MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021912	CATG	2	8	893	900	25 %	25 %	25 %	25 %	528838744
2	NC_021912	CATT	2	8	906	913	25 %	50 %	0 %	25 %	528838744
3	NC_021912	GCTT	2	8	1362	1369	0 %	50 %	25 %	25 %	528838744
4	NC_021912	TTGG	2	8	1949	1956	0 %	50 %	50 %	0 %	528838744
5	NC_021912	AATT	2	8	2612	2619	50 %	50 %	0 %	0 %	528838744
6	NC_021912	ATTG	2	8	3088	3095	25 %	50 %	25 %	0 %	528838745
7	NC_021912	TTCT	2	8	3443	3450	0 %	75 %	0 %	25 %	528838745
8	NC_021912	TGAT	2	8	4427	4434	25 %	50 %	25 %	0 %	528838746
9	NC_021912	TAGC	2	8	4774	4781	25 %	25 %	25 %	25 %	528838747
10	NC_021912	AGCT	2	8	4848	4855	25 %	25 %	25 %	25 %	528838747
11	NC_021912	TGCG	2	8	5511	5518	0 %	25 %	50 %	25 %	528838748
12	NC_021912	AATC	2	8	6615	6622	50 %	25 %	0 %	25 %	528838749
13	NC_021912	CTTA	2	8	7248	7255	25 %	50 %	0 %	25 %	528838750
14	NC_021912	CAAT	2	8	7409	7416	50 %	25 %	0 %	25 %	528838750
15	NC_021912	TCTA	2	8	7419	7426	25 %	50 %	0 %	25 %	528838750
16	NC_021912	TGTC	2	8	7738	7745	0 %	50 %	25 %	25 %	528838750
17	NC_021912	CTTT	2	8	7894	7901	0 %	75 %	0 %	25 %	528838750
18	NC_021912	TTTA	2	8	8085	8092	25 %	75 %	0 %	0 %	528838750
19	NC_021912	ATAA	2	8	8800	8807	75 %	25 %	0 %	0 %	528838750
20	NC_021912	GATC	2	8	9111	9118	25 %	25 %	25 %	25 %	528838750
21	NC_021912	CAAT	2	8	9164	9171	50 %	25 %	0 %	25 %	528838750
22	NC_021912	TTTC	2	8	9417	9424	0 %	75 %	0 %	25 %	528838751
23	NC_021912	TGCC	2	8	9485	9492	0 %	25 %	25 %	50 %	528838751
24	NC_021912	TTAG	2	8	10473	10480	25 %	50 %	25 %	0 %	528838752
25	NC_021912	TTTC	2	8	11156	11163	0 %	75 %	0 %	25 %	528838752
26	NC_021912	CTTC	2	8	11419	11426	0 %	50 %	0 %	50 %	528838752
27	NC_021912	GTAA	2	8	12008	12015	50 %	25 %	25 %	0 %	528838752
28	NC_021912	TTTA	2	8	12300	12307	25 %	75 %	0 %	0 %	528838752
29	NC_021912	ATTT	2	8	12888	12895	25 %	75 %	0 %	0 %	528838753
30	NC_021912	AAAC	2	8	12993	13000	75 %	0 %	0 %	25 %	528838753
31	NC_021912	TGAC	2	8	13062	13069	25 %	25 %	25 %	25 %	528838753
32	NC_021912	ATTC	2	8	13071	13078	25 %	50 %	0 %	25 %	528838753
33	NC_021912	TTGA	2	8	13103	13110	25 %	50 %	25 %	0 %	528838753
34	NC_021912	CTTG	2	8	13657	13664	0 %	50 %	25 %	25 %	528838754
35	NC_021912	TTTA	2	8	13688	13695	25 %	75 %	0 %	0 %	528838754
36	NC_021912	TGAT	2	8	13755	13762	25 %	50 %	25 %	0 %	528838754
37	NC_021912	CTGG	2	8	14245	14252	0 %	25 %	50 %	25 %	528838754
38	NC_021912	TGGC	2	8	14691	14698	0 %	25 %	50 %	25 %	528838754
39	NC_021912	CATT	2	8	15076	15083	25 %	50 %	0 %	25 %	528838755
40	NC_021912	ATAA	2	8	15521	15528	75 %	25 %	0 %	0 %	528838756
41	NC_021912	CGTT	2	8	15997	16004	0 %	50 %	25 %	25 %	528838756
42	NC_021912	TTAA	2	8	16222	16229	50 %	50 %	0 %	0 %	528838756
43	NC_021912	CTTT	2	8	16452	16459	0 %	75 %	0 %	25 %	528838756
44	NC_021912	CAAC	2	8	16631	16638	50 %	0 %	0 %	50 %	528838756
45	NC_021912	TTCT	2	8	16866	16873	0 %	75 %	0 %	25 %	528838756
46	NC_021912	TCTT	2	8	16945	16952	0 %	75 %	0 %	25 %	528838756
47	NC_021912	GATC	2	8	17034	17041	25 %	25 %	25 %	25 %	528838756
48	NC_021912	CCTT	2	8	17062	17069	0 %	50 %	0 %	50 %	528838756
49	NC_021912	CTTT	2	8	17184	17191	0 %	75 %	0 %	25 %	528838757
50	NC_021912	AATT	2	8	18107	18114	50 %	50 %	0 %	0 %	528838760
51	NC_021912	AACC	2	8	18293	18300	50 %	0 %	0 %	50 %	528838760
52	NC_021912	ATTG	2	8	19946	19953	25 %	50 %	25 %	0 %	528838764
53	NC_021912	CGGC	2	8	20594	20601	0 %	0 %	50 %	50 %	528838766
54	NC_021912	TCTG	2	8	21154	21161	0 %	50 %	25 %	25 %	528838767
55	NC_021912	TAAA	2	8	22139	22146	75 %	25 %	0 %	0 %	528838769
56	NC_021912	CAAA	2	8	22227	22234	75 %	0 %	0 %	25 %	528838769
57	NC_021912	GACC	2	8	22378	22385	25 %	0 %	25 %	50 %	528838769
58	NC_021912	TAAA	2	8	23514	23521	75 %	25 %	0 %	0 %	528838771
59	NC_021912	AAGT	2	8	24179	24186	50 %	25 %	25 %	0 %	528838772
60	NC_021912	TTCA	2	8	24670	24677	25 %	50 %	0 %	25 %	528838773
61	NC_021912	GCCA	2	8	25470	25477	25 %	0 %	25 %	50 %	528838774
62	NC_021912	ACTA	2	8	25705	25712	50 %	25 %	0 %	25 %	528838774
63	NC_021912	AAAC	2	8	26206	26213	75 %	0 %	0 %	25 %	528838775
64	NC_021912	ATTG	2	8	26758	26765	25 %	50 %	25 %	0 %	528838776
65	NC_021912	TTTC	2	8	27216	27223	0 %	75 %	0 %	25 %	528838776
66	NC_021912	TATC	2	8	28306	28313	25 %	50 %	0 %	25 %	528838777
67	NC_021912	ATAA	2	8	28887	28894	75 %	25 %	0 %	0 %	528838777
68	NC_021912	CCAA	2	8	30233	30240	50 %	0 %	0 %	50 %	528838778
69	NC_021912	AATT	2	8	31622	31629	50 %	50 %	0 %	0 %	528838780
70	NC_021912	TTTG	2	8	31754	31761	0 %	75 %	25 %	0 %	528838780
71	NC_021912	TGAT	2	8	31912	31919	25 %	50 %	25 %	0 %	528838780
72	NC_021912	TTTC	2	8	32592	32599	0 %	75 %	0 %	25 %	528838780
73	NC_021912	AAAG	2	8	34176	34183	75 %	0 %	25 %	0 %	528838782
74	NC_021912	ACAA	2	8	34269	34276	75 %	0 %	0 %	25 %	528838782
75	NC_021912	TAAC	2	8	34429	34436	50 %	25 %	0 %	25 %	528838782
76	NC_021912	CAAA	2	8	35016	35023	75 %	0 %	0 %	25 %	528838782
77	NC_021912	TAAT	2	8	35580	35587	50 %	50 %	0 %	0 %	528838783
78	NC_021912	AAAT	2	8	35882	35889	75 %	25 %	0 %	0 %	528838783
79	NC_021912	CAAA	2	8	36466	36473	75 %	0 %	0 %	25 %	528838783
80	NC_021912	TAAG	2	8	36844	36851	50 %	25 %	25 %	0 %	528838784
81	NC_021912	GAGC	2	8	36892	36899	25 %	0 %	50 %	25 %	528838784
82	NC_021912	TCAA	2	8	36954	36961	50 %	25 %	0 %	25 %	528838784
83	NC_021912	TTGA	2	8	37102	37109	25 %	50 %	25 %	0 %	528838784
84	NC_021912	TCAA	2	8	37358	37365	50 %	25 %	0 %	25 %	528838785
85	NC_021912	TAAT	2	8	37838	37845	50 %	50 %	0 %	0 %	528838786
86	NC_021912	AAAT	2	8	37882	37889	75 %	25 %	0 %	0 %	528838786
87	NC_021912	AATT	2	8	37962	37969	50 %	50 %	0 %	0 %	528838786
88	NC_021912	GAAA	2	8	38465	38472	75 %	0 %	25 %	0 %	528838786
89	NC_021912	AGGA	2	8	39479	39486	50 %	0 %	50 %	0 %	528838788
90	NC_021912	AACC	2	8	39775	39782	50 %	0 %	0 %	50 %	528838788
91	NC_021912	CATC	2	8	40687	40694	25 %	25 %	0 %	50 %	528838789
92	NC_021912	AAGA	2	8	40886	40893	75 %	0 %	25 %	0 %	528838789
93	NC_021912	CTTT	2	8	40903	40910	0 %	75 %	0 %	25 %	528838789
94	NC_021912	CCAC	2	8	41172	41179	25 %	0 %	0 %	75 %	528838789
95	NC_021912	CCAG	2	8	41260	41267	25 %	0 %	25 %	50 %	528838789
96	NC_021912	CATA	2	8	41289	41296	50 %	25 %	0 %	25 %	528838789
97	NC_021912	AATT	2	8	41326	41333	50 %	50 %	0 %	0 %	528838789

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.