MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cycloclasticus zancles 7-ME plasmid p7ME01

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021918	CGGCA	2	10	990	999	20 %	0 %	40 %	40 %	529066482
2	NC_021918	TCCTT	2	10	1271	1280	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021918	TGTGC	2	10	3996	4005	0 %	40 %	40 %	20 %	529066485
4	NC_021918	CTGGC	2	10	5122	5131	0 %	20 %	40 %	40 %	529066486
5	NC_021918	TGCGG	2	10	6108	6117	0 %	20 %	60 %	20 %	529066489
6	NC_021918	CCGTT	2	10	7506	7515	0 %	40 %	20 %	40 %	529066489
7	NC_021918	AATGG	2	10	7775	7784	40 %	20 %	40 %	0 %	529066489
8	NC_021918	GAAAT	2	10	7834	7843	60 %	20 %	20 %	0 %	529066489
9	NC_021918	TGGAC	2	10	9216	9225	20 %	20 %	40 %	20 %	529066490
10	NC_021918	TGTGC	2	10	9667	9676	0 %	40 %	40 %	20 %	529066491
11	NC_021918	CACCG	2	10	9886	9895	20 %	0 %	20 %	60 %	529066491
12	NC_021918	AAAGA	2	10	12290	12299	80 %	0 %	20 %	0 %	529066494
13	NC_021918	GCGCA	2	10	12531	12540	20 %	0 %	40 %	40 %	529066494
14	NC_021918	GGCGC	2	10	14183	14192	0 %	0 %	60 %	40 %	529066496
15	NC_021918	AGGGC	2	10	14596	14605	20 %	0 %	60 %	20 %	529066496
16	NC_021918	TGAAA	2	10	15170	15179	60 %	20 %	20 %	0 %	529066497
17	NC_021918	TGCGG	2	10	15300	15309	0 %	20 %	60 %	20 %	529066497
18	NC_021918	GGGCA	2	10	16289	16298	20 %	0 %	60 %	20 %	529066498
19	NC_021918	CCAAC	2	10	17595	17604	40 %	0 %	0 %	60 %	529066501
20	NC_021918	CTGGT	2	10	19626	19635	0 %	40 %	40 %	20 %	529066506
21	NC_021918	TCATG	2	10	21523	21532	20 %	40 %	20 %	20 %	529066510
22	NC_021918	TCCGA	2	10	24042	24051	20 %	20 %	20 %	40 %	529066511
23	NC_021918	TTGTT	2	10	24432	24441	0 %	80 %	20 %	0 %	529066511
24	NC_021918	GGTGC	2	10	24654	24663	0 %	20 %	60 %	20 %	529066511
25	NC_021918	TTCGG	2	10	27961	27970	0 %	40 %	40 %	20 %	529066515
26	NC_021918	GCGAA	2	10	29900	29909	40 %	0 %	40 %	20 %	529066516
27	NC_021918	TTCGT	2	10	30223	30232	0 %	60 %	20 %	20 %	529066516
28	NC_021918	GCTTT	2	10	30990	30999	0 %	60 %	20 %	20 %	529066516
29	NC_021918	ACCAA	2	10	31676	31685	60 %	0 %	0 %	40 %	529066516
30	NC_021918	TTTGC	2	10	31696	31705	0 %	60 %	20 %	20 %	529066516
31	NC_021918	TAAAG	2	10	32438	32447	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021918	GAAAA	2	10	32901	32910	80 %	0 %	20 %	0 %	529066518
33	NC_021918	AGGGT	2	10	37001	37010	20 %	20 %	60 %	0 %	529066523
34	NC_021918	CGTTG	2	10	38054	38063	0 %	40 %	40 %	20 %	529066525
35	NC_021918	TTGAA	2	10	38759	38768	40 %	40 %	20 %	0 %	529066526
36	NC_021918	CAGCG	2	10	38813	38822	20 %	0 %	40 %	40 %	529066526
37	NC_021918	GGTCA	2	10	39595	39604	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021918	TCCAG	2	10	40567	40576	20 %	20 %	20 %	40 %	529066530
39	NC_021918	CTCGT	2	10	41780	41789	0 %	40 %	20 %	40 %	529066531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.