MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021912	GGTA	2	8	246	253	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021912	CCAA	2	8	684	691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021912	ACGG	2	8	859	866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021912	TGAT	2	8	3617	3624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021912	AATG	2	8	3724	3731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021912	AAGC	2	8	3733	3740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021912	ATAA	2	8	5055	5062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021912	TAAA	2	8	5397	5404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021912	ATTA	2	8	5451	5458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021912	TTAT	2	8	6053	6060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021912	GTAA	2	8	6125	6132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021912	TGAT	2	8	6245	6252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021912	TTTA	2	8	6370	6377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021912	TTTA	2	8	6390	6397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021912	ATCT	2	8	6983	6990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021912	TTGC	2	8	9275	9282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021912	AACC	2	8	13441	13448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021912	ATTG	2	8	18901	18908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021912	TCAC	2	8	19052	19059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021912	GTTA	2	8	19987	19994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021912	CAAC	2	8	20499	20506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021912	TGTT	2	8	21578	21585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021912	GGTG	2	8	21847	21854	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021912	CGAA	2	8	23434	23441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021912	ATGA	2	8	27927	27934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021912	CCAA	2	8	28001	28008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021912	CCAA	2	8	30608	30615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021912	TTTA	2	8	30629	30636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021912	TTAA	2	8	30829	30836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021912	ACTA	2	8	32958	32965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021912	TACC	2	8	33587	33594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021912	TTAA	2	8	35235	35242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021912	ATTT	2	8	36554	36561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.