MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cycloclasticus zancles 7-ME

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021917	AAATT	2	10	6187	6196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021917	TTTTA	2	10	6578	6587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021917	TAAAA	2	10	27985	27994	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021917	ATCAC	2	10	51913	51922	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021917	AGTAG	2	10	52160	52169	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021917	AGCAA	2	10	59733	59742	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021917	CATAA	2	10	99018	99027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021917	AAATT	2	10	110374	110383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021917	GTTAA	2	10	129887	129896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021917	AGTTT	2	10	133102	133111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021917	ACCAA	2	10	136921	136930	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_021917	TTTGC	2	10	138146	138155	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021917	AGCAA	2	10	140207	140216	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021917	GGAGC	2	10	143546	143555	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021917	CGAAG	2	10	145779	145788	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021917	CTACT	2	10	194468	194477	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021917	GTGAT	2	10	194715	194724	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021917	TAAAT	2	10	201511	201520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021917	ACTAT	2	10	209924	209933	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021917	AGTGA	2	10	217743	217752	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021917	TTGCC	2	10	218029	218038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021917	CTTTT	2	10	218324	218333	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021917	GATTA	2	10	221870	221879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021917	GATAT	2	10	253525	253534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021917	GCTAA	2	10	260781	260790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021917	AAAGG	2	10	297272	297281	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021917	TAGTA	2	10	306744	306753	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021917	AAATG	2	10	352849	352858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021917	ATTAA	2	10	383251	383260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021917	ACTTA	2	10	385649	385658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021917	TTAAC	2	10	385736	385745	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021917	AAAAT	2	10	404128	404137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021917	TCCTT	2	10	411815	411824	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021917	AAAGA	2	10	413281	413290	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021917	AAATG	2	10	442908	442917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021917	GCTGT	2	10	443565	443574	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021917	ATTTT	2	10	452487	452496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021917	GCTAG	2	10	457259	457268	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021917	TGCAA	2	10	471012	471021	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021917	CTAGC	2	10	484990	484999	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_021917	TTTGT	2	10	500758	500767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021917	TTTTA	2	10	500834	500843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021917	CTAAA	2	10	543058	543067	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_021917	AAAAT	2	10	544307	544316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021917	TTTCA	2	10	554865	554874	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021917	GATTT	2	10	569852	569861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021917	GGGCT	2	10	576906	576915	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021917	TGAGT	2	10	590348	590357	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021917	AGGTT	2	10	590530	590539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021917	GAACT	2	10	597426	597435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021917	GTTGA	2	10	598689	598698	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021917	TTTTG	2	10	605346	605355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021917	GATAT	2	10	670542	670551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021917	AAAAG	2	10	681011	681020	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021917	ATTTT	2	10	684545	684554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021917	TTTAA	2	10	724062	724071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021917	ATTTT	2	10	727647	727656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021917	AATAT	2	10	770783	770792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021917	GCTCT	2	10	770814	770823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021917	AAAAT	2	10	770936	770945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021917	AACAA	2	10	789113	789122	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021917	TAAGG	2	10	808899	808908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021917	GTTAA	2	10	808916	808925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021917	TCCAT	2	10	851476	851485	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021917	ATTGC	2	10	853967	853976	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021917	ATTTT	2	10	853984	853993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021917	TAATA	2	10	871328	871337	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021917	CTGAT	2	10	927387	927396	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021917	AAGCC	2	10	935645	935654	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_021917	TGCAA	2	10	945235	945244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021917	TTAAA	2	10	962118	962127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021917	TTGAT	2	10	972424	972433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021917	AAATT	2	10	1003985	1003994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021917	AGAAT	2	10	1004019	1004028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021917	AAATT	2	10	1004029	1004038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021917	TAAAT	2	10	1034003	1034012	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021917	GAGAA	2	10	1056616	1056625	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021917	AATAT	2	10	1103827	1103836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021917	AAATT	2	10	1103846	1103855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021917	GTTAA	2	10	1113150	1113159	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021917	AGGGT	2	10	1122597	1122606	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021917	TTTTA	2	10	1133268	1133277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021917	TGCAA	2	10	1138553	1138562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021917	TACGC	2	10	1140002	1140011	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021917	AGCAA	2	10	1145875	1145884	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021917	AAAAT	2	10	1146130	1146139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021917	TAAAA	2	10	1147644	1147653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021917	TTTAA	2	10	1159718	1159727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021917	AATCT	2	10	1200466	1200475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021917	TTTAA	2	10	1205771	1205780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021917	TTAAG	2	10	1218518	1218527	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021917	GAAAA	2	10	1220783	1220792	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021917	TTATT	2	10	1241119	1241128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021917	TTATT	2	10	1254947	1254956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021917	TTAAT	2	10	1265844	1265853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021917	TGCAC	2	10	1265907	1265916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_021917	ATTTA	2	10	1275819	1275828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021917	AGTCT	2	10	1280561	1280570	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021917	AAAGA	2	10	1281035	1281044	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021917	CTTAT	2	10	1290058	1290067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021917	ATACT	2	10	1341733	1341742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021917	GTATA	2	10	1341746	1341755	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021917	TATTC	2	10	1343278	1343287	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021917	ATTTT	2	10	1352867	1352876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021917	TGGTT	2	10	1359974	1359983	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021917	GTGTA	2	10	1369616	1369625	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021917	ATGTT	2	10	1373402	1373411	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021917	ATTTA	2	10	1396184	1396193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021917	AATTT	2	10	1404465	1404474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021917	TGAAT	2	10	1427081	1427090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021917	ATATT	2	10	1438440	1438449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021917	ACATC	2	10	1442721	1442730	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_021917	AGTCA	2	10	1457174	1457183	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021917	TAGAA	2	10	1466396	1466405	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021917	TGTTT	2	10	1492445	1492454	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021917	AATAA	2	10	1496262	1496271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021917	TATCA	2	10	1497016	1497025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021917	TATTT	2	10	1548618	1548627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021917	ACATT	2	10	1561584	1561593	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021917	ATGTT	2	10	1581851	1581860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021917	AATTC	2	10	1605506	1605515	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021917	AACGT	2	10	1608923	1608932	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021917	TAAAA	2	10	1609156	1609165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021917	TAATT	2	10	1610619	1610628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021917	GCCTT	2	10	1610706	1610715	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021917	ATTTA	2	10	1610801	1610810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021917	TTTTA	2	10	1620816	1620825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021917	TAACA	2	10	1633718	1633727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021917	CTTGC	2	10	1633832	1633841	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_021917	TTAAT	2	10	1644291	1644300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021917	TAAAT	2	10	1647390	1647399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021917	TAAAT	2	10	1651060	1651069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021917	ATAAA	2	10	1660508	1660517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021917	ATTTA	2	10	1667140	1667149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021917	GTCCA	2	10	1679818	1679827	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_021917	TTTCA	2	10	1709386	1709395	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021917	TAATG	2	10	1718313	1718322	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021917	AAGGA	2	10	1723206	1723215	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021917	CATAT	2	10	1738182	1738191	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021917	TTGTT	2	10	1752111	1752120	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021917	TTAAA	2	10	1761635	1761644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021917	ATTAA	2	10	1801345	1801354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021917	ACACA	2	10	1819188	1819197	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_021917	CTCAT	2	10	1846992	1847001	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_021917	ATTTT	2	10	1851140	1851149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_021917	ATTTG	2	10	2576251	2576260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.