MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	GATC	2	8	590	597	25 %	25 %	25 %	25 %	528835311
2	NC_021910	TATT	2	8	1377	1384	25 %	75 %	0 %	0 %	528835312
3	NC_021910	GCCG	2	8	1613	1620	0 %	0 %	50 %	50 %	528835312
4	NC_021910	TTGG	2	8	2194	2201	0 %	50 %	50 %	0 %	528835313
5	NC_021910	CGAT	2	8	2442	2449	25 %	25 %	25 %	25 %	528835313
6	NC_021910	AAGC	2	8	2625	2632	50 %	0 %	25 %	25 %	528835313
7	NC_021910	CGGT	2	8	3173	3180	0 %	25 %	50 %	25 %	528835314
8	NC_021910	CGGA	2	8	3239	3246	25 %	0 %	50 %	25 %	528835315
9	NC_021910	ATCG	2	8	3784	3791	25 %	25 %	25 %	25 %	528835315
10	NC_021910	CAGC	2	8	3989	3996	25 %	0 %	25 %	50 %	528835315
11	NC_021910	GGCG	2	8	4847	4854	0 %	0 %	75 %	25 %	528835316
12	NC_021910	GCCG	2	8	6157	6164	0 %	0 %	50 %	50 %	528835317
13	NC_021910	GCGG	2	8	6529	6536	0 %	0 %	75 %	25 %	528835317
14	NC_021910	CGAC	2	8	8929	8936	25 %	0 %	25 %	50 %	528835321
15	NC_021910	TCGA	2	8	9312	9319	25 %	25 %	25 %	25 %	528835321
16	NC_021910	CGGG	2	8	9940	9947	0 %	0 %	75 %	25 %	528835321
17	NC_021910	AAGG	2	8	10952	10959	50 %	0 %	50 %	0 %	528835323
18	NC_021910	GTCG	2	8	11055	11062	0 %	25 %	50 %	25 %	528835323
19	NC_021910	GTGG	2	8	11232	11239	0 %	25 %	75 %	0 %	528835323
20	NC_021910	TGGC	2	8	11403	11410	0 %	25 %	50 %	25 %	528835324
21	NC_021910	ATGC	2	8	11524	11531	25 %	25 %	25 %	25 %	528835324
22	NC_021910	TGCC	2	8	12234	12241	0 %	25 %	25 %	50 %	528835325
23	NC_021910	AGCC	2	8	12444	12451	25 %	0 %	25 %	50 %	528835325
24	NC_021910	CTCC	2	8	13160	13167	0 %	25 %	0 %	75 %	528835325
25	NC_021910	CTGG	2	8	13241	13248	0 %	25 %	50 %	25 %	528835326
26	NC_021910	GCCT	2	8	13291	13298	0 %	25 %	25 %	50 %	528835326
27	NC_021910	CCCG	2	8	13722	13729	0 %	0 %	25 %	75 %	528835326
28	NC_021910	AGGC	2	8	13745	13752	25 %	0 %	50 %	25 %	528835326
29	NC_021910	TTTC	2	8	13823	13830	0 %	75 %	0 %	25 %	528835326
30	NC_021910	TGGC	2	8	13840	13847	0 %	25 %	50 %	25 %	528835326
31	NC_021910	GTGC	2	8	13998	14005	0 %	25 %	50 %	25 %	528835326
32	NC_021910	CTGC	2	8	14027	14034	0 %	25 %	25 %	50 %	528835326
33	NC_021910	TCGG	2	8	14116	14123	0 %	25 %	50 %	25 %	528835326
34	NC_021910	TCCT	2	8	14450	14457	0 %	50 %	0 %	50 %	528835327
35	NC_021910	GATG	2	8	14497	14504	25 %	25 %	50 %	0 %	528835327
36	NC_021910	ACGA	2	8	14696	14703	50 %	0 %	25 %	25 %	528835327
37	NC_021910	GTTG	2	8	14975	14982	0 %	50 %	50 %	0 %	528835327
38	NC_021910	GCCG	2	8	15020	15027	0 %	0 %	50 %	50 %	528835327
39	NC_021910	CTGC	2	8	16599	16606	0 %	25 %	25 %	50 %	528835329
40	NC_021910	AACG	2	8	16660	16667	50 %	0 %	25 %	25 %	528835329
41	NC_021910	CCCA	2	8	17129	17136	25 %	0 %	0 %	75 %	528835330
42	NC_021910	GCTG	2	8	18933	18940	0 %	25 %	50 %	25 %	528835331
43	NC_021910	CGCC	2	8	19599	19606	0 %	0 %	25 %	75 %	528835332
44	NC_021910	GATG	2	8	20917	20924	25 %	25 %	50 %	0 %	528835335
45	NC_021910	GCCA	2	8	21342	21349	25 %	0 %	25 %	50 %	528835335
46	NC_021910	CCGC	2	8	21420	21427	0 %	0 %	25 %	75 %	528835335
47	NC_021910	AACC	2	8	21507	21514	50 %	0 %	0 %	50 %	528835336
48	NC_021910	CGGC	2	8	21611	21618	0 %	0 %	50 %	50 %	528835336
49	NC_021910	GACG	2	8	21987	21994	25 %	0 %	50 %	25 %	528835336
50	NC_021910	TCGC	2	8	22529	22536	0 %	25 %	25 %	50 %	528835336
51	NC_021910	CCTT	2	8	23156	23163	0 %	50 %	0 %	50 %	528835336
52	NC_021910	TCCC	2	8	23248	23255	0 %	25 %	0 %	75 %	528835336
53	NC_021910	CAGG	2	8	23601	23608	25 %	0 %	50 %	25 %	528835336
54	NC_021910	GCCG	2	8	23750	23757	0 %	0 %	50 %	50 %	528835336
55	NC_021910	GAAG	2	8	24317	24324	50 %	0 %	50 %	0 %	528835338
56	NC_021910	CGTT	2	8	24676	24683	0 %	50 %	25 %	25 %	528835338
57	NC_021910	ACCC	2	8	24726	24733	25 %	0 %	0 %	75 %	528835338
58	NC_021910	GCCA	2	8	25229	25236	25 %	0 %	25 %	50 %	528835338
59	NC_021910	ATTG	2	8	25812	25819	25 %	50 %	25 %	0 %	528835339
60	NC_021910	CCTG	2	8	26066	26073	0 %	25 %	25 %	50 %	528835339
61	NC_021910	GGGC	2	8	26158	26165	0 %	0 %	75 %	25 %	528835339
62	NC_021910	TGGC	2	8	26175	26182	0 %	25 %	50 %	25 %	528835339
63	NC_021910	GTTC	2	8	26654	26661	0 %	50 %	25 %	25 %	528835339
64	NC_021910	TCGG	2	8	28216	28223	0 %	25 %	50 %	25 %	528835339
65	NC_021910	CGGC	2	8	28783	28790	0 %	0 %	50 %	50 %	528835341
66	NC_021910	TGGA	2	8	29936	29943	25 %	25 %	50 %	0 %	528835341
67	NC_021910	CGAA	2	8	30498	30505	50 %	0 %	25 %	25 %	528835342
68	NC_021910	GGAG	2	8	31310	31317	25 %	0 %	75 %	0 %	528835343
69	NC_021910	GGAA	2	8	31666	31673	50 %	0 %	50 %	0 %	528835343
70	NC_021910	CGAA	2	8	31759	31766	50 %	0 %	25 %	25 %	528835343
71	NC_021910	TGAT	2	8	31819	31826	25 %	50 %	25 %	0 %	528835343
72	NC_021910	CGAT	2	8	32082	32089	25 %	25 %	25 %	25 %	528835343
73	NC_021910	GAAG	2	8	32351	32358	50 %	0 %	50 %	0 %	528835344
74	NC_021910	ACTG	2	8	32563	32570	25 %	25 %	25 %	25 %	528835344
75	NC_021910	TTGG	2	8	32868	32875	0 %	50 %	50 %	0 %	528835344
76	NC_021910	GACT	2	8	33392	33399	25 %	25 %	25 %	25 %	528835345
77	NC_021910	CGTG	2	8	33825	33832	0 %	25 %	50 %	25 %	528835345
78	NC_021910	CGAC	2	8	33864	33871	25 %	0 %	25 %	50 %	528835345
79	NC_021910	AAGG	2	8	34241	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	528835346
80	NC_021910	CGAT	2	8	34459	34466	25 %	25 %	25 %	25 %	528835346
81	NC_021910	CGTT	2	8	35392	35399	0 %	50 %	25 %	25 %	528835346
82	NC_021910	GTCG	2	8	36105	36112	0 %	25 %	50 %	25 %	528835347
83	NC_021910	TCCT	2	8	36679	36686	0 %	50 %	0 %	50 %	528835348
84	NC_021910	CGGA	2	8	36878	36885	25 %	0 %	50 %	25 %	528835348
85	NC_021910	ACAG	2	8	36905	36912	50 %	0 %	25 %	25 %	528835348
86	NC_021910	GTTG	2	8	37147	37154	0 %	50 %	50 %	0 %	528835349
87	NC_021910	TTGA	2	8	37301	37308	25 %	50 %	25 %	0 %	528835349
88	NC_021910	GCAA	2	8	38285	38292	50 %	0 %	25 %	25 %	528835350
89	NC_021910	CACG	2	8	39253	39260	25 %	0 %	25 %	50 %	528835351
90	NC_021910	GGCG	2	8	39325	39332	0 %	0 %	75 %	25 %	528835351
91	NC_021910	TTTG	2	8	39608	39615	0 %	75 %	25 %	0 %	528835352
92	NC_021910	GCAC	2	8	39807	39814	25 %	0 %	25 %	50 %	528835352
93	NC_021910	TCCG	2	8	40392	40399	0 %	25 %	25 %	50 %	528835353
94	NC_021910	CGTC	2	8	40902	40909	0 %	25 %	25 %	50 %	528835353
95	NC_021910	AGCG	2	8	41287	41294	25 %	0 %	50 %	25 %	528835354
96	NC_021910	CAAG	2	8	41793	41800	50 %	0 %	25 %	25 %	528835354
97	NC_021910	TCGC	2	8	42855	42862	0 %	25 %	25 %	50 %	528835355
98	NC_021910	CGGT	2	8	43703	43710	0 %	25 %	50 %	25 %	528835356
99	NC_021910	TCCG	2	8	44075	44082	0 %	25 %	25 %	50 %	528835356
100	NC_021910	TTGA	2	8	44976	44983	25 %	50 %	25 %	0 %	528835357
101	NC_021910	TGGC	2	8	45137	45144	0 %	25 %	50 %	25 %	528835357
102	NC_021910	GCGG	2	8	45292	45299	0 %	0 %	75 %	25 %	528835357
103	NC_021910	TCCA	2	8	46381	46388	25 %	25 %	0 %	50 %	528835358
104	NC_021910	GGCT	2	8	47497	47504	0 %	25 %	50 %	25 %	528835361
105	NC_021910	TGGC	2	8	48018	48025	0 %	25 %	50 %	25 %	528835361
106	NC_021910	CACG	2	8	49370	49377	25 %	0 %	25 %	50 %	528835363
107	NC_021910	ACCA	2	8	49538	49545	50 %	0 %	0 %	50 %	528835364
108	NC_021910	CGAG	2	8	49574	49581	25 %	0 %	50 %	25 %	528835364
109	NC_021910	CAGG	2	8	49745	49752	25 %	0 %	50 %	25 %	528835364
110	NC_021910	GAGG	2	8	50079	50086	25 %	0 %	75 %	0 %	528835364
111	NC_021910	AGGA	2	8	50159	50166	50 %	0 %	50 %	0 %	528835364
112	NC_021910	TTCT	2	8	50596	50603	0 %	75 %	0 %	25 %	528835364
113	NC_021910	CGAT	2	8	51462	51469	25 %	25 %	25 %	25 %	528835365
114	NC_021910	GCGA	2	8	51602	51609	25 %	0 %	50 %	25 %	528835365
115	NC_021910	TTGC	2	8	52161	52168	0 %	50 %	25 %	25 %	528835365
116	NC_021910	GCGA	2	8	53180	53187	25 %	0 %	50 %	25 %	528835366
117	NC_021910	GCCG	2	8	54405	54412	0 %	0 %	50 %	50 %	528835367
118	NC_021910	CGTC	2	8	54455	54462	0 %	25 %	25 %	50 %	528835367
119	NC_021910	AGGA	2	8	55397	55404	50 %	0 %	50 %	0 %	528835368
120	NC_021910	GCCG	2	8	56866	56873	0 %	0 %	50 %	50 %	528835369
121	NC_021910	GAGG	2	8	57070	57077	25 %	0 %	75 %	0 %	528835369
122	NC_021910	GGAA	2	8	57356	57363	50 %	0 %	50 %	0 %	528835370
123	NC_021910	GGCA	2	8	57503	57510	25 %	0 %	50 %	25 %	528835370
124	NC_021910	ACAT	2	8	58130	58137	50 %	25 %	0 %	25 %	528835371
125	NC_021910	GCTG	2	8	58432	58439	0 %	25 %	50 %	25 %	528835371
126	NC_021910	CTGC	2	8	58780	58787	0 %	25 %	25 %	50 %	528835372
127	NC_021910	GTCC	2	8	59298	59305	0 %	25 %	25 %	50 %	528835372
128	NC_021910	AACC	2	8	59723	59730	50 %	0 %	0 %	50 %	528835372
129	NC_021910	CGTT	2	8	62414	62421	0 %	50 %	25 %	25 %	528835375
130	NC_021910	TGCG	2	8	62494	62501	0 %	25 %	50 %	25 %	528835376
131	NC_021910	GGAG	2	8	62926	62933	25 %	0 %	75 %	0 %	528835377
132	NC_021910	ATGG	2	8	63098	63105	25 %	25 %	50 %	0 %	528835377
133	NC_021910	TGAA	2	8	63201	63208	50 %	25 %	25 %	0 %	528835377
134	NC_021910	TTCA	2	8	63347	63354	25 %	50 %	0 %	25 %	528835377
135	NC_021910	CTTG	2	8	63746	63753	0 %	50 %	25 %	25 %	528835378
136	NC_021910	TCTT	2	8	64467	64474	0 %	75 %	0 %	25 %	528835379
137	NC_021910	CGGA	2	8	65463	65470	25 %	0 %	50 %	25 %	528835380
138	NC_021910	GCCG	2	8	66560	66567	0 %	0 %	50 %	50 %	528835381
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140	NC_021910	CATT	2	8	67592	67599	25 %	50 %	0 %	25 %	528835382
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