MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021913	ACGA	2	8	979	986	50 %	0 %	25 %	25 %	529043438
2	NC_021913	CGAG	2	8	1117	1124	25 %	0 %	50 %	25 %	529043438
3	NC_021913	CGAA	2	8	1161	1168	50 %	0 %	25 %	25 %	529043438
4	NC_021913	CGGT	2	8	1661	1668	0 %	25 %	50 %	25 %	529043440
5	NC_021913	AGTC	2	8	2387	2394	25 %	25 %	25 %	25 %	529043440
6	NC_021913	GCTG	2	8	2765	2772	0 %	25 %	50 %	25 %	529043440
7	NC_021913	CTCG	2	8	3053	3060	0 %	25 %	25 %	50 %	529043441
8	NC_021913	GCCG	2	8	5616	5623	0 %	0 %	50 %	50 %	529043442
9	NC_021913	TCGA	2	8	7235	7242	25 %	25 %	25 %	25 %	529043444
10	NC_021913	GAGT	2	8	7401	7408	25 %	25 %	50 %	0 %	529043444
11	NC_021913	GCTG	2	8	7519	7526	0 %	25 %	50 %	25 %	529043444
12	NC_021913	TGGC	2	8	7791	7798	0 %	25 %	50 %	25 %	529043444
13	NC_021913	TGGT	2	8	8469	8476	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
14	NC_021913	ATTG	2	8	8855	8862	25 %	50 %	25 %	0 %	529043444
15	NC_021913	CGGT	2	8	8871	8878	0 %	25 %	50 %	25 %	529043444
16	NC_021913	AGGT	2	8	8929	8936	25 %	25 %	50 %	0 %	529043444
17	NC_021913	CGCT	2	8	9726	9733	0 %	25 %	25 %	50 %	529043444
18	NC_021913	TTGG	2	8	10334	10341	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
19	NC_021913	GATT	2	8	10734	10741	25 %	50 %	25 %	0 %	529043445
20	NC_021913	CTTC	2	8	10983	10990	0 %	50 %	0 %	50 %	529043445
21	NC_021913	TGGT	2	8	11026	11033	0 %	50 %	50 %	0 %	529043445
22	NC_021913	TAGT	2	8	11360	11367	25 %	50 %	25 %	0 %	529043445
23	NC_021913	GTTC	2	8	11413	11420	0 %	50 %	25 %	25 %	529043445
24	NC_021913	AGGA	2	8	11927	11934	50 %	0 %	50 %	0 %	529043445
25	NC_021913	CGAA	3	12	13323	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	529043446
26	NC_021913	TGAG	2	8	14999	15006	25 %	25 %	50 %	0 %	529043446
27	NC_021913	TCGA	2	8	15106	15113	25 %	25 %	25 %	25 %	529043446
28	NC_021913	CAGA	2	8	15216	15223	50 %	0 %	25 %	25 %	529043446
29	NC_021913	TCGT	2	8	15581	15588	0 %	50 %	25 %	25 %	529043446
30	NC_021913	CGGC	2	8	15993	16000	0 %	0 %	50 %	50 %	529043446
31	NC_021913	CGAA	2	8	16142	16149	50 %	0 %	25 %	25 %	529043446
32	NC_021913	TCAC	2	8	16431	16438	25 %	25 %	0 %	50 %	529043447
33	NC_021913	CAGC	2	8	16756	16763	25 %	0 %	25 %	50 %	529043447
34	NC_021913	CGAT	2	8	17986	17993	25 %	25 %	25 %	25 %	529043447
35	NC_021913	ACAT	2	8	18386	18393	50 %	25 %	0 %	25 %	529043447
36	NC_021913	ATTT	2	8	19764	19771	25 %	75 %	0 %	0 %	529043448
37	NC_021913	TTTC	2	8	19820	19827	0 %	75 %	0 %	25 %	529043448
38	NC_021913	CGAT	2	8	19963	19970	25 %	25 %	25 %	25 %	529043448
39	NC_021913	ATCG	2	8	20282	20289	25 %	25 %	25 %	25 %	529043448
40	NC_021913	GCAA	2	8	21222	21229	50 %	0 %	25 %	25 %	529043448
41	NC_021913	TGAG	2	8	21580	21587	25 %	25 %	50 %	0 %	529043448
42	NC_021913	TGAG	2	8	21713	21720	25 %	25 %	50 %	0 %	529043448
43	NC_021913	GACA	2	8	21745	21752	50 %	0 %	25 %	25 %	529043448
44	NC_021913	ACAA	2	8	22242	22249	75 %	0 %	0 %	25 %	529043448
45	NC_021913	ACGT	2	8	22681	22688	25 %	25 %	25 %	25 %	529043448
46	NC_021913	GGAG	2	8	23056	23063	25 %	0 %	75 %	0 %	529043448
47	NC_021913	GATT	2	8	23115	23122	25 %	50 %	25 %	0 %	529043448
48	NC_021913	GCTC	2	8	23212	23219	0 %	25 %	25 %	50 %	529043448
49	NC_021913	AAGC	2	8	24292	24299	50 %	0 %	25 %	25 %	529043449
50	NC_021913	TCAC	2	8	24312	24319	25 %	25 %	0 %	50 %	529043449
51	NC_021913	CGTT	2	8	24828	24835	0 %	50 %	25 %	25 %	529043450
52	NC_021913	TGGT	2	8	24999	25006	0 %	50 %	50 %	0 %	529043450
53	NC_021913	GATT	2	8	25020	25027	25 %	50 %	25 %	0 %	529043450
54	NC_021913	CGTC	2	8	26995	27002	0 %	25 %	25 %	50 %	529043452
55	NC_021913	CAGA	2	8	27038	27045	50 %	0 %	25 %	25 %	529043452
56	NC_021913	GACC	2	8	27407	27414	25 %	0 %	25 %	50 %	529043452
57	NC_021913	GACC	2	8	28006	28013	25 %	0 %	25 %	50 %	529043452
58	NC_021913	ATTC	2	8	28057	28064	25 %	50 %	0 %	25 %	529043452
59	NC_021913	CGAG	2	8	29404	29411	25 %	0 %	50 %	25 %	529043454
60	NC_021913	GCGG	2	8	30795	30802	0 %	0 %	75 %	25 %	529043456
61	NC_021913	GGAT	2	8	31728	31735	25 %	25 %	50 %	0 %	529043458
62	NC_021913	CGAT	2	8	32286	32293	25 %	25 %	25 %	25 %	529043458
63	NC_021913	CACG	2	8	32397	32404	25 %	0 %	25 %	50 %	529043459
64	NC_021913	TCGA	2	8	32686	32693	25 %	25 %	25 %	25 %	529043459
65	NC_021913	TCAC	2	8	33089	33096	25 %	25 %	0 %	50 %	529043460
66	NC_021913	TGCC	2	8	33386	33393	0 %	25 %	25 %	50 %	529043461
67	NC_021913	GGTG	2	8	33435	33442	0 %	25 %	75 %	0 %	529043461
68	NC_021913	TCGA	2	8	33577	33584	25 %	25 %	25 %	25 %	529043461
69	NC_021913	GACC	2	8	33702	33709	25 %	0 %	25 %	50 %	529043461
70	NC_021913	CGGG	2	8	34007	34014	0 %	0 %	75 %	25 %	529043461
71	NC_021913	CGCT	2	8	34910	34917	0 %	25 %	25 %	50 %	529043462
72	NC_021913	CACC	2	8	35927	35934	25 %	0 %	0 %	75 %	529043464
73	NC_021913	CCGG	2	8	36049	36056	0 %	0 %	50 %	50 %	529043464
74	NC_021913	GGAA	2	8	36474	36481	50 %	0 %	50 %	0 %	529043464
75	NC_021913	TTGC	2	8	37155	37162	0 %	50 %	25 %	25 %	529043465
76	NC_021913	TTCC	2	8	38022	38029	0 %	50 %	0 %	50 %	529043466
77	NC_021913	CCGG	2	8	38447	38454	0 %	0 %	50 %	50 %	529043466
78	NC_021913	CGAA	2	8	39756	39763	50 %	0 %	25 %	25 %	529043468
79	NC_021913	CGGG	2	8	41783	41790	0 %	0 %	75 %	25 %	529043472
80	NC_021913	GAAC	2	8	42885	42892	50 %	0 %	25 %	25 %	529043474
81	NC_021913	GATG	2	8	43053	43060	25 %	25 %	50 %	0 %	529043474
82	NC_021913	GAGT	2	8	44896	44903	25 %	25 %	50 %	0 %	529043475
83	NC_021913	GGTT	2	8	45057	45064	0 %	50 %	50 %	0 %	529043475
84	NC_021913	CAGT	2	8	45102	45109	25 %	25 %	25 %	25 %	529043475
85	NC_021913	AAGT	2	8	45374	45381	50 %	25 %	25 %	0 %	529043475
86	NC_021913	TCGC	2	8	45558	45565	0 %	25 %	25 %	50 %	529043475
87	NC_021913	CCAT	2	8	45917	45924	25 %	25 %	0 %	50 %	529043475
88	NC_021913	TCGA	2	8	48268	48275	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
89	NC_021913	CTGA	2	8	49300	49307	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
90	NC_021913	TCGA	2	8	49309	49316	25 %	25 %	25 %	25 %	529043476
91	NC_021913	CCTT	2	8	50560	50567	0 %	50 %	0 %	50 %	529043477
92	NC_021913	ACAA	2	8	51200	51207	75 %	0 %	0 %	25 %	529043477
93	NC_021913	GTTC	2	8	51283	51290	0 %	50 %	25 %	25 %	529043477
94	NC_021913	CGCA	2	8	51519	51526	25 %	0 %	25 %	50 %	529043478
95	NC_021913	TCGC	2	8	51679	51686	0 %	25 %	25 %	50 %	529043478
96	NC_021913	CTCG	3	12	51785	51796	0 %	25 %	25 %	50 %	529043478
97	NC_021913	CGAC	2	8	52704	52711	25 %	0 %	25 %	50 %	529043480
98	NC_021913	TGAC	2	8	52765	52772	25 %	25 %	25 %	25 %	529043480
99	NC_021913	CATC	2	8	52866	52873	25 %	25 %	0 %	50 %	529043480
100	NC_021913	GTTG	2	8	52948	52955	0 %	50 %	50 %	0 %	529043480
101	NC_021913	GATG	2	8	53800	53807	25 %	25 %	50 %	0 %	529043482
102	NC_021913	GCCA	2	8	54147	54154	25 %	0 %	25 %	50 %	529043482
103	NC_021913	AGGG	2	8	54158	54165	25 %	0 %	75 %	0 %	529043482
104	NC_021913	GGTC	2	8	54418	54425	0 %	25 %	50 %	25 %	529043482
105	NC_021913	TGAG	2	8	54555	54562	25 %	25 %	50 %	0 %	529043482
106	NC_021913	TCGA	2	8	55044	55051	25 %	25 %	25 %	25 %	529043482
107	NC_021913	TCGC	2	8	56772	56779	0 %	25 %	25 %	50 %	529043485
108	NC_021913	GACA	2	8	56800	56807	50 %	0 %	25 %	25 %	529043485
109	NC_021913	AGTC	2	8	57042	57049	25 %	25 %	25 %	25 %	529043485
110	NC_021913	AACC	2	8	57589	57596	50 %	0 %	0 %	50 %	529043486
111	NC_021913	CGCC	2	8	57640	57647	0 %	0 %	25 %	75 %	529043486
112	NC_021913	CGAG	2	8	58143	58150	25 %	0 %	50 %	25 %	529043487
113	NC_021913	GAAC	2	8	59514	59521	50 %	0 %	25 %	25 %	529043488
114	NC_021913	TTGT	2	8	59597	59604	0 %	75 %	25 %	0 %	529043488
115	NC_021913	AAGG	2	8	60237	60244	50 %	0 %	50 %	0 %	529043488
116	NC_021913	GTTC	2	8	61177	61184	0 %	50 %	25 %	25 %	529043489
117	NC_021913	GAAC	2	8	61268	61275	50 %	0 %	25 %	25 %	529043489
118	NC_021913	ACTG	2	8	62190	62197	25 %	25 %	25 %	25 %	529043491
119	NC_021913	GGGT	2	8	62256	62263	0 %	25 %	75 %	0 %	529043491
120	NC_021913	GATC	2	8	62305	62312	25 %	25 %	25 %	25 %	529043491
121	NC_021913	CGCT	2	8	63684	63691	0 %	25 %	25 %	50 %	529043492
122	NC_021913	TCGT	2	8	64287	64294	0 %	50 %	25 %	25 %	529043492
123	NC_021913	CGAC	2	8	64522	64529	25 %	0 %	25 %	50 %	529043492
124	NC_021913	GCTT	2	8	64570	64577	0 %	50 %	25 %	25 %	529043492
125	NC_021913	GAGT	2	8	64929	64936	25 %	25 %	50 %	0 %	529043492
126	NC_021913	CGAT	2	8	66871	66878	25 %	25 %	25 %	25 %	529043495
127	NC_021913	CGAA	2	8	66970	66977	50 %	0 %	25 %	25 %	529043495
128	NC_021913	CGAC	2	8	69490	69497	25 %	0 %	25 %	50 %	529043498
129	NC_021913	ACCG	2	8	69584	69591	25 %	0 %	25 %	50 %	529043498
130	NC_021913	CGAG	2	8	69992	69999	25 %	0 %	50 %	25 %	529043499
131	NC_021913	AGCG	2	8	70633	70640	25 %	0 %	50 %	25 %	529043500
132	NC_021913	CTGT	2	8	70754	70761	0 %	50 %	25 %	25 %	529043500
133	NC_021913	CGTA	2	8	71254	71261	25 %	25 %	25 %	25 %	529043501
134	NC_021913	TGAG	2	8	71408	71415	25 %	25 %	50 %	0 %	529043501
135	NC_021913	TCGA	2	8	71481	71488	25 %	25 %	25 %	25 %	529043501
136	NC_021913	CGTT	2	8	76513	76520	0 %	50 %	25 %	25 %	529043507
137	NC_021913	GTGG	2	8	76553	76560	0 %	25 %	75 %	0 %	529043507
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