MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021912	AGG	2	6	36	41	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021912	TGC	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021912	GAA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021912	ATC	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021912	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021912	TTC	2	6	517	522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021912	TTG	2	6	523	528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021912	TGT	2	6	620	625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021912	GTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021912	ATC	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021912	GTA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021912	ATC	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021912	TGG	2	6	3605	3610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021912	CTA	2	6	3837	3842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021912	GAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021912	AAG	2	6	3954	3959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021912	GAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021912	ATT	2	6	4185	4190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021912	TTA	2	6	4234	4239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021912	ATA	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021912	TCT	2	6	4670	4675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021912	CTC	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021912	AGG	2	6	4980	4985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021912	CAT	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021912	CAA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021912	ACA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021912	ATA	2	6	5216	5221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021912	TAA	2	6	5265	5270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021912	GTA	2	6	5327	5332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021912	AAT	2	6	5379	5384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021912	TAA	2	6	5422	5427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021912	CGT	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021912	ATT	2	6	6272	6277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021912	ATA	2	6	6849	6854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021912	TGC	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021912	GAG	2	6	6890	6895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021912	ACT	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021912	TAA	2	6	6923	6928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021912	TCA	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021912	ACC	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021912	AGC	2	6	7032	7037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021912	TTA	2	6	7099	7104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021912	TAA	2	6	7105	7110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021912	ATT	2	6	7143	7148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021912	GTT	2	6	7210	7215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021912	ACT	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021912	ATT	2	6	9294	9299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021912	GAA	2	6	9335	9340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021912	CAT	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021912	AAG	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021912	ATA	2	6	10094	10099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021912	ATA	2	6	10109	10114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021912	GAG	2	6	10175	10180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021912	TCC	2	6	12323	12328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021912	TAA	2	6	12356	12361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021912	ATT	2	6	12378	12383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021912	TAT	2	6	12424	12429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021912	TCA	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021912	TCT	2	6	17310	17315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021912	ATT	2	6	17411	17416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021912	TAT	2	6	18382	18387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021912	GTC	2	6	18957	18962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021912	CAG	2	6	19042	19047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021912	GAT	2	6	20486	20491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021912	TCA	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021912	GGC	2	6	20869	20874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021912	AAC	2	6	20907	20912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021912	ATT	2	6	20918	20923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021912	GAG	2	6	20948	20953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021912	ATC	2	6	21287	21292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021912	TCG	2	6	21450	21455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021912	ACC	2	6	21499	21504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021912	CTA	2	6	21536	21541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021912	TAG	2	6	21552	21557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021912	ACC	2	6	21629	21634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021912	CAC	2	6	21663	21668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021912	TTG	2	6	21687	21692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021912	TAA	2	6	22032	22037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021912	GGA	2	6	22048	22053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021912	TAA	2	6	23107	23112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021912	AAT	2	6	23205	23210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021912	ACA	2	6	23224	23229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021912	TTA	2	6	23306	23311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021912	ATA	2	6	23497	23502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021912	CCT	2	6	24687	24692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021912	ATT	3	9	27855	27863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021912	AAT	3	9	27871	27879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021912	CTT	2	6	28045	28050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021912	AGA	2	6	29272	29277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021912	TGT	2	6	29306	29311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021912	ATT	2	6	29480	29485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021912	AAT	2	6	29567	29572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021912	TAT	2	6	29600	29605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021912	TAA	2	6	30343	30348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021912	CTA	2	6	30394	30399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021912	CGA	2	6	30593	30598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021912	GAC	2	6	30711	30716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021912	TAG	2	6	30778	30783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021912	CTA	2	6	30814	30819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021912	AAT	2	6	30910	30915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021912	ATC	2	6	31031	31036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021912	TCA	2	6	31096	31101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021912	CTG	2	6	31216	31221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021912	AAG	2	6	31451	31456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021912	CAT	2	6	31516	31521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021912	CTT	2	6	31584	31589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021912	CCT	2	6	32859	32864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021912	ATT	2	6	32903	32908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021912	TTC	2	6	32943	32948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021912	GAC	2	6	32990	32995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021912	CTT	2	6	33010	33015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021912	CAC	2	6	33030	33035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021912	TTA	2	6	33338	33343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021912	ATT	2	6	33461	33466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021912	TCC	2	6	35200	35205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021912	TAG	2	6	35267	35272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021912	CCT	2	6	36476	36481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021912	ATA	2	6	36574	36579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021912	TCT	2	6	36737	36742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021912	TAT	2	6	36796	36801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021912	TAG	2	6	37677	37682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021912	TAT	2	6	38662	38667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021912	CTT	2	6	39352	39357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021912	ACT	2	6	39390	39395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021912	TAT	2	6	40285	40290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021912	ATC	2	6	41450	41455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.