MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021912	CCGTT	2	10	2313	2322	0 %	40 %	20 %	40 %	528838744
2	NC_021912	TCTAT	2	10	4729	4738	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021912	ATTCA	2	10	5167	5176	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021912	ATCTG	2	10	5587	5596	20 %	40 %	20 %	20 %	528838748
5	NC_021912	ATTTG	2	10	5985	5994	20 %	60 %	20 %	0 %	528838748
6	NC_021912	CTTCA	2	10	6314	6323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021912	AATTA	2	10	6600	6609	60 %	40 %	0 %	0 %	528838749
8	NC_021912	ACCAT	2	10	7356	7365	40 %	20 %	0 %	40 %	528838750
9	NC_021912	GAATA	2	10	7748	7757	60 %	20 %	20 %	0 %	528838750
10	NC_021912	GTATT	2	10	7829	7838	20 %	60 %	20 %	0 %	528838750
11	NC_021912	GATTA	2	10	8700	8709	40 %	40 %	20 %	0 %	528838750
12	NC_021912	TTGCA	2	10	9048	9057	20 %	40 %	20 %	20 %	528838750
13	NC_021912	TAAAT	2	10	10401	10410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021912	CTTTT	2	10	10448	10457	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021912	TTTCT	2	10	12099	12108	0 %	80 %	0 %	20 %	528838752
16	NC_021912	TAAAA	2	10	13385	13394	80 %	20 %	0 %	0 %	528838753
17	NC_021912	GGGTA	2	10	13637	13646	20 %	20 %	60 %	0 %	528838754
18	NC_021912	CTAAG	2	10	15503	15512	40 %	20 %	20 %	20 %	528838756
19	NC_021912	CATGC	2	10	18569	18578	20 %	20 %	20 %	40 %	528838761
20	NC_021912	AAAAG	2	10	20014	20023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021912	TTGAC	2	10	21318	21327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021912	ATTTG	2	10	22596	22605	20 %	60 %	20 %	0 %	528838769
23	NC_021912	GAAAA	2	10	22855	22864	80 %	0 %	20 %	0 %	528838770
24	NC_021912	GAAAA	2	10	22925	22934	80 %	0 %	20 %	0 %	528838770
25	NC_021912	TTTAA	2	10	23125	23134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021912	AAATG	2	10	23476	23485	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021912	GTTAA	2	10	24452	24461	40 %	40 %	20 %	0 %	528838773
28	NC_021912	TAATT	2	10	25168	25177	40 %	60 %	0 %	0 %	528838774
29	NC_021912	TTCTT	2	10	25761	25770	0 %	80 %	0 %	20 %	528838774
30	NC_021912	ATCTT	2	10	27500	27509	20 %	60 %	0 %	20 %	528838776
31	NC_021912	AAAAT	2	10	27938	27947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021912	AAGCA	2	10	28394	28403	60 %	0 %	20 %	20 %	528838777
33	NC_021912	AACCA	2	10	34608	34617	60 %	0 %	0 %	40 %	528838782
34	NC_021912	CAATA	2	10	35077	35086	60 %	20 %	0 %	20 %	528838782
35	NC_021912	CGTAA	2	10	39502	39511	40 %	20 %	20 %	20 %	528838788
36	NC_021912	AAGCA	2	10	40268	40277	60 %	0 %	20 %	20 %	528838788
37	NC_021912	CTTTA	2	10	40331	40340	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.