MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 2857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021911	GTTC	2	8	40	47	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021911	CGGG	2	8	58	65	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021911	CGAC	2	8	148	155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021911	CCGG	2	8	367	374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021911	TCAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021911	GCCG	2	8	688	695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021911	GTCG	2	8	1482	1489	0 %	25 %	50 %	25 %	528837522
8	NC_021911	CGGG	2	8	2773	2780	0 %	0 %	75 %	25 %	528837524
9	NC_021911	CAGA	2	8	3535	3542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021911	CCGG	2	8	4570	4577	0 %	0 %	50 %	50 %	528837525
11	NC_021911	GGCG	2	8	4589	4596	0 %	0 %	75 %	25 %	528837525
12	NC_021911	CGTG	2	8	4756	4763	0 %	25 %	50 %	25 %	528837525
13	NC_021911	TCGC	2	8	5140	5147	0 %	25 %	25 %	50 %	528837525
14	NC_021911	CATT	2	8	5269	5276	25 %	50 %	0 %	25 %	528837525
15	NC_021911	ACGA	2	8	5485	5492	50 %	0 %	25 %	25 %	528837525
16	NC_021911	AAGG	2	8	5545	5552	50 %	0 %	50 %	0 %	528837525
17	NC_021911	CGAC	2	8	6012	6019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021911	CGGC	2	8	6201	6208	0 %	0 %	50 %	50 %	528837526
19	NC_021911	GGTC	2	8	6291	6298	0 %	25 %	50 %	25 %	528837526
20	NC_021911	GGCG	2	8	6669	6676	0 %	0 %	75 %	25 %	528837526
21	NC_021911	CGGC	2	8	7513	7520	0 %	0 %	50 %	50 %	528837527
22	NC_021911	CTCG	2	8	8603	8610	0 %	25 %	25 %	50 %	528837530
23	NC_021911	AGAA	2	8	9272	9279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021911	CCCG	2	8	9761	9768	0 %	0 %	25 %	75 %	528837531
25	NC_021911	GACG	2	8	10569	10576	25 %	0 %	50 %	25 %	528837532
26	NC_021911	GCCG	2	8	11058	11065	0 %	0 %	50 %	50 %	528837533
27	NC_021911	CGGC	2	8	11634	11641	0 %	0 %	50 %	50 %	528837533
28	NC_021911	CCCA	2	8	12887	12894	25 %	0 %	0 %	75 %	528837535
29	NC_021911	GGGC	2	8	12918	12925	0 %	0 %	75 %	25 %	528837535
30	NC_021911	CGAT	2	8	13098	13105	25 %	25 %	25 %	25 %	528837535
31	NC_021911	TCGG	2	8	13323	13330	0 %	25 %	50 %	25 %	528837535
32	NC_021911	GACG	2	8	13486	13493	25 %	0 %	50 %	25 %	528837535
33	NC_021911	CGGC	2	8	13856	13863	0 %	0 %	50 %	50 %	528837536
34	NC_021911	GGCA	2	8	14363	14370	25 %	0 %	50 %	25 %	528837536
35	NC_021911	GCCT	2	8	14394	14401	0 %	25 %	25 %	50 %	528837536
36	NC_021911	GCCG	2	8	15059	15066	0 %	0 %	50 %	50 %	528837537
37	NC_021911	GCGA	2	8	15075	15082	25 %	0 %	50 %	25 %	528837537
38	NC_021911	TCGC	2	8	15109	15116	0 %	25 %	25 %	50 %	528837537
39	NC_021911	CGAT	2	8	15387	15394	25 %	25 %	25 %	25 %	528837537
40	NC_021911	GATC	2	8	15452	15459	25 %	25 %	25 %	25 %	528837537
41	NC_021911	GGAA	2	8	15945	15952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021911	TGGA	2	8	15995	16002	25 %	25 %	50 %	0 %	528837538
43	NC_021911	GCCG	2	8	16072	16079	0 %	0 %	50 %	50 %	528837538
44	NC_021911	CATC	2	8	16099	16106	25 %	25 %	0 %	50 %	528837538
45	NC_021911	GATC	2	8	16191	16198	25 %	25 %	25 %	25 %	528837538
46	NC_021911	CCTT	2	8	17054	17061	0 %	50 %	0 %	50 %	528837539
47	NC_021911	CGGC	2	8	17127	17134	0 %	0 %	50 %	50 %	528837539
48	NC_021911	CGCC	2	8	17331	17338	0 %	0 %	25 %	75 %	528837539
49	NC_021911	CACC	2	8	17871	17878	25 %	0 %	0 %	75 %	528837540
50	NC_021911	CGGC	2	8	18260	18267	0 %	0 %	50 %	50 %	528837541
51	NC_021911	CCGC	2	8	18524	18531	0 %	0 %	25 %	75 %	528837541
52	NC_021911	TCCG	2	8	19138	19145	0 %	25 %	25 %	50 %	528837541
53	NC_021911	GCAA	2	8	20778	20785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021911	GCGA	2	8	21412	21419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021911	CGTG	2	8	21557	21564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021911	CGCT	2	8	22481	22488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021911	CGTT	2	8	22508	22515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021911	GAGG	2	8	22912	22919	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021911	GCCG	2	8	23020	23027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021911	TCAA	2	8	24369	24376	50 %	25 %	0 %	25 %	528837545
61	NC_021911	ATTC	2	8	24953	24960	25 %	50 %	0 %	25 %	528837546
62	NC_021911	AAGC	2	8	25462	25469	50 %	0 %	25 %	25 %	528837547
63	NC_021911	CCGC	2	8	25618	25625	0 %	0 %	25 %	75 %	528837548
64	NC_021911	GGCT	2	8	25838	25845	0 %	25 %	50 %	25 %	528837548
65	NC_021911	AGCC	2	8	25872	25879	25 %	0 %	25 %	50 %	528837548
66	NC_021911	CAGC	2	8	25895	25902	25 %	0 %	25 %	50 %	528837548
67	NC_021911	GCTT	2	8	26330	26337	0 %	50 %	25 %	25 %	528837548
68	NC_021911	CCGA	2	8	26644	26651	25 %	0 %	25 %	50 %	528837549
69	NC_021911	CGAT	2	8	27208	27215	25 %	25 %	25 %	25 %	528837549
70	NC_021911	CTCG	2	8	27566	27573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021911	AACT	2	8	27612	27619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021911	GAGC	2	8	28168	28175	25 %	0 %	50 %	25 %	528837550
73	NC_021911	GCCC	2	8	28297	28304	0 %	0 %	25 %	75 %	528837550
74	NC_021911	ATTG	2	8	28918	28925	25 %	50 %	25 %	0 %	528837552
75	NC_021911	GCCT	2	8	29085	29092	0 %	25 %	25 %	50 %	528837552
76	NC_021911	TTGC	2	8	29207	29214	0 %	50 %	25 %	25 %	528837552
77	NC_021911	TGCT	2	8	29311	29318	0 %	50 %	25 %	25 %	528837552
78	NC_021911	GAAG	2	8	29603	29610	50 %	0 %	50 %	0 %	528837552
79	NC_021911	TCCG	2	8	30710	30717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021911	AGCG	2	8	31122	31129	25 %	0 %	50 %	25 %	528837554
81	NC_021911	CGCC	2	8	31643	31650	0 %	0 %	25 %	75 %	528837555
82	NC_021911	CGAG	2	8	31655	31662	25 %	0 %	50 %	25 %	528837555
83	NC_021911	GCAG	2	8	32061	32068	25 %	0 %	50 %	25 %	528837555
84	NC_021911	CGGG	2	8	32606	32613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021911	CGGA	2	8	33132	33139	25 %	0 %	50 %	25 %	528837556
86	NC_021911	CGCC	2	8	33469	33476	0 %	0 %	25 %	75 %	528837556
87	NC_021911	AGCG	2	8	33839	33846	25 %	0 %	50 %	25 %	528837556
88	NC_021911	ATCG	2	8	34483	34490	25 %	25 %	25 %	25 %	528837557
89	NC_021911	CATC	2	8	34677	34684	25 %	25 %	0 %	50 %	528837557
90	NC_021911	GGAA	2	8	35037	35044	50 %	0 %	50 %	0 %	528837557
91	NC_021911	GCAT	2	8	35435	35442	25 %	25 %	25 %	25 %	528837557
92	NC_021911	CGCC	2	8	35694	35701	0 %	0 %	25 %	75 %	528837558
93	NC_021911	TGCC	2	8	37121	37128	0 %	25 %	25 %	50 %	528837559
94	NC_021911	CGCC	2	8	37230	37237	0 %	0 %	25 %	75 %	528837559
95	NC_021911	CGAC	2	8	37794	37801	25 %	0 %	25 %	50 %	528837559
96	NC_021911	CAGC	2	8	38717	38724	25 %	0 %	25 %	50 %	528837560
97	NC_021911	CTTC	2	8	38898	38905	0 %	50 %	0 %	50 %	528837561
98	NC_021911	CGGC	2	8	39062	39069	0 %	0 %	50 %	50 %	528837561
99	NC_021911	CGAC	2	8	39207	39214	25 %	0 %	25 %	50 %	528837561
100	NC_021911	AGGA	2	8	39425	39432	50 %	0 %	50 %	0 %	528837561
101	NC_021911	TGTT	2	8	39548	39555	0 %	75 %	25 %	0 %	528837561
102	NC_021911	AGGG	2	8	39832	39839	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021911	CGGC	2	8	40051	40058	0 %	0 %	50 %	50 %	528837562
104	NC_021911	GCCG	2	8	40457	40464	0 %	0 %	50 %	50 %	528837562
105	NC_021911	CCTT	2	8	42379	42386	0 %	50 %	0 %	50 %	528837565
106	NC_021911	CGAG	2	8	42663	42670	25 %	0 %	50 %	25 %	528837565
107	NC_021911	GCAA	2	8	42811	42818	50 %	0 %	25 %	25 %	528837565
108	NC_021911	CATC	2	8	42866	42873	25 %	25 %	0 %	50 %	528837565
109	NC_021911	CGAG	2	8	43112	43119	25 %	0 %	50 %	25 %	528837565
110	NC_021911	TCCA	2	8	43153	43160	25 %	25 %	0 %	50 %	528837565
111	NC_021911	TCCA	2	8	43341	43348	25 %	25 %	0 %	50 %	528837565
112	NC_021911	GCCC	2	8	43576	43583	0 %	0 %	25 %	75 %	528837566
113	NC_021911	CGGC	2	8	44177	44184	0 %	0 %	50 %	50 %	528837566
114	NC_021911	CGGC	3	12	44931	44942	0 %	0 %	50 %	50 %	528837567
115	NC_021911	TCGC	2	8	44962	44969	0 %	25 %	25 %	50 %	528837567
116	NC_021911	CGGG	2	8	45219	45226	0 %	0 %	75 %	25 %	528837567
117	NC_021911	CCCA	2	8	45981	45988	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_021911	GCCG	2	8	46458	46465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021911	CGCT	2	8	46667	46674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021911	GGCG	2	8	46848	46855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021911	ACCG	2	8	47155	47162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021911	TCGG	2	8	47467	47474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021911	CGGC	2	8	47490	47497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021911	ACAG	2	8	47569	47576	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021911	GGCC	2	8	47862	47869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021911	GCCG	2	8	48561	48568	0 %	0 %	50 %	50 %	528837569
127	NC_021911	CCTG	2	8	48680	48687	0 %	25 %	25 %	50 %	528837569
128	NC_021911	TCGG	2	8	48990	48997	0 %	25 %	50 %	25 %	528837569
129	NC_021911	GCAG	2	8	49139	49146	25 %	0 %	50 %	25 %	528837570
130	NC_021911	ACCT	2	8	49596	49603	25 %	25 %	0 %	50 %	528837570
131	NC_021911	CGGC	2	8	49711	49718	0 %	0 %	50 %	50 %	528837570
132	NC_021911	AACC	2	8	49844	49851	50 %	0 %	0 %	50 %	528837570
133	NC_021911	CGCC	3	12	50201	50212	0 %	0 %	25 %	75 %	528837570
134	NC_021911	TCCG	2	8	50477	50484	0 %	25 %	25 %	50 %	528837571
135	NC_021911	GCCG	2	8	50545	50552	0 %	0 %	50 %	50 %	528837571
136	NC_021911	ACCA	2	8	50612	50619	50 %	0 %	0 %	50 %	528837571
137	NC_021911	GGGC	2	8	51220	51227	0 %	0 %	75 %	25 %	528837571
138	NC_021911	CCGA	2	8	52106	52113	25 %	0 %	25 %	50 %	528837572
139	NC_021911	CTCC	2	8	52294	52301	0 %	25 %	0 %	75 %	528837573
140	NC_021911	CCGC	2	8	52640	52647	0 %	0 %	25 %	75 %	528837573
141	NC_021911	TCTT	2	8	52801	52808	0 %	75 %	0 %	25 %	528837573
142	NC_021911	AAGG	2	8	53679	53686	50 %	0 %	50 %	0 %	528837573
143	NC_021911	GGGC	2	8	53887	53894	0 %	0 %	75 %	25 %	528837573
144	NC_021911	CCTC	2	8	55055	55062	0 %	25 %	0 %	75 %	528837576
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278	NC_021911	CCGG	2	8	109231	109238	0 %	0 %	50 %	50 %	528837633
279	NC_021911	GTTG	2	8	109321	109328	0 %	50 %	50 %	0 %	528837633
280	NC_021911	CAGA	2	8	109773	109780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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