MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ103

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021912	T	8	8	331	338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021912	T	6	6	2230	2235	0 %	100 %	0 %	0 %	528838744
3	NC_021912	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021912	A	7	7	3865	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021912	T	6	6	4069	4074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021912	T	9	9	4816	4824	0 %	100 %	0 %	0 %	528838747
7	NC_021912	T	8	8	4839	4846	0 %	100 %	0 %	0 %	528838747
8	NC_021912	T	6	6	5953	5958	0 %	100 %	0 %	0 %	528838748
9	NC_021912	A	6	6	6107	6112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021912	A	6	6	6177	6182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021912	A	6	6	6287	6292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021912	A	6	6	8043	8048	100 %	0 %	0 %	0 %	528838750
13	NC_021912	T	6	6	8162	8167	0 %	100 %	0 %	0 %	528838750
14	NC_021912	T	6	6	8245	8250	0 %	100 %	0 %	0 %	528838750
15	NC_021912	T	7	7	8883	8889	0 %	100 %	0 %	0 %	528838750
16	NC_021912	T	6	6	8992	8997	0 %	100 %	0 %	0 %	528838750
17	NC_021912	A	6	6	9098	9103	100 %	0 %	0 %	0 %	528838750
18	NC_021912	T	6	6	9845	9850	0 %	100 %	0 %	0 %	528838751
19	NC_021912	A	6	6	10046	10051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021912	A	6	6	10420	10425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021912	T	6	6	10436	10441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021912	A	6	6	12389	12394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021912	A	6	6	13391	13396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021912	T	6	6	13541	13546	0 %	100 %	0 %	0 %	528838754
25	NC_021912	T	7	7	13989	13995	0 %	100 %	0 %	0 %	528838754
26	NC_021912	T	6	6	14502	14507	0 %	100 %	0 %	0 %	528838754
27	NC_021912	T	7	7	16106	16112	0 %	100 %	0 %	0 %	528838756
28	NC_021912	T	7	7	16152	16158	0 %	100 %	0 %	0 %	528838756
29	NC_021912	T	6	6	16326	16331	0 %	100 %	0 %	0 %	528838756
30	NC_021912	T	7	7	16552	16558	0 %	100 %	0 %	0 %	528838756
31	NC_021912	T	6	6	17002	17007	0 %	100 %	0 %	0 %	528838756
32	NC_021912	A	6	6	17493	17498	100 %	0 %	0 %	0 %	528838758
33	NC_021912	A	7	7	17508	17514	100 %	0 %	0 %	0 %	528838758
34	NC_021912	A	6	6	17722	17727	100 %	0 %	0 %	0 %	528838759
35	NC_021912	A	6	6	17927	17932	100 %	0 %	0 %	0 %	528838759
36	NC_021912	T	6	6	17978	17983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021912	A	6	6	18327	18332	100 %	0 %	0 %	0 %	528838760
38	NC_021912	A	6	6	18923	18928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021912	A	6	6	19026	19031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021912	T	6	6	20105	20110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021912	A	6	6	20806	20811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021912	T	6	6	20837	20842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021912	A	6	6	20975	20980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021912	A	6	6	21055	21060	100 %	0 %	0 %	0 %	528838767
45	NC_021912	T	6	6	21097	21102	0 %	100 %	0 %	0 %	528838767
46	NC_021912	A	6	6	21541	21546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021912	T	6	6	21819	21824	0 %	100 %	0 %	0 %	528838768
48	NC_021912	T	7	7	21855	21861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021912	A	6	6	22208	22213	100 %	0 %	0 %	0 %	528838769
50	NC_021912	A	7	7	22232	22238	100 %	0 %	0 %	0 %	528838769
51	NC_021912	A	6	6	22630	22635	100 %	0 %	0 %	0 %	528838769
52	NC_021912	A	6	6	22931	22936	100 %	0 %	0 %	0 %	528838770
53	NC_021912	A	6	6	23196	23201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021912	A	6	6	23351	23356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021912	A	7	7	24815	24821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021912	T	6	6	24872	24877	0 %	100 %	0 %	0 %	528838774
57	NC_021912	T	7	7	25176	25182	0 %	100 %	0 %	0 %	528838774
58	NC_021912	A	6	6	26180	26185	100 %	0 %	0 %	0 %	528838775
59	NC_021912	A	6	6	26552	26557	100 %	0 %	0 %	0 %	528838775
60	NC_021912	T	6	6	27183	27188	0 %	100 %	0 %	0 %	528838776
61	NC_021912	T	7	7	27754	27760	0 %	100 %	0 %	0 %	528838776
62	NC_021912	T	6	6	27953	27958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021912	T	7	7	28093	28099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021912	T	7	7	28131	28137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021912	A	7	7	28175	28181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021912	T	6	6	29199	29204	0 %	100 %	0 %	0 %	528838777
67	NC_021912	T	6	6	30388	30393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021912	C	6	6	30428	30433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_021912	A	6	6	31285	31290	100 %	0 %	0 %	0 %	528838779
70	NC_021912	T	6	6	31772	31777	0 %	100 %	0 %	0 %	528838780
71	NC_021912	A	6	6	33285	33290	100 %	0 %	0 %	0 %	528838781
72	NC_021912	T	7	7	33636	33642	0 %	100 %	0 %	0 %	528838782
73	NC_021912	A	6	6	34087	34092	100 %	0 %	0 %	0 %	528838782
74	NC_021912	A	6	6	35731	35736	100 %	0 %	0 %	0 %	528838783
75	NC_021912	A	6	6	35915	35920	100 %	0 %	0 %	0 %	528838783
76	NC_021912	T	6	6	36232	36237	0 %	100 %	0 %	0 %	528838783
77	NC_021912	A	6	6	36300	36305	100 %	0 %	0 %	0 %	528838783
78	NC_021912	A	6	6	36487	36492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021912	T	8	8	37281	37288	0 %	100 %	0 %	0 %	528838785
80	NC_021912	T	6	6	37693	37698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021912	T	6	6	37976	37981	0 %	100 %	0 %	0 %	528838786
82	NC_021912	A	6	6	38616	38621	100 %	0 %	0 %	0 %	528838786
83	NC_021912	A	6	6	38684	38689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021912	T	6	6	39199	39204	0 %	100 %	0 %	0 %	528838787
85	NC_021912	T	6	6	39273	39278	0 %	100 %	0 %	0 %	528838787
86	NC_021912	T	6	6	40363	40368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021912	T	6	6	40708	40713	0 %	100 %	0 %	0 %	528838789
88	NC_021912	A	6	6	40856	40861	100 %	0 %	0 %	0 %	528838789
89	NC_021912	T	6	6	41388	41393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.