2	12	88171	88182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	529067436
115	NC_021919	ATTTAA	2	12	94832	94843	50 %	50 %	0 %	0 %	529067440
116	NC_021919	TTATTT	2	12	95927	95938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067441
117	NC_021919	ATTTTT	2	12	96232	96243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067441
118	NC_021919	TAAAAT	2	12	97373	97384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067442
119	NC_021919	AAATAA	2	12	99169	99180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067444
120	NC_021919	TAAAAA	2	12	99571	99582	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	529067444
121	NC_021919	TTTATA	2	12	101930	101941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529067449
122	NC_021919	TTAAAA	2	12	102262	102273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067450
123	NC_021919	TTAAAT	2	12	102329	102340	50 %	50 %	0 %	0 %	529067450
124	NC_021919	ATTCAA	2	12	103062	103073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	529067451
125	NC_021919	TATAAA	2	12	103475	103486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529067452
126	NC_021919	AAAACA	2	12	104933	104944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	529067453
127	NC_021919	TTATTT	2	12	105644	105655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	529067454
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.