MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	GCCCA	2	10	135	144	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_021910	CTCTC	2	10	18115	18124	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_021910	CGCGC	2	10	44232	44241	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_021910	TAGCG	2	10	44262	44271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021910	CGGCG	2	10	51216	51225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021910	CGGGC	2	10	62456	62465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_021910	CCGGC	2	10	69719	69728	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_021910	AGAGG	2	10	93150	93159	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021910	CGTGT	2	10	107334	107343	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021910	GAGCA	2	10	115952	115961	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021910	GCAGC	2	10	123917	123926	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_021910	CGAAC	2	10	123960	123969	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_021910	CAGGG	2	10	125731	125740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021910	CCGAC	2	10	132469	132478	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_021910	CTCCC	2	10	137161	137170	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_021910	ACGTC	2	10	149212	149221	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021910	GCCCC	2	10	160344	160353	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_021910	CAGCC	2	10	163758	163767	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_021910	GCATC	2	10	165492	165501	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021910	TTAGT	2	10	165815	165824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021910	GAGAA	2	10	165877	165886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021910	CCCTG	2	10	171818	171827	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_021910	CGATC	2	10	174460	174469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_021910	CGGGC	2	10	177483	177492	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_021910	ACCGG	2	10	178111	178120	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021910	CAAGG	2	10	191249	191258	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021910	TGCGG	2	10	225546	225555	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021910	GTCGC	2	10	225736	225745	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_021910	ATGAA	2	10	235459	235468	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021910	CGTTC	2	10	235493	235502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_021910	GCCCC	2	10	238000	238009	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_021910	GACAA	2	10	238453	238462	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021910	TCTCT	2	10	240736	240745	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021910	CGGCG	2	10	265691	265700	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021910	AAAAG	2	10	268065	268074	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.