MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021912	GGTA	2	8	246	253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021912	CCAA	2	8	684	691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021912	ACGG	2	8	859	866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021912	CATG	2	8	893	900	25 %	25 %	25 %	25 %	528838744
5	NC_021912	CATT	2	8	906	913	25 %	50 %	0 %	25 %	528838744
6	NC_021912	GCTT	2	8	1362	1369	0 %	50 %	25 %	25 %	528838744
7	NC_021912	TTGG	2	8	1949	1956	0 %	50 %	50 %	0 %	528838744
8	NC_021912	AATT	2	8	2612	2619	50 %	50 %	0 %	0 %	528838744
9	NC_021912	ATTG	2	8	3088	3095	25 %	50 %	25 %	0 %	528838745
10	NC_021912	TTCT	2	8	3443	3450	0 %	75 %	0 %	25 %	528838745
11	NC_021912	TGAT	2	8	3617	3624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021912	AATG	2	8	3724	3731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021912	AAGC	2	8	3733	3740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021912	TGAT	2	8	4427	4434	25 %	50 %	25 %	0 %	528838746
15	NC_021912	TAGC	2	8	4774	4781	25 %	25 %	25 %	25 %	528838747
16	NC_021912	AGCT	2	8	4848	4855	25 %	25 %	25 %	25 %	528838747
17	NC_021912	ATAA	2	8	5055	5062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021912	TAAA	2	8	5397	5404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021912	ATTA	2	8	5451	5458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021912	TGCG	2	8	5511	5518	0 %	25 %	50 %	25 %	528838748
21	NC_021912	TTAT	2	8	6053	6060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021912	GTAA	2	8	6125	6132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021912	TGAT	2	8	6245	6252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021912	TTTA	2	8	6370	6377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021912	TTTA	2	8	6390	6397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021912	AATC	2	8	6615	6622	50 %	25 %	0 %	25 %	528838749
27	NC_021912	ATCT	2	8	6983	6990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021912	CTTA	2	8	7248	7255	25 %	50 %	0 %	25 %	528838750
29	NC_021912	CAAT	2	8	7409	7416	50 %	25 %	0 %	25 %	528838750
30	NC_021912	TCTA	2	8	7419	7426	25 %	50 %	0 %	25 %	528838750
31	NC_021912	TGTC	2	8	7738	7745	0 %	50 %	25 %	25 %	528838750
32	NC_021912	CTTT	2	8	7894	7901	0 %	75 %	0 %	25 %	528838750
33	NC_021912	TTTA	2	8	8085	8092	25 %	75 %	0 %	0 %	528838750
34	NC_021912	ATAA	2	8	8800	8807	75 %	25 %	0 %	0 %	528838750
35	NC_021912	GATC	2	8	9111	9118	25 %	25 %	25 %	25 %	528838750
36	NC_021912	CAAT	2	8	9164	9171	50 %	25 %	0 %	25 %	528838750
37	NC_021912	TTGC	2	8	9275	9282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021912	TTTC	2	8	9417	9424	0 %	75 %	0 %	25 %	528838751
39	NC_021912	TGCC	2	8	9485	9492	0 %	25 %	25 %	50 %	528838751
40	NC_021912	TTAG	2	8	10473	10480	25 %	50 %	25 %	0 %	528838752
41	NC_021912	TTTC	2	8	11156	11163	0 %	75 %	0 %	25 %	528838752
42	NC_021912	CTTC	2	8	11419	11426	0 %	50 %	0 %	50 %	528838752
43	NC_021912	GTAA	2	8	12008	12015	50 %	25 %	25 %	0 %	528838752
44	NC_021912	TTTA	2	8	12300	12307	25 %	75 %	0 %	0 %	528838752
45	NC_021912	ATTT	2	8	12888	12895	25 %	75 %	0 %	0 %	528838753
46	NC_021912	AAAC	2	8	12993	13000	75 %	0 %	0 %	25 %	528838753
47	NC_021912	TGAC	2	8	13062	13069	25 %	25 %	25 %	25 %	528838753
48	NC_021912	ATTC	2	8	13071	13078	25 %	50 %	0 %	25 %	528838753
49	NC_021912	TTGA	2	8	13103	13110	25 %	50 %	25 %	0 %	528838753
50	NC_021912	AACC	2	8	13441	13448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021912	CTTG	2	8	13657	13664	0 %	50 %	25 %	25 %	528838754
52	NC_021912	TTTA	2	8	13688	13695	25 %	75 %	0 %	0 %	528838754
53	NC_021912	TGAT	2	8	13755	13762	25 %	50 %	25 %	0 %	528838754
54	NC_021912	CTGG	2	8	14245	14252	0 %	25 %	50 %	25 %	528838754
55	NC_021912	TGGC	2	8	14691	14698	0 %	25 %	50 %	25 %	528838754
56	NC_021912	CATT	2	8	15076	15083	25 %	50 %	0 %	25 %	528838755
57	NC_021912	ATAA	2	8	15521	15528	75 %	25 %	0 %	0 %	528838756
58	NC_021912	CGTT	2	8	15997	16004	0 %	50 %	25 %	25 %	528838756
59	NC_021912	TTAA	2	8	16222	16229	50 %	50 %	0 %	0 %	528838756
60	NC_021912	CTTT	2	8	16452	16459	0 %	75 %	0 %	25 %	528838756
61	NC_021912	CAAC	2	8	16631	16638	50 %	0 %	0 %	50 %	528838756
62	NC_021912	TTCT	2	8	16866	16873	0 %	75 %	0 %	25 %	528838756
63	NC_021912	TCTT	2	8	16945	16952	0 %	75 %	0 %	25 %	528838756
64	NC_021912	GATC	2	8	17034	17041	25 %	25 %	25 %	25 %	528838756
65	NC_021912	CCTT	2	8	17062	17069	0 %	50 %	0 %	50 %	528838756
66	NC_021912	CTTT	2	8	17184	17191	0 %	75 %	0 %	25 %	528838757
67	NC_021912	AATT	2	8	18107	18114	50 %	50 %	0 %	0 %	528838760
68	NC_021912	AACC	2	8	18293	18300	50 %	0 %	0 %	50 %	528838760
69	NC_021912	ATTG	2	8	18901	18908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021912	TCAC	2	8	19052	19059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021912	ATTG	2	8	19946	19953	25 %	50 %	25 %	0 %	528838764
72	NC_021912	GTTA	2	8	19987	19994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021912	CAAC	2	8	20499	20506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021912	CGGC	2	8	20594	20601	0 %	0 %	50 %	50 %	528838766
75	NC_021912	TCTG	2	8	21154	21161	0 %	50 %	25 %	25 %	528838767
76	NC_021912	TGTT	2	8	21578	21585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021912	GGTG	2	8	21847	21854	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021912	TAAA	2	8	22139	22146	75 %	25 %	0 %	0 %	528838769
79	NC_021912	CAAA	2	8	22227	22234	75 %	0 %	0 %	25 %	528838769
80	NC_021912	GACC	2	8	22378	22385	25 %	0 %	25 %	50 %	528838769
81	NC_021912	CGAA	2	8	23434	23441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021912	TAAA	2	8	23514	23521	75 %	25 %	0 %	0 %	528838771
83	NC_021912	AAGT	2	8	24179	24186	50 %	25 %	25 %	0 %	528838772
84	NC_021912	TTCA	2	8	24670	24677	25 %	50 %	0 %	25 %	528838773
85	NC_021912	GCCA	2	8	25470	25477	25 %	0 %	25 %	50 %	528838774
86	NC_021912	ACTA	2	8	25705	25712	50 %	25 %	0 %	25 %	528838774
87	NC_021912	AAAC	2	8	26206	26213	75 %	0 %	0 %	25 %	528838775
88	NC_021912	ATTG	2	8	26758	26765	25 %	50 %	25 %	0 %	528838776
89	NC_021912	TTTC	2	8	27216	27223	0 %	75 %	0 %	25 %	528838776
90	NC_021912	ATGA	2	8	27927	27934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021912	CCAA	2	8	28001	28008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021912	TATC	2	8	28306	28313	25 %	50 %	0 %	25 %	528838777
93	NC_021912	ATAA	2	8	28887	28894	75 %	25 %	0 %	0 %	528838777
94	NC_021912	CCAA	2	8	30233	30240	50 %	0 %	0 %	50 %	528838778
95	NC_021912	CCAA	2	8	30608	30615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021912	TTTA	2	8	30629	30636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021912	TTAA	2	8	30829	30836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021912	AATT	2	8	31622	31629	50 %	50 %	0 %	0 %	528838780
99	NC_021912	TTTG	2	8	31754	31761	0 %	75 %	25 %	0 %	528838780
100	NC_021912	TGAT	2	8	31912	31919	25 %	50 %	25 %	0 %	528838780
101	NC_021912	TTTC	2	8	32592	32599	0 %	75 %	0 %	25 %	528838780
102	NC_021912	ACTA	2	8	32958	32965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021912	TACC	2	8	33587	33594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021912	AAAG	2	8	34176	34183	75 %	0 %	25 %	0 %	528838782
105	NC_021912	ACAA	2	8	34269	34276	75 %	0 %	0 %	25 %	528838782
106	NC_021912	TAAC	2	8	34429	34436	50 %	25 %	0 %	25 %	528838782
107	NC_021912	CAAA	2	8	35016	35023	75 %	0 %	0 %	25 %	528838782
108	NC_021912	TTAA	2	8	35235	35242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021912	TAAT	2	8	35580	35587	50 %	50 %	0 %	0 %	528838783
110	NC_021912	AAAT	2	8	35882	35889	75 %	25 %	0 %	0 %	528838783
111	NC_021912	CAAA	2	8	36466	36473	75 %	0 %	0 %	25 %	528838783
112	NC_021912	ATTT	2	8	36554	36561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021912	TAAG	2	8	36844	36851	50 %	25 %	25 %	0 %	528838784
114	NC_021912	GAGC	2	8	36892	36899	25 %	0 %	50 %	25 %	528838784
115	NC_021912	TCAA	2	8	36954	36961	50 %	25 %	0 %	25 %	528838784
116	NC_021912	TTGA	2	8	37102	37109	25 %	50 %	25 %	0 %	528838784
117	NC_021912	TCAA	2	8	37358	37365	50 %	25 %	0 %	25 %	528838785
118	NC_021912	TAAT	2	8	37838	37845	50 %	50 %	0 %	0 %	528838786
119	NC_021912	AAAT	2	8	37882	37889	75 %	25 %	0 %	0 %	528838786
120	NC_021912	AATT	2	8	37962	37969	50 %	50 %	0 %	0 %	528838786
121	NC_021912	GAAA	2	8	38465	38472	75 %	0 %	25 %	0 %	528838786
122	NC_021912	AGGA	2	8	39479	39486	50 %	0 %	50 %	0 %	528838788
123	NC_021912	AACC	2	8	39775	39782	50 %	0 %	0 %	50 %	528838788
124	NC_021912	CATC	2	8	40687	40694	25 %	25 %	0 %	50 %	528838789
125	NC_021912	AAGA	2	8	40886	40893	75 %	0 %	25 %	0 %	528838789
126	NC_021912	CTTT	2	8	40903	40910	0 %	75 %	0 %	25 %	528838789
127	NC_021912	CCAC	2	8	41172	41179	25 %	0 %	0 %	75 %	528838789
128	NC_021912	CCAG	2	8	41260	41267	25 %	0 %	25 %	50 %	528838789
129	NC_021912	CATA	2	8	41289	41296	50 %	25 %	0 %	25 %	528838789
130	NC_021912	AATT	2	8	41326	41333	50 %	50 %	0 %	0 %	528838789

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.