MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 451

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021913	TC	3	6	1574	1579	0 %	50 %	0 %	50 %	529043440
2	NC_021913	CT	3	6	1929	1934	0 %	50 %	0 %	50 %	529043440
3	NC_021913	AG	3	6	2550	2555	50 %	0 %	50 %	0 %	529043440
4	NC_021913	CT	3	6	2962	2967	0 %	50 %	0 %	50 %	529043441
5	NC_021913	TG	3	6	5558	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	529043442
6	NC_021913	TG	3	6	5571	5576	0 %	50 %	50 %	0 %	529043442
7	NC_021913	CG	3	6	7343	7348	0 %	0 %	50 %	50 %	529043444
8	NC_021913	TC	3	6	7411	7416	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
9	NC_021913	GT	3	6	7542	7547	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
10	NC_021913	GT	3	6	8135	8140	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
11	NC_021913	AC	3	6	8454	8459	50 %	0 %	0 %	50 %	529043444
12	NC_021913	GC	3	6	8632	8637	0 %	0 %	50 %	50 %	529043444
13	NC_021913	AG	3	6	8728	8733	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
14	NC_021913	CA	3	6	8763	8768	50 %	0 %	0 %	50 %	529043444
15	NC_021913	TC	3	6	9199	9204	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
16	NC_021913	GA	3	6	9585	9590	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
17	NC_021913	GA	3	6	9837	9842	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
18	NC_021913	GT	3	6	9883	9888	0 %	50 %	50 %	0 %	529043444
19	NC_021913	TC	5	10	10027	10036	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
20	NC_021913	GA	3	6	10166	10171	50 %	0 %	50 %	0 %	529043444
21	NC_021913	TC	3	6	10324	10329	0 %	50 %	0 %	50 %	529043444
22	NC_021913	TG	3	6	10724	10729	0 %	50 %	50 %	0 %	529043445
23	NC_021913	TG	3	6	11081	11086	0 %	50 %	50 %	0 %	529043445
24	NC_021913	CG	3	6	11097	11102	0 %	0 %	50 %	50 %	529043445
25	NC_021913	AG	3	6	11681	11686	50 %	0 %	50 %	0 %	529043445
26	NC_021913	GC	3	6	13605	13610	0 %	0 %	50 %	50 %	529043446
27	NC_021913	CA	3	6	13913	13918	50 %	0 %	0 %	50 %	529043446
28	NC_021913	GC	3	6	14079	14084	0 %	0 %	50 %	50 %	529043446
29	NC_021913	AT	3	6	14091	14096	50 %	50 %	0 %	0 %	529043446
30	NC_021913	AG	3	6	14847	14852	50 %	0 %	50 %	0 %	529043446
31	NC_021913	CA	3	6	15080	15085	50 %	0 %	0 %	50 %	529043446
32	NC_021913	CA	3	6	15759	15764	50 %	0 %	0 %	50 %	529043446
33	NC_021913	TC	3	6	16816	16821	0 %	50 %	0 %	50 %	529043447
34	NC_021913	AC	3	6	17447	17452	50 %	0 %	0 %	50 %	529043447
35	NC_021913	TC	4	8	17517	17524	0 %	50 %	0 %	50 %	529043447
36	NC_021913	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	529043447
37	NC_021913	CG	4	8	17752	17759	0 %	0 %	50 %	50 %	529043447
38	NC_021913	GT	3	6	18221	18226	0 %	50 %	50 %	0 %	529043447
39	NC_021913	AT	3	6	19005	19010	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
40	NC_021913	GC	3	6	19446	19451	0 %	0 %	50 %	50 %	529043448
41	NC_021913	AT	3	6	19487	19492	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
42	NC_021913	CT	3	6	19545	19550	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
43	NC_021913	GC	3	6	20356	20361	0 %	0 %	50 %	50 %	529043448
44	NC_021913	TC	3	6	21360	21365	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
45	NC_021913	AT	3	6	21594	21599	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
46	NC_021913	CT	3	6	21721	21726	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
47	NC_021913	TC	3	6	23182	23187	0 %	50 %	0 %	50 %	529043448
48	NC_021913	AT	3	6	23503	23508	50 %	50 %	0 %	0 %	529043448
49	NC_021913	CA	3	6	24515	24520	50 %	0 %	0 %	50 %	529043449
50	NC_021913	CG	3	6	24715	24720	0 %	0 %	50 %	50 %	529043449
51	NC_021913	GC	3	6	24879	24884	0 %	0 %	50 %	50 %	529043450
52	NC_021913	CA	3	6	24944	24949	50 %	0 %	0 %	50 %	529043450
53	NC_021913	TC	3	6	25078	25083	0 %	50 %	0 %	50 %	529043450
54	NC_021913	GA	3	6	25630	25635	50 %	0 %	50 %	0 %	529043451
55	NC_021913	TG	3	6	26646	26651	0 %	50 %	50 %	0 %	529043451
56	NC_021913	GA	3	6	26982	26987	50 %	0 %	50 %	0 %	529043452
57	NC_021913	CA	3	6	27483	27488	50 %	0 %	0 %	50 %	529043452
58	NC_021913	AC	3	6	27663	27668	50 %	0 %	0 %	50 %	529043452
59	NC_021913	TC	3	6	30095	30100	0 %	50 %	0 %	50 %	529043455
60	NC_021913	GC	3	6	30122	30127	0 %	0 %	50 %	50 %	529043455
61	NC_021913	GC	3	6	31925	31930	0 %	0 %	50 %	50 %	529043458
62	NC_021913	GT	3	6	33283	33288	0 %	50 %	50 %	0 %	529043461
63	NC_021913	GT	3	6	33557	33562	0 %	50 %	50 %	0 %	529043461
64	NC_021913	CG	3	6	35085	35090	0 %	0 %	50 %	50 %	529043463
65	NC_021913	CG	3	6	36012	36017	0 %	0 %	50 %	50 %	529043464
66	NC_021913	GA	3	6	36327	36332	50 %	0 %	50 %	0 %	529043464
67	NC_021913	GT	3	6	37378	37383	0 %	50 %	50 %	0 %	529043465
68	NC_021913	TC	3	6	38171	38176	0 %	50 %	0 %	50 %	529043466
69	NC_021913	CG	3	6	38486	38491	0 %	0 %	50 %	50 %	529043466
70	NC_021913	TC	3	6	39951	39956	0 %	50 %	0 %	50 %	529043468
71	NC_021913	GA	3	6	40560	40565	50 %	0 %	50 %	0 %	529043470
72	NC_021913	GA	3	6	41890	41895	50 %	0 %	50 %	0 %	529043472
73	NC_021913	AC	3	6	43091	43096	50 %	0 %	0 %	50 %	529043474
74	NC_021913	GC	3	6	45406	45411	0 %	0 %	50 %	50 %	529043475
75	NC_021913	TC	3	6	45456	45461	0 %	50 %	0 %	50 %	529043475
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80	NC_021913	AG	3	6	51077	51082	50 %	0 %	50 %	0 %	529043477
81	NC_021913	TC	3	6	51192	51197	0 %	50 %	0 %	50 %	529043477
82	NC_021913	CA	3	6	52321	52326	50 %	0 %	0 %	50 %	529043479
83	NC_021913	CG	3	6	52466	52471	0 %	0 %	50 %	50 %	529043480
84	NC_021913	CG	3	6	54669	54674	0 %	0 %	50 %	50 %	529043482
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86	NC_021913	GC	3	6	55512	55517	0 %	0 %	50 %	50 %	529043483
87	NC_021913	CG	3	6	55579	55584	0 %	0 %	50 %	50 %	529043483
88	NC_021913	CG	3	6	56789	56794	0 %	0 %	50 %	50 %	529043485
89	NC_021913	GA	3	6	59607	59612	50 %	0 %	50 %	0 %	529043488
90	NC_021913	CT	3	6	59722	59727	0 %	50 %	0 %	50 %	529043488
91	NC_021913	CT	3	6	59751	59756	0 %	50 %	0 %	50 %	529043488
92	NC_021913	GC	3	6	60155	60160	0 %	0 %	50 %	50 %	529043488
93	NC_021913	TC	3	6	60711	60716	0 %	50 %	0 %	50 %	529043488
94	NC_021913	TG	3	6	62442	62447	0 %	50 %	50 %	0 %	529043491
95	NC_021913	TC	3	6	64124	64129	0 %	50 %	0 %	50 %	529043492
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102	NC_021913	TC	3	6	70664	70669	0 %	50 %	0 %	50 %	529043500
103	NC_021913	GT	3	6	70694	70699	0 %	50 %	50 %	0 %	529043500
104	NC_021913	GC	3	6	71665	71670	0 %	0 %	50 %	50 %	529043501
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106	NC_021913	CG	3	6	77235	77240	0 %	0 %	50 %	50 %	529043507
107	NC_021913	GA	3	6	83243	83248	50 %	0 %	50 %	0 %	529043514
108	NC_021913	GT	3	6	83297	83302	0 %	50 %	50 %	0 %	529043514
109	NC_021913	GC	3	6	83608	83613	0 %	0 %	50 %	50 %	529043514
110	NC_021913	TC	3	6	83958	83963	0 %	50 %	0 %	50 %	529043514
111	NC_021913	TC	4	8	85168	85175	0 %	50 %	0 %	50 %	529043516
112	NC_021913	CG	3	6	85211	85216	0 %	0 %	50 %	50 %	529043516
113	NC_021913	AG	3	6	85352	85357	50 %	0 %	50 %	0 %	529043517
114	NC_021913	AG	4	8	86786	86793	50 %	0 %	50 %	0 %	529043519
115	NC_021913	GA	3	6	87836	87841	50 %	0 %	50 %	0 %	529043520
116	NC_021913	GT	3	6	88764	88769	0 %	50 %	50 %	0 %	529043521
117	NC_021913	AG	3	6	89400	89405	50 %	0 %	50 %	0 %	529043522
118	NC_021913	GA	3	6	89446	89451	50 %	0 %	50 %	0 %	529043522
119	NC_021913	GA	3	6	89482	89487	50 %	0 %	50 %	0 %	529043522
120	NC_021913	AC	3	6	89794	89799	50 %	0 %	0 %	50 %	529043523
121	NC_021913	TC	3	6	90422	90427	0 %	50 %	0 %	50 %	529043524
122	NC_021913	CG	3	6	90642	90647	0 %	0 %	50 %	50 %	529043525
123	NC_021913	GC	3	6	91920	91925	0 %	0 %	50 %	50 %	529043526
124	NC_021913	GA	3	6	92770	92775	50 %	0 %	50 %	0 %	529043527
125	NC_021913	GA	3	6	95440	95445	50 %	0 %	50 %	0 %	529043528
126	NC_021913	TC	3	6	97699	97704	0 %	50 %	0 %	50 %	529043530
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129	NC_021913	CG	3	6	98965	98970	0 %	0 %	50 %	50 %	529043532
130	NC_021913	GC	3	6	98974	98979	0 %	0 %	50 %	50 %	529043532
131	NC_021913	GA	3	6	99381	99386	50 %	0 %	50 %	0 %	529043532
132	NC_021913	GA	3	6	99623	99628	50 %	0 %	50 %	0 %	529043532
133	NC_021913	CG	3	6	101665	101670	0 %	0 %	50 %	50 %	529043534
134	NC_021913	CG	3	6	102435	102440	0 %	0 %	50 %	50 %	529043534
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