MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021911	CG	3	6	251	256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021911	GA	3	6	3495	3500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021911	TC	3	6	5934	5939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021911	CT	3	6	6940	6945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021911	CG	3	6	9266	9271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021911	CA	3	6	11684	11689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021911	GC	4	8	15710	15717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021911	GA	3	6	16688	16693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021911	CG	4	8	20912	20919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021911	GC	4	8	20972	20979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021911	CG	5	10	21356	21365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021911	GC	3	6	21641	21646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021911	CG	3	6	21738	21743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021911	GC	3	6	21805	21810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021911	CT	3	6	22005	22010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021911	CG	3	6	22061	22066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021911	GC	3	6	46652	46657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021911	CG	3	6	47395	47400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021911	GC	3	6	48120	48125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021911	GC	3	6	48195	48200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021911	GA	3	6	54850	54855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021911	AT	3	6	64129	64134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021911	TC	3	6	67049	67054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021911	GC	3	6	67478	67483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021911	AG	3	6	68287	68292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021911	CT	3	6	69331	69336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021911	GC	3	6	72571	72576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021911	GC	4	8	82592	82599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021911	CG	3	6	84771	84776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021911	CG	3	6	87556	87561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021911	AT	3	6	91463	91468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021911	CG	3	6	102214	102219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021911	TC	3	6	107771	107776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021911	AC	3	6	114455	114460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021911	AG	3	6	115173	115178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021911	GC	3	6	115180	115185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021911	TC	3	6	121113	121118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021911	CT	3	6	133750	133755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021911	CT	3	6	134398	134403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021911	GC	3	6	148190	148195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021911	GA	3	6	149956	149961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021911	TC	3	6	150341	150346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021911	CG	3	6	155856	155861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021911	GC	3	6	169264	169269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021911	TC	3	6	181413	181418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021911	GC	3	6	181425	181430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021911	GT	3	6	181504	181509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021911	CA	3	6	183123	183128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021911	CG	3	6	183494	183499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021911	CG	3	6	184086	184091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021911	GC	4	8	184752	184759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021911	GC	3	6	185119	185124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021911	GA	3	6	185294	185299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021911	TG	3	6	185699	185704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021911	CG	3	6	192298	192303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021911	GC	3	6	192380	192385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021911	GC	4	8	197600	197607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021911	AG	3	6	199185	199190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021911	GC	3	6	199552	199557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021911	GC	3	6	201093	201098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021911	CG	4	8	201699	201706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021911	CA	3	6	203706	203711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021911	AG	3	6	203771	203776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021911	TC	3	6	204047	204052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021911	GA	3	6	204971	204976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021911	GA	3	6	205585	205590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021911	TG	3	6	210650	210655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021911	CG	3	6	214575	214580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021911	CG	4	8	221604	221611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021911	GC	3	6	222371	222376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021911	CG	3	6	222669	222674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021911	GC	3	6	222726	222731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021911	GC	3	6	225053	225058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021911	GT	3	6	228626	228631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021911	CG	3	6	240631	240636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021911	GC	3	6	246325	246330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021911	CT	3	6	246428	246433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021911	GC	3	6	246511	246516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021911	CG	3	6	246573	246578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021911	AT	3	6	248179	248184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021911	CG	3	6	248508	248513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021911	GA	3	6	249618	249623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021911	CG	3	6	252154	252159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021911	GA	3	6	252314	252319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021911	GC	3	6	273494	273499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021911	CG	3	6	275213	275218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021911	GC	3	6	277277	277282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021911	TC	3	6	278201	278206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021911	GA	3	6	278550	278555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021911	CG	3	6	279281	279286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021911	GA	3	6	282600	282605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021911	CG	3	6	282724	282729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021911	AC	3	6	283926	283931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021911	CG	3	6	284553	284558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021911	AG	3	6	287288	287293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021911	AT	3	6	309235	309240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021911	AG	3	6	309282	309287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021911	CG	3	6	311387	311392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021911	CG	3	6	311603	311608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021911	GA	3	6	325922	325927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021911	GA	3	6	327598	327603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021911	GC	3	6	327740	327745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021911	TC	3	6	329869	329874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021911	GC	3	6	347511	347516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021911	GT	3	6	347554	347559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021911	CG	3	6	356595	356600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021911	TA	3	6	358466	358471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021911	GC	3	6	367182	367187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021911	AT	3	6	376602	376607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021911	GA	3	6	384939	384944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021911	GC	3	6	390933	390938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021911	CA	3	6	392310	392315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021911	CG	3	6	404466	404471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021911	GA	3	6	406441	406446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021911	CG	3	6	409744	409749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021911	AG	3	6	409782	409787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021911	GC	3	6	413087	413092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021911	CG	3	6	413404	413409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021911	CG	3	6	417847	417852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021911	CG	3	6	417865	417870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021911	CG	3	6	425103	425108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021911	CT	3	6	428758	428763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021911	GC	3	6	437988	437993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021911	GC	3	6	451060	451065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021911	GC	3	6	451088	451093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021911	CG	4	8	451094	451101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021911	CT	3	6	452558	452563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021911	GC	4	8	479623	479630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021911	GC	3	6	479651	479656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021911	GC	3	6	480432	480437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021911	TC	3	6	480446	480451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021911	TC	3	6	480506	480511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021911	TC	3	6	487685	487690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021911	TC	3	6	487707	487712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021911	CG	3	6	504230	504235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021911	CG	3	6	505844	505849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021911	GA	3	6	511174	511179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021911	CG	4	8	523901	523908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021911	GC	3	6	530557	530562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021911	AG	3	6	537477	537482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021911	GA	3	6	543601	543606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021911	TC	3	6	564012	564017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021911	CG	3	6	586127	586132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021911	GA	3	6	591692	591697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021911	GT	3	6	607576	607581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021911	GC	3	6	610763	610768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021911	CG	3	6	621627	621632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021911	CT	3	6	622795	622800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021911	GA	3	6	622866	622871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021911	CG	3	6	622916	622921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021911	TA	3	6	623555	623560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021911	CT	3	6	624516	624521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021911	CG	3	6	628318	628323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021911	CT	3	6	628387	628392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.