MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cycloclasticus zancles 7-ME plasmid p7ME01

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021918	TCGG	2	8	179	186	0 %	25 %	50 %	25 %	529066481
2	NC_021918	TGGG	2	8	458	465	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021918	CGCC	2	8	784	791	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_021918	GGGA	2	8	1491	1498	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021918	AAAG	2	8	1625	1632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021918	GGCT	2	8	1862	1869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021918	TCAA	2	8	1960	1967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021918	CAAC	2	8	1982	1989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021918	GTTT	2	8	2747	2754	0 %	75 %	25 %	0 %	529066483
10	NC_021918	CAAA	2	8	2828	2835	75 %	0 %	0 %	25 %	529066483
11	NC_021918	AGTT	2	8	3011	3018	25 %	50 %	25 %	0 %	529066483
12	NC_021918	GGGC	2	8	3088	3095	0 %	0 %	75 %	25 %	529066483
13	NC_021918	ATCA	2	8	3174	3181	50 %	25 %	0 %	25 %	529066483
14	NC_021918	TTGT	2	8	3198	3205	0 %	75 %	25 %	0 %	529066483
15	NC_021918	AATC	2	8	3309	3316	50 %	25 %	0 %	25 %	529066484
16	NC_021918	CTTG	2	8	3480	3487	0 %	50 %	25 %	25 %	529066484
17	NC_021918	GAAC	2	8	3776	3783	50 %	0 %	25 %	25 %	529066485
18	NC_021918	ACTC	2	8	5341	5348	25 %	25 %	0 %	50 %	529066487
19	NC_021918	TATG	2	8	6509	6516	25 %	50 %	25 %	0 %	529066489
20	NC_021918	GCCC	2	8	8653	8660	0 %	0 %	25 %	75 %	529066490
21	NC_021918	CAAC	2	8	9263	9270	50 %	0 %	0 %	50 %	529066490
22	NC_021918	CGTG	2	8	9361	9368	0 %	25 %	50 %	25 %	529066490
23	NC_021918	CCGC	2	8	9740	9747	0 %	0 %	25 %	75 %	529066491
24	NC_021918	AGCC	2	8	9758	9765	25 %	0 %	25 %	50 %	529066491
25	NC_021918	ACCG	2	8	9850	9857	25 %	0 %	25 %	50 %	529066491
26	NC_021918	ACGC	2	8	10374	10381	25 %	0 %	25 %	50 %	529066492
27	NC_021918	CCCG	2	8	10771	10778	0 %	0 %	25 %	75 %	529066492
28	NC_021918	TTTG	2	8	10937	10944	0 %	75 %	25 %	0 %	529066493
29	NC_021918	AGGC	2	8	11035	11042	25 %	0 %	50 %	25 %	529066493
30	NC_021918	CAGA	2	8	11079	11086	50 %	0 %	25 %	25 %	529066493
31	NC_021918	GAAC	2	8	11129	11136	50 %	0 %	25 %	25 %	529066493
32	NC_021918	CCAA	2	8	12868	12875	50 %	0 %	0 %	50 %	529066494
33	NC_021918	AGCC	2	8	13262	13269	25 %	0 %	25 %	50 %	529066495
34	NC_021918	GCCA	2	8	13306	13313	25 %	0 %	25 %	50 %	529066496
35	NC_021918	CTGG	2	8	13342	13349	0 %	25 %	50 %	25 %	529066496
36	NC_021918	ATTC	2	8	13773	13780	25 %	50 %	0 %	25 %	529066496
37	NC_021918	GAAA	2	8	14053	14060	75 %	0 %	25 %	0 %	529066496
38	NC_021918	GGCA	2	8	14200	14207	25 %	0 %	50 %	25 %	529066496
39	NC_021918	GGCT	2	8	14455	14462	0 %	25 %	50 %	25 %	529066496
40	NC_021918	CAGC	2	8	14550	14557	25 %	0 %	25 %	50 %	529066496
41	NC_021918	CTGC	2	8	15272	15279	0 %	25 %	25 %	50 %	529066497
42	NC_021918	CATT	2	8	15674	15681	25 %	50 %	0 %	25 %	529066498
43	NC_021918	AGAC	2	8	16201	16208	50 %	0 %	25 %	25 %	529066498
44	NC_021918	TTTG	2	8	16451	16458	0 %	75 %	25 %	0 %	529066499
45	NC_021918	CATT	2	8	16594	16601	25 %	50 %	0 %	25 %	529066499
46	NC_021918	GGCT	2	8	17285	17292	0 %	25 %	50 %	25 %	529066500
47	NC_021918	GGAT	2	8	17554	17561	25 %	25 %	50 %	0 %	529066501
48	NC_021918	AAAG	2	8	18009	18016	75 %	0 %	25 %	0 %	529066502
49	NC_021918	ATGA	2	8	18038	18045	50 %	25 %	25 %	0 %	529066503
50	NC_021918	CAAT	2	8	18078	18085	50 %	25 %	0 %	25 %	529066503
51	NC_021918	TTTA	2	8	18148	18155	25 %	75 %	0 %	0 %	529066503
52	NC_021918	TCTT	2	8	18443	18450	0 %	75 %	0 %	25 %	529066503
53	NC_021918	GTAA	2	8	18809	18816	50 %	25 %	25 %	0 %	529066504
54	NC_021918	AAAG	2	8	19847	19854	75 %	0 %	25 %	0 %	529066506
55	NC_021918	GTTC	2	8	21983	21990	0 %	50 %	25 %	25 %	529066511
56	NC_021918	CCTT	2	8	22224	22231	0 %	50 %	0 %	50 %	529066511
57	NC_021918	TGCT	2	8	22425	22432	0 %	50 %	25 %	25 %	529066511
58	NC_021918	GCTC	2	8	22635	22642	0 %	25 %	25 %	50 %	529066511
59	NC_021918	TTCA	2	8	23324	23331	25 %	50 %	0 %	25 %	529066511
60	NC_021918	CGTT	2	8	23670	23677	0 %	50 %	25 %	25 %	529066511
61	NC_021918	TTTC	2	8	24376	24383	0 %	75 %	0 %	25 %	529066511
62	NC_021918	TCCA	2	8	24398	24405	25 %	25 %	0 %	50 %	529066511
63	NC_021918	GCTT	2	8	24513	24520	0 %	50 %	25 %	25 %	529066511
64	NC_021918	CTTT	2	8	25092	25099	0 %	75 %	0 %	25 %	529066513
65	NC_021918	CTTG	2	8	25239	25246	0 %	50 %	25 %	25 %	529066513
66	NC_021918	ATCA	2	8	25348	25355	50 %	25 %	0 %	25 %	529066513
67	NC_021918	TTGC	2	8	25384	25391	0 %	50 %	25 %	25 %	529066513
68	NC_021918	TGAC	2	8	25636	25643	25 %	25 %	25 %	25 %	529066513
69	NC_021918	GCCA	2	8	25698	25705	25 %	0 %	25 %	50 %	529066513
70	NC_021918	GTGA	2	8	26234	26241	25 %	25 %	50 %	0 %	529066513
71	NC_021918	AATA	2	8	27028	27035	75 %	25 %	0 %	0 %	529066513
72	NC_021918	TCCC	2	8	27049	27056	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_021918	GACT	2	8	27101	27108	25 %	25 %	25 %	25 %	529066514
74	NC_021918	GGTC	2	8	28440	28447	0 %	25 %	50 %	25 %	529066515
75	NC_021918	TCCA	2	8	28518	28525	25 %	25 %	0 %	50 %	529066515
76	NC_021918	CAGG	2	8	28573	28580	25 %	0 %	50 %	25 %	529066515
77	NC_021918	CCAA	2	8	28632	28639	50 %	0 %	0 %	50 %	529066515
78	NC_021918	TCTT	2	8	29118	29125	0 %	75 %	0 %	25 %	529066515
79	NC_021918	TCCT	2	8	29502	29509	0 %	50 %	0 %	50 %	529066516
80	NC_021918	CTGA	2	8	30056	30063	25 %	25 %	25 %	25 %	529066516
81	NC_021918	GCTG	2	8	30078	30085	0 %	25 %	50 %	25 %	529066516
82	NC_021918	AGCG	2	8	31751	31758	25 %	0 %	50 %	25 %	529066516
83	NC_021918	CCCA	2	8	31961	31968	25 %	0 %	0 %	75 %	529066517
84	NC_021918	TGTC	2	8	32179	32186	0 %	50 %	25 %	25 %	529066517
85	NC_021918	ATTG	2	8	32202	32209	25 %	50 %	25 %	0 %	529066517
86	NC_021918	GTGA	2	8	32285	32292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021918	TCGT	2	8	33244	33251	0 %	50 %	25 %	25 %	529066519
88	NC_021918	GCCA	2	8	33385	33392	25 %	0 %	25 %	50 %	529066519
89	NC_021918	ACAA	2	8	33487	33494	75 %	0 %	0 %	25 %	529066519
90	NC_021918	CAGC	2	8	34315	34322	25 %	0 %	25 %	50 %	529066521
91	NC_021918	CCTT	2	8	34389	34396	0 %	50 %	0 %	50 %	529066521
92	NC_021918	ACAT	2	8	34605	34612	50 %	25 %	0 %	25 %	529066521
93	NC_021918	TTCT	2	8	34807	34814	0 %	75 %	0 %	25 %	529066521
94	NC_021918	ACCT	2	8	35171	35178	25 %	25 %	0 %	50 %	529066521
95	NC_021918	GGTC	2	8	35827	35834	0 %	25 %	50 %	25 %	529066522
96	NC_021918	CTGG	2	8	35978	35985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021918	GCTT	2	8	36365	36372	0 %	50 %	25 %	25 %	529066523
98	NC_021918	GCTC	2	8	36608	36615	0 %	25 %	25 %	50 %	529066523
99	NC_021918	CAAG	2	8	37130	37137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021918	GGGT	2	8	37182	37189	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021918	CTTT	2	8	37423	37430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021918	GCCA	2	8	37810	37817	25 %	0 %	25 %	50 %	529066525
103	NC_021918	CGTC	2	8	38664	38671	0 %	25 %	25 %	50 %	529066526
104	NC_021918	TTGC	2	8	39033	39040	0 %	50 %	25 %	25 %	529066526
105	NC_021918	CTCG	2	8	39288	39295	0 %	25 %	25 %	50 %	529066527
106	NC_021918	CCAG	2	8	39698	39705	25 %	0 %	25 %	50 %	529066528
107	NC_021918	GAAA	2	8	39751	39758	75 %	0 %	25 %	0 %	529066528
108	NC_021918	TCCT	2	8	40095	40102	0 %	50 %	0 %	50 %	529066529
109	NC_021918	AGCC	2	8	40106	40113	25 %	0 %	25 %	50 %	529066529
110	NC_021918	GCCC	2	8	40209	40216	0 %	0 %	25 %	75 %	529066529
111	NC_021918	CTCA	2	8	40732	40739	25 %	25 %	0 %	50 %	529066530
112	NC_021918	TTGT	2	8	40740	40747	0 %	75 %	25 %	0 %	529066530

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.