MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 3803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	TTG	2	6	265	270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021910	CGT	2	6	298	303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835311
3	NC_021910	GAG	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835311
4	NC_021910	GCG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835311
5	NC_021910	GCG	2	6	379	384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835311
6	NC_021910	GCT	2	6	401	406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835311
7	NC_021910	AAG	2	6	416	421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835311
8	NC_021910	AGA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835311
9	NC_021910	CCG	2	6	515	520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835311
10	NC_021910	ATT	2	6	604	609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021910	ACC	2	6	708	713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021910	TGG	2	6	831	836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021910	GAG	2	6	970	975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021910	GAC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021910	GGT	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021910	AGC	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021910	CTT	2	6	1245	1250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835312
18	NC_021910	GAC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835312
19	NC_021910	TGC	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835312
20	NC_021910	TGC	2	6	1657	1662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835312
21	NC_021910	CAC	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021910	GCG	2	6	1972	1977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835313
23	NC_021910	ACA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835313
24	NC_021910	TGG	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835313
25	NC_021910	GAT	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835313
26	NC_021910	CGA	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835313
27	NC_021910	ACA	2	6	2786	2791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835313
28	NC_021910	GTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835313
29	NC_021910	TGA	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835313
30	NC_021910	CAT	2	6	2915	2920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835313
31	NC_021910	GCC	2	6	2950	2955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021910	GAA	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021910	CGC	2	6	3105	3110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835314
34	NC_021910	GCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835314
35	NC_021910	CGG	2	6	3197	3202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835314
36	NC_021910	CAG	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
37	NC_021910	CTT	2	6	3259	3264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835315
38	NC_021910	CGC	2	6	3267	3272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
39	NC_021910	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
40	NC_021910	TCA	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835315
41	NC_021910	CGA	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
42	NC_021910	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
43	NC_021910	CGC	2	6	3816	3821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835315
44	NC_021910	CTC	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835315
45	NC_021910	ACG	3	9	3887	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
46	NC_021910	GTG	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835315
47	NC_021910	AGC	2	6	3923	3928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835315
48	NC_021910	ATC	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835315
49	NC_021910	GTT	2	6	4077	4082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835315
50	NC_021910	TGC	3	9	4223	4231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021910	GGA	2	6	4304	4309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021910	GAG	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021910	GCT	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835316
54	NC_021910	GAG	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835316
55	NC_021910	GCC	2	6	4783	4788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835316
56	NC_021910	CGG	2	6	4820	4825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
57	NC_021910	GCG	2	6	4831	4836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
58	NC_021910	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
59	NC_021910	CGA	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835316
60	NC_021910	GGT	2	6	4977	4982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835316
61	NC_021910	CAA	2	6	5040	5045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835316
62	NC_021910	GCC	2	6	5136	5141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835316
63	NC_021910	CCT	2	6	5240	5245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835316
64	NC_021910	CGG	2	6	5253	5258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
65	NC_021910	GGC	2	6	5259	5264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
66	NC_021910	AGC	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835316
67	NC_021910	TCG	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835316
68	NC_021910	CGG	2	6	5408	5413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835316
69	NC_021910	CGA	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835316
70	NC_021910	GCC	2	6	5551	5556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835316
71	NC_021910	ATC	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835316
72	NC_021910	GAT	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835316
73	NC_021910	CGC	3	9	5864	5872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
74	NC_021910	CGG	2	6	5898	5903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
75	NC_021910	GCC	2	6	5908	5913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
76	NC_021910	CGC	2	6	5971	5976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
77	NC_021910	CGA	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835317
78	NC_021910	GCT	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835317
79	NC_021910	GCC	2	6	6071	6076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
80	NC_021910	TGC	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835317
81	NC_021910	CGA	2	6	6145	6150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835317
82	NC_021910	CAA	2	6	6184	6189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528835317
83	NC_021910	GGC	2	6	6193	6198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
84	NC_021910	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835317
85	NC_021910	GGA	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835317
86	NC_021910	GGC	2	6	6238	6243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
87	NC_021910	CGC	2	6	6295	6300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
88	NC_021910	CGC	2	6	6309	6314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
89	NC_021910	TTC	2	6	6326	6331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835317
90	NC_021910	GCC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
91	NC_021910	GCC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
92	NC_021910	TGG	2	6	6389	6394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835317
93	NC_021910	GCT	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835317
94	NC_021910	GCG	2	6	6470	6475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835317
95	NC_021910	GCC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
96	NC_021910	TGG	3	9	6615	6623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835317
97	NC_021910	CGA	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835317
98	NC_021910	GCC	2	6	6692	6697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835317
99	NC_021910	TGA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835317
100	NC_021910	ACG	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
101	NC_021910	GCC	2	6	6894	6899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835318
102	NC_021910	TGC	2	6	6948	6953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
103	NC_021910	TCG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
104	NC_021910	GCA	2	6	7004	7009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
105	NC_021910	CGA	2	6	7023	7028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
106	NC_021910	GGA	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835318
107	NC_021910	TCG	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
108	NC_021910	CGG	2	6	7077	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835318
109	NC_021910	GCA	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
110	NC_021910	GCC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835318
111	NC_021910	GGC	2	6	7188	7193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835318
112	NC_021910	AGG	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835318
113	NC_021910	GAC	2	6	7344	7349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835318
114	NC_021910	GCT	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
115	NC_021910	CTG	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835318
116	NC_021910	GGA	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835318
117	NC_021910	CTT	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835319
118	NC_021910	TCG	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835319
119	NC_021910	TCA	2	6	7741	7746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835319
120	NC_021910	CGG	2	6	7781	7786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835320
121	NC_021910	CAT	2	6	7821	7826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835320
122	NC_021910	TCG	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835320
123	NC_021910	GAT	2	6	8098	8103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835320
124	NC_021910	CGG	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835320
125	NC_021910	GCA	2	6	8154	8159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835320
126	NC_021910	GTG	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528835320
127	NC_021910	TCG	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835320
128	NC_021910	GGA	2	6	8591	8596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021910	GAA	2	6	8727	8732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835321
130	NC_021910	GAG	2	6	8897	8902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835321
131	NC_021910	TTG	2	6	8976	8981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835321
132	NC_021910	CAG	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835321
133	NC_021910	ATT	2	6	9212	9217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528835321
134	NC_021910	GAT	2	6	9400	9405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835321
135	NC_021910	TGC	2	6	9411	9416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835321
136	NC_021910	AGC	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835321
137	NC_021910	CTC	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528835321
138	NC_021910	GGA	2	6	10082	10087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021910	TGC	2	6	10090	10095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021910	TTG	2	6	10250	10255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835322
141	NC_021910	GGA	2	6	10336	10341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021910	GAT	2	6	10428	10433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835323
143	NC_021910	CTT	2	6	10611	10616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528835323
144	NC_021910	TCG	2	6	10629	10634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
145	NC_021910	AGT	2	6	10715	10720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835323
146	NC_021910	ATC	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528835323
147	NC_021910	TCG	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
148	NC_021910	GTC	2	6	11139	11144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
149	NC_021910	GTC	2	6	11172	11177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835323
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153	NC_021910	CGT	2	6	11455	11460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835324
154	NC_021910	GTC	2	6	11469	11474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835324
155	NC_021910	TGT	2	6	11536	11541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528835324
156	NC_021910	TGA	2	6	11545	11550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835324
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159	NC_021910	CAG	2	6	11648	11653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835324
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161	NC_021910	CAG	2	6	11801	11806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835324
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165	NC_021910	GAT	2	6	11882	11887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835324
166	NC_021910	GAC	2	6	11903	11908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835324
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185	NC_021910	GAA	2	6	13042	13047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835325
186	NC_021910	CGC	3	9	13141	13149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528835325
187	NC_021910	TCC	2	6	13205	13210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_021910	GAA	2	6	13395	13400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528835326
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227	NC_021910	CGA	2	6	16490	16495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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238	NC_021910	GGA	2	6	16917	16922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021910	CGA	2	6	16981	16986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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243	NC_021910	GGC	2	6	17278	17283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835330
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248	NC_021910	TGA	2	6	17512	17517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_021910	TGA	2	6	17575	17580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_021910	CAT	2	6	17828	17833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_021910	CCG	2	6	17872	17877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_021910	GAT	2	6	17909	17914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021910	CAG	2	6	17943	17948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_021910	CGT	2	6	18007	18012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_021910	CAG	2	6	18047	18052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_021910	ATG	2	6	18069	18074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021910	GAC	2	6	18095	18100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_021910	CGG	2	6	18109	18114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_021910	GCG	2	6	18138	18143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_021910	CCG	2	6	18146	18151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_021910	CCA	2	6	18175	18180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_021910	CAA	2	6	18328	18333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_021910	GGA	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021910	TCC	2	6	18443	18448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_021910	CTT	2	6	18451	18456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_021910	GCA	2	6	18497	18502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_021910	TCC	2	6	18505	18510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_021910	GGC	2	6	18561	18566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_021910	GAT	2	6	18610	18615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021910	GCG	2	6	18646	18651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_021910	GCG	2	6	18821	18826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835331
272	NC_021910	TGC	2	6	18857	18862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835331
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279	NC_021910	GAT	2	6	19134	19139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528835331
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283	NC_021910	GCG	2	6	19266	19271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835331
284	NC_021910	GCC	2	6	19357	19362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_021910	GCC	2	6	19369	19374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_021910	CTT	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_021910	TCT	2	6	19412	19417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_021910	ACG	2	6	19622	19627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528835332
289	NC_021910	TCG	2	6	19657	19662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835332
290	NC_021910	TCT	2	6	19975	19980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_021910	TGA	2	6	19987	19992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021910	GCC	2	6	19997	20002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_021910	CGG	2	6	20034	20039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528835334
294	NC_021910	CTG	2	6	20109	20114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835334
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301	NC_021910	GAG	2	6	21164	21169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835335
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332	NC_021910	GGA	2	6	23944	23949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528835337
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500	NC_021910	GCT	2	6	36440	36445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528835348

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