MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021912	CCGTT	2	10	2313	2322	0 %	40 %	20 %	40 %	528838744
2	NC_021912	ATCTG	2	10	5587	5596	20 %	40 %	20 %	20 %	528838748
3	NC_021912	ATTTG	2	10	5985	5994	20 %	60 %	20 %	0 %	528838748
4	NC_021912	AATTA	2	10	6600	6609	60 %	40 %	0 %	0 %	528838749
5	NC_021912	ACCAT	2	10	7356	7365	40 %	20 %	0 %	40 %	528838750
6	NC_021912	GAATA	2	10	7748	7757	60 %	20 %	20 %	0 %	528838750
7	NC_021912	GTATT	2	10	7829	7838	20 %	60 %	20 %	0 %	528838750
8	NC_021912	GATTA	2	10	8700	8709	40 %	40 %	20 %	0 %	528838750
9	NC_021912	TTGCA	2	10	9048	9057	20 %	40 %	20 %	20 %	528838750
10	NC_021912	TTTCT	2	10	12099	12108	0 %	80 %	0 %	20 %	528838752
11	NC_021912	TAAAA	2	10	13385	13394	80 %	20 %	0 %	0 %	528838753
12	NC_021912	GGGTA	2	10	13637	13646	20 %	20 %	60 %	0 %	528838754
13	NC_021912	CTAAG	2	10	15503	15512	40 %	20 %	20 %	20 %	528838756
14	NC_021912	CATGC	2	10	18569	18578	20 %	20 %	20 %	40 %	528838761
15	NC_021912	ATTTG	2	10	22596	22605	20 %	60 %	20 %	0 %	528838769
16	NC_021912	GAAAA	2	10	22855	22864	80 %	0 %	20 %	0 %	528838770
17	NC_021912	GAAAA	2	10	22925	22934	80 %	0 %	20 %	0 %	528838770
18	NC_021912	GTTAA	2	10	24452	24461	40 %	40 %	20 %	0 %	528838773
19	NC_021912	TAATT	2	10	25168	25177	40 %	60 %	0 %	0 %	528838774
20	NC_021912	TTCTT	2	10	25761	25770	0 %	80 %	0 %	20 %	528838774
21	NC_021912	ATCTT	2	10	27500	27509	20 %	60 %	0 %	20 %	528838776
22	NC_021912	AAGCA	2	10	28394	28403	60 %	0 %	20 %	20 %	528838777
23	NC_021912	AACCA	2	10	34608	34617	60 %	0 %	0 %	40 %	528838782
24	NC_021912	CAATA	2	10	35077	35086	60 %	20 %	0 %	20 %	528838782
25	NC_021912	CGTAA	2	10	39502	39511	40 %	20 %	20 %	20 %	528838788
26	NC_021912	AAGCA	2	10	40268	40277	60 %	0 %	20 %	20 %	528838788

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.