MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium maris DSM 45190

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021915	CCCTGC	2	12	39698	39709	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021915	GCGACG	2	12	136464	136475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021915	GCCCAC	2	12	139295	139306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021915	TCCGGG	2	12	140061	140072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021915	CGGGGA	2	12	176099	176110	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021915	TTGTCA	2	12	188526	188537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021915	CTGCAG	2	12	214616	214627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021915	GGCCCT	2	12	231093	231104	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021915	AGGGGC	2	12	239958	239969	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021915	CTCCGC	2	12	247666	247677	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021915	CCGCCA	2	12	264808	264819	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021915	CCGGGG	2	12	271984	271995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021915	CGGGGT	2	12	279777	279788	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021915	CGCGGG	2	12	298271	298282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021915	TGTCAC	2	12	318998	319009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021915	GGTCGG	2	12	323786	323797	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021915	TCATCC	2	12	411578	411589	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021915	CCGGAA	2	12	424154	424165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021915	CTGCAG	2	12	435057	435068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021915	CTGCAG	2	12	481244	481255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021915	CACAAC	2	12	495151	495162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021915	CGACGG	2	12	552421	552432	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021915	GACGGG	2	12	565413	565424	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021915	CCCGTT	2	12	581964	581975	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021915	CCTGTT	2	12	581980	581991	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021915	GTACCC	2	12	586582	586593	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021915	CAGTGG	2	12	666114	666125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021915	ACCTTG	2	12	689810	689821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021915	AGGGCA	2	12	695824	695835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021915	GCCGAT	2	12	698698	698709	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021915	CCACGG	2	12	698829	698840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021915	GGGGCG	2	12	739542	739553	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021915	CACTGA	2	12	788457	788468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021915	AGCGAA	2	12	790373	790384	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021915	GGTTAG	2	12	839773	839784	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021915	GGCCGG	2	12	850721	850732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021915	CGAAGG	2	12	923233	923244	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021915	CGGCCG	2	12	947980	947991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021915	GGTAGG	2	12	949598	949609	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021915	GGTGCC	2	12	949730	949741	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021915	CCCACC	2	12	1012157	1012168	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_021915	AACGCC	2	12	1012214	1012225	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021915	CTGCAG	2	12	1068461	1068472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021915	TCCGGC	2	12	1091726	1091737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021915	CCCTCG	2	12	1123122	1123133	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021915	CCTCAC	2	12	1194750	1194761	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021915	CCGCGG	2	12	1196639	1196650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021915	GGCCGG	2	12	1201214	1201225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021915	CGGCCC	2	12	1382413	1382424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021915	GGCTGG	2	12	1385380	1385391	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021915	CACTGA	2	12	1388527	1388538	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021915	AGCGAA	2	12	1390443	1390454	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021915	GACGGC	2	12	1464344	1464355	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021915	TTTCCT	2	12	1530507	1530518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021915	ATAACG	2	12	1586730	1586741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021915	CCCCGC	2	12	1593836	1593847	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_021915	GTGCTT	2	12	1617665	1617676	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021915	ACTCTC	2	12	1645116	1645127	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021915	GGGGCC	2	12	1692774	1692785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021915	GTTCAG	2	12	1736198	1736209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021915	CACGGT	2	12	1736270	1736281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021915	AGGTTT	2	12	1760168	1760179	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021915	GTGTCG	2	12	1765373	1765384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021915	TCATTC	2	12	1794082	1794093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021915	TCCCTC	2	12	1804842	1804853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021915	GCGGTG	2	12	1807172	1807183	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021915	GGTGAC	2	12	1860218	1860229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021915	GGTTAC	2	12	1863002	1863013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021915	CCCCCG	2	12	1919368	1919379	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_021915	GCCCGG	2	12	1931308	1931319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021915	CGGGCG	2	12	1939762	1939773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021915	CGCCCC	2	12	1942269	1942280	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
73	NC_021915	CACCGC	2	12	1989531	1989542	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021915	AGCCCC	2	12	2021054	2021065	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021915	CGCACG	2	12	2021686	2021697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021915	CCCCCG	2	12	2045533	2045544	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
77	NC_021915	CCCACC	2	12	2054783	2054794	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
78	NC_021915	CGGTCA	2	12	2073753	2073764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021915	CACGAA	2	12	2079552	2079563	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021915	CCCGAC	2	12	2118503	2118514	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_021915	GACGAG	2	12	2126211	2126222	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021915	TCGGCG	2	12	2144368	2144379	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021915	TTTCAC	2	12	2155538	2155549	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021915	CTGCTC	2	12	2175632	2175643	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021915	GGGGCG	2	12	2175654	2175665	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021915	ACACAT	2	12	2237116	2237127	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021915	GGACAG	2	12	2240847	2240858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021915	GGGGCG	2	12	2257555	2257566	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021915	GAGGCA	2	12	2290557	2290568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021915	TTCGCT	2	12	2351248	2351259	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021915	CCCCAC	2	12	2360941	2360952	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_021915	CGGCGC	2	12	2445543	2445554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021915	GGGTTC	2	12	2469832	2469843	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021915	GAGAAA	2	12	2469997	2470008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021915	AACCTC	2	12	2488568	2488579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021915	GCCGGA	2	12	2539860	2539871	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021915	CCAGAA	2	12	2564373	2564384	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021915	ACCCCC	2	12	2564443	2564454	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
99	NC_021915	CCCCGA	2	12	2618251	2618262	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021915	CATGAG	2	12	2660126	2660137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021915	TTCGCT	2	12	2680988	2680999	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021915	CCCCGA	2	12	2716634	2716645	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021915	GGCGGG	2	12	2730802	2730813	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021915	CGTGGC	2	12	2731063	2731074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021915	ACGCGG	2	12	2731685	2731696	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021915	CGGGTT	2	12	2731791	2731802	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021915	GGGTCG	2	12	2745736	2745747	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021915	AGGATG	2	12	2752488	2752499	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021915	CGGGGC	2	12	2770614	2770625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.