MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cycloclasticus zancles 7-ME

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021917	TAAAAA	2	12	6261	6272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021917	AGCATT	2	12	116102	116113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021917	ATTTTA	2	12	116325	116336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021917	AAGGCT	2	12	126813	126824	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021917	TAAAAA	2	12	218172	218183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021917	CAAGCT	2	12	218242	218253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021917	TTTATT	2	12	218366	218377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021917	ATATGA	2	12	308908	308919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021917	TAAAAT	2	12	322050	322061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021917	CCTTCG	2	12	407577	407588	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021917	TTAAAG	2	12	472985	472996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021917	AAAGTT	2	12	485083	485094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021917	GGTGTA	2	12	501250	501261	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021917	ACGCTG	2	12	508766	508777	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021917	CGCCTT	2	12	592948	592959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021917	GGTGAA	2	12	609643	609654	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021917	TAAAAC	2	12	948990	949001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021917	AAGGCA	2	12	949935	949946	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021917	TAATTT	2	12	962399	962410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021917	TTATGA	2	12	991078	991089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021917	AATCTA	2	12	1002977	1002988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021917	TTTTAT	2	12	1065249	1065260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021917	TTCAAA	2	12	1159694	1159705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021917	TTAATT	2	12	1270290	1270301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021917	ATTTTA	2	12	1278106	1278117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021917	CTTAAT	2	12	1281185	1281196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021917	TGTAAA	2	12	1291062	1291073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021917	AATGAT	2	12	1292802	1292813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021917	AACCAA	2	12	1315802	1315813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021917	CATGAT	4	24	1315815	1315838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021917	CATCTG	2	12	1319623	1319634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021917	AAATAA	2	12	1373197	1373208	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021917	AGCGTG	2	12	1431241	1431252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021917	TAGAGA	2	12	1541500	1541511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021917	AAACCA	2	12	1561378	1561389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021917	AATTCT	2	12	1602851	1602862	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021917	GTATCC	2	12	1638334	1638345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021917	ACACAA	2	12	1638470	1638481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021917	AACATA	2	12	1651654	1651665	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021917	TTAGTA	2	12	1678339	1678350	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021917	ATCATT	2	12	1682930	1682941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021917	CTTATT	2	12	1751959	1751970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021917	TAGTCA	2	12	1765040	1765051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021917	ATAACG	2	12	1789108	1789119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021917	TACTCT	2	12	1833402	1833413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021917	TTTAAA	2	12	1844927	1844938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021917	CAAATT	2	12	1906206	1906217	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021917	AAGCTT	2	12	1952530	1952541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021917	CATAAC	2	12	1986680	1986691	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021917	ACCACT	2	12	2007328	2007339	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021917	TAAAAT	2	12	2033521	2033532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021917	AATGCT	2	12	2095708	2095719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021917	TTTTAT	2	12	2146078	2146089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021917	CTATAG	2	12	2146194	2146205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021917	TAATTC	2	12	2156928	2156939	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021917	ATTTAC	2	12	2157159	2157170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021917	TAATAT	2	12	2205387	2205398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021917	GCTGCC	2	12	2249136	2249147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021917	ATTTCA	2	12	2446330	2446341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021917	GAGCTT	2	12	2538470	2538481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021917	TTTTTA	2	12	2538541	2538552	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021917	TTTTAT	2	12	2559416	2559427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021917	ATTAAA	2	12	2588131	2588142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.