MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021913	TC	3	6	1574	1579	0 %	50 %	0 %	50 %	529043440
2	NC_021913	CT	3	6	1929	1934	0 %	50 %	0 %	50 %	529043440
3	NC_021913	AG	3	6	2550	2555	50 %	0 %	50 %	0 %	529043440
4	NC_021913	CT	3	6	2962	2967	0 %	50 %	0 %	50 %	529043441
5	NC_021913	GT	3	6	3710	3715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021913	CA	3	6	3791	3796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021913	AG	3	6	4137	4142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021913	AG	3	6	4553	4558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021913	CA	3	6	5194	5199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021913	TG	3	6	5558	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	529043442
11	NC_021913	TG	3	6	5571	5576	0 %	50 %	50 %	0 %	529043442
12	NC_021913	GA	3	6	6023	6028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021913	GA	3	6	6895	6900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021913	CG	3	6	7343	7348	0 %	0 %	50 %	50 %	529043444
15	NC_021913	TC	3	6	7411	7416	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
16	NC_021913	GT	3	6	7542	7547	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
17	NC_021913	GT	3	6	8135	8140	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
18	NC_021913	AC	3	6	8454	8459	50 %	0 %	0 %	50 %	529043444
19	NC_021913	GC	3	6	8632	8637	0 %	0 %	50 %	50 %	529043444
20	NC_021913	AG	3	6	8728	8733	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
21	NC_021913	CA	3	6	8763	8768	50 %	0 %	0 %	50 %	529043444
22	NC_021913	TC	3	6	9199	9204	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
23	NC_021913	GA	3	6	9585	9590	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
24	NC_021913	GA	3	6	9837	9842	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
25	NC_021913	GT	3	6	9883	9888	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
26	NC_021913	TC	5	10	10027	10036	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
27	NC_021913	GA	3	6	10166	10171	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
28	NC_021913	TC	3	6	10324	10329	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
29	NC_021913	TG	3	6	10724	10729	0 %	50 %	50 %	0 %	529043445
30	NC_021913	TG	3	6	11081	11086	0 %	50 %	50 %	0 %	529043445
31	NC_021913	CG	3	6	11097	11102	0 %	0 %	50 %	50 %	529043445
32	NC_021913	AG	3	6	11681	11686	50 %	0 %	50 %	0 %	529043445
33	NC_021913	TG	3	6	12128	12133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021913	GA	3	6	12199	12204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021913	TG	3	6	12278	12283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021913	AC	3	6	12377	12382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021913	CT	3	6	12763	12768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021913	GC	3	6	13605	13610	0 %	0 %	50 %	50 %	529043446
39	NC_021913	CA	3	6	13913	13918	50 %	0 %	0 %	50 %	529043446
40	NC_021913	GC	3	6	14079	14084	0 %	0 %	50 %	50 %	529043446
41	NC_021913	AT	3	6	14091	14096	50 %	50 %	0 %	0 %	529043446
42	NC_021913	AG	3	6	14847	14852	50 %	0 %	50 %	0 %	529043446
43	NC_021913	CA	3	6	15080	15085	50 %	0 %	0 %	50 %	529043446
44	NC_021913	CA	3	6	15759	15764	50 %	0 %	0 %	50 %	529043446
45	NC_021913	CT	3	6	16364	16369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021913	TC	3	6	16816	16821	0 %	50 %	0 %	50 %	529043447
47	NC_021913	AC	3	6	17447	17452	50 %	0 %	0 %	50 %	529043447
48	NC_021913	TC	4	8	17517	17524	0 %	50 %	0 %	50 %	529043447
49	NC_021913	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	529043447
50	NC_021913	CG	4	8	17752	17759	0 %	0 %	50 %	50 %	529043447
51	NC_021913	GT	3	6	18221	18226	0 %	50 %	50 %	0 %	529043447
52	NC_021913	TC	3	6	18739	18744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021913	AT	3	6	19005	19010	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
54	NC_021913	GC	3	6	19446	19451	0 %	0 %	50 %	50 %	529043448
55	NC_021913	AT	3	6	19487	19492	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
56	NC_021913	CT	3	6	19545	19550	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
57	NC_021913	GC	3	6	20356	20361	0 %	0 %	50 %	50 %	529043448
58	NC_021913	TC	3	6	21360	21365	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
59	NC_021913	AT	3	6	21594	21599	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
60	NC_021913	CT	3	6	21721	21726	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
61	NC_021913	TC	3	6	23182	23187	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
62	NC_021913	AT	3	6	23503	23508	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
63	NC_021913	CA	3	6	24515	24520	50 %	0 %	0 %	50 %	529043449
64	NC_021913	CG	3	6	24715	24720	0 %	0 %	50 %	50 %	529043449
65	NC_021913	GC	3	6	24879	24884	0 %	0 %	50 %	50 %	529043450
66	NC_021913	CA	3	6	24944	24949	50 %	0 %	0 %	50 %	529043450
67	NC_021913	TC	3	6	25078	25083	0 %	50 %	0 %	50 %	529043450
68	NC_021913	GA	3	6	25630	25635	50 %	0 %	50 %	0 %	529043451
69	NC_021913	TG	3	6	26646	26651	0 %	50 %	50 %	0 %	529043451
70	NC_021913	GA	3	6	26982	26987	50 %	0 %	50 %	0 %	529043452
71	NC_021913	CA	3	6	27483	27488	50 %	0 %	0 %	50 %	529043452
72	NC_021913	AC	3	6	27663	27668	50 %	0 %	0 %	50 %	529043452
73	NC_021913	GA	3	6	28376	28381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021913	AG	3	6	29034	29039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021913	TC	3	6	30095	30100	0 %	50 %	0 %	50 %	529043455
76	NC_021913	GC	3	6	30122	30127	0 %	0 %	50 %	50 %	529043455
77	NC_021913	GT	3	6	30287	30292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021913	TG	3	6	30498	30503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021913	GA	3	6	31560	31565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021913	GC	3	6	31925	31930	0 %	0 %	50 %	50 %	529043458
81	NC_021913	GT	3	6	33283	33288	0 %	50 %	50 %	0 %	529043461
82	NC_021913	GT	3	6	33557	33562	0 %	50 %	50 %	0 %	529043461
83	NC_021913	CG	3	6	35085	35090	0 %	0 %	50 %	50 %	529043463
84	NC_021913	CG	3	6	36012	36017	0 %	0 %	50 %	50 %	529043464
85	NC_021913	GA	3	6	36327	36332	50 %	0 %	50 %	0 %	529043464
86	NC_021913	GT	3	6	37378	37383	0 %	50 %	50 %	0 %	529043465
87	NC_021913	TC	3	6	38171	38176	0 %	50 %	0 %	50 %	529043466
88	NC_021913	CG	3	6	38486	38491	0 %	0 %	50 %	50 %	529043466
89	NC_021913	TA	3	6	38983	38988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021913	TC	3	6	39951	39956	0 %	50 %	0 %	50 %	529043468
91	NC_021913	GA	3	6	40560	40565	50 %	0 %	50 %	0 %	529043470
92	NC_021913	CG	3	6	41474	41479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021913	GA	3	6	41890	41895	50 %	0 %	50 %	0 %	529043472
94	NC_021913	AC	3	6	42325	42330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021913	AC	3	6	42597	42602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021913	AC	3	6	43091	43096	50 %	0 %	0 %	50 %	529043474
97	NC_021913	TG	3	6	43392	43397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021913	TA	3	6	43399	43404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021913	CT	3	6	43783	43788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021913	AG	3	6	44138	44143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021913	CA	4	8	44261	44268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021913	AC	3	6	44752	44757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021913	AG	3	6	44773	44778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021913	GC	3	6	45406	45411	0 %	0 %	50 %	50 %	529043475
105	NC_021913	TC	3	6	45456	45461	0 %	50 %	0 %	50 %	529043475
106	NC_021913	AG	3	6	46149	46154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021913	TA	3	6	46334	46339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021913	CA	3	6	46672	46677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021913	TC	3	6	46811	46816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021913	CT	3	6	47396	47401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021913	AG	3	6	47418	47423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021913	GA	3	6	47463	47468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021913	AC	3	6	47496	47501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021913	GA	3	6	47586	47591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021913	GT	4	8	47709	47716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021913	CT	3	6	47803	47808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021913	GT	4	8	47914	47921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021913	CA	3	6	48040	48045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021913	TC	3	6	49375	49380	0 %	50 %	0 %	50 %	529043476
120	NC_021913	GA	3	6	50088	50093	50 %	0 %	50 %	0 %	529043477
121	NC_021913	GC	3	6	50644	50649	0 %	0 %	50 %	50 %	529043477
122	NC_021913	GA	3	6	51047	51052	50 %	0 %	50 %	0 %	529043477
123	NC_021913	AG	3	6	51077	51082	50 %	0 %	50 %	0 %	529043477
124	NC_021913	TC	3	6	51192	51197	0 %	50 %	0 %	50 %	529043477
125	NC_021913	CT	3	6	52080	52085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021913	CA	3	6	52321	52326	50 %	0 %	0 %	50 %	529043479
127	NC_021913	CG	3	6	52466	52471	0 %	0 %	50 %	50 %	529043480
128	NC_021913	CT	3	6	53232	53237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021913	GA	4	8	53244	53251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021913	CG	3	6	54669	54674	0 %	0 %	50 %	50 %	529043482
131	NC_021913	AT	3	6	55178	55183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021913	TC	3	6	55500	55505	0 %	50 %	0 %	50 %	529043483
133	NC_021913	GC	3	6	55512	55517	0 %	0 %	50 %	50 %	529043483
134	NC_021913	CG	3	6	55579	55584	0 %	0 %	50 %	50 %	529043483
135	NC_021913	AC	3	6	55987	55992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021913	CG	3	6	56789	56794	0 %	0 %	50 %	50 %	529043485
137	NC_021913	GA	3	6	59607	59612	50 %	0 %	50 %	0 %	529043488
138	NC_021913	CT	3	6	59722	59727	0 %	50 %	0 %	50 %	529043488
139	NC_021913	CT	3	6	59751	59756	0 %	50 %	0 %	50 %	529043488
140	NC_021913	GC	3	6	60155	60160	0 %	0 %	50 %	50 %	529043488
141	NC_021913	TC	3	6	60711	60716	0 %	50 %	0 %	50 %	529043488
142	NC_021913	CT	3	6	61332	61337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021913	TG	3	6	62442	62447	0 %	50 %	50 %	0 %	529043491
144	NC_021913	GA	3	6	63445	63450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021913	CA	3	6	63560	63565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021913	TC	3	6	64124	64129	0 %	50 %	0 %	50 %	529043492
147	NC_021913	TC	3	6	65908	65913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021913	AG	3	6	66034	66039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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